RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487577.5

TYMP-208, Transcript of thymidine phosphorylase, human

TSL 1 (best)

Gene TYMP, Length 1,751 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TYMP-208	ENST00000487577	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		32.34	■■■□□ 2.77
TYMP-208	ENST00000487577	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
TYMP-208	ENST00000487577	WDR63	Q8IWG1	891 aa		32.32	■■■□□ 2.77
TYMP-208	ENST00000487577	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.77
TYMP-208	ENST00000487577	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TYMP-208	ENST00000487577	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
TYMP-208	ENST00000487577	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TYMP-208	ENST00000487577	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TYMP-208	ENST00000487577	RIPK4	P57078	832 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TYMP-208	ENST00000487577	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TYMP-208	ENST00000487577	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
TYMP-208	ENST00000487577	HOXC9	P31274	260 aa		32.23	■■■□□ 2.75
TYMP-208	ENST00000487577	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		32.23	■■■□□ 2.75
TYMP-208	ENST00000487577	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		32.23	■■■□□ 2.75
TYMP-208	ENST00000487577	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		32.22	■■■□□ 2.75
TYMP-208	ENST00000487577	NFAT5	O94916	1531 aa		32.22	■■■□□ 2.75
TYMP-208	ENST00000487577	LTN1	O94822	1766 aa		32.22	■■■□□ 2.75
TYMP-208	ENST00000487577	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		32.22	■■■□□ 2.75
TYMP-208	ENST00000487577	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		32.22	■■■□□ 2.75
TYMP-208	ENST00000487577	RTL1	A6NKG5	1358 aa		32.21	■■■□□ 2.75
TYMP-208	ENST00000487577	NFE2L2	Q16236	605 aa		32.21	■■■□□ 2.75
TYMP-208	ENST00000487577	ARHGEF10	O15013	1369 aa		32.2	■■■□□ 2.74
TYMP-208	ENST00000487577	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TYMP-208	ENST00000487577	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
TYMP-208	ENST00000487577	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		32.18	■■■□□ 2.74
TYMP-208	ENST00000487577	SLIT3	O75094	1523 aa		32.18	■■■□□ 2.74
TYMP-208	ENST00000487577	ALS2	Q96Q42	1657 aa		32.17	■■■□□ 2.74
TYMP-208	ENST00000487577	GC	P02774	474 aa		32.16	■■■□□ 2.74
TYMP-208	ENST00000487577	USP19	O94966	1318 aa		32.15	■■■□□ 2.74
TYMP-208	ENST00000487577	PLEKHG5	O94827	1062 aa		32.15	■■■□□ 2.74
TYMP-208	ENST00000487577	IP6K1	Q92551	441 aa		32.14	■■■□□ 2.74
TYMP-208	ENST00000487577	SLAIN2	Q9P270	581 aa		32.14	■■■□□ 2.74
TYMP-208	ENST00000487577	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		32.14	■■■□□ 2.74
TYMP-208	ENST00000487577	IL16	Q14005	1332 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TYMP-208	ENST00000487577	BRINP3	Q76B58	766 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TYMP-208	ENST00000487577	EYA1	Q99502	592 aa		32.12	■■■□□ 2.73
TYMP-208	ENST00000487577	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		32.11	■■■□□ 2.73
TYMP-208	ENST00000487577	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
TYMP-208	ENST00000487577	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		32.1	■■■□□ 2.73
TYMP-208	ENST00000487577	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
TYMP-208	ENST00000487577	PXDN	Q92626	1479 aa		32.09	■■■□□ 2.73
TYMP-208	ENST00000487577	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		32.09	■■■□□ 2.73
TYMP-208	ENST00000487577	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		32.09	■■■□□ 2.73
TYMP-208	ENST00000487577	KDR	P35968	1356 aa		32.08	■■■□□ 2.73
TYMP-208	ENST00000487577	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		32.07	■■■□□ 2.72
TYMP-208	ENST00000487577	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		32.07	■■■□□ 2.72
TYMP-208	ENST00000487577	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
TYMP-208	ENST00000487577	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		32.05	■■■□□ 2.72
TYMP-208	ENST00000487577	PLIN1	O60240	522 aa		32.04	■■■□□ 2.72
TYMP-208	ENST00000487577	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
TYMP-208	ENST00000487577	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
TYMP-208	ENST00000487577	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		32.04	■■■□□ 2.72
TYMP-208	ENST00000487577	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
TYMP-208	ENST00000487577	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
TYMP-208	ENST00000487577	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	31.97	■■■□□ 2.71
TYMP-208	ENST00000487577	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	31.97	■■■□□ 2.71
TYMP-208	ENST00000487577	BCAR3	O75815	825 aa		31.96	■■■□□ 2.71
TYMP-208	ENST00000487577	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
TYMP-208	ENST00000487577	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
TYMP-208	ENST00000487577	FAM83G	A6ND36	823 aa		31.95	■■■□□ 2.71
TYMP-208	ENST00000487577	GNAI1	P63096	354 aa		31.95	■■■□□ 2.71
TYMP-208	ENST00000487577	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	31.95	■■■□□ 2.71
TYMP-208	ENST00000487577	IFT57	Q9NWB7	429 aa		31.95	■■■□□ 2.71
TYMP-208	ENST00000487577	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
TYMP-208	ENST00000487577	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		31.94	■■■□□ 2.7
TYMP-208	ENST00000487577	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
TYMP-208	ENST00000487577	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		31.94	■■■□□ 2.7
TYMP-208	ENST00000487577	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		31.94	■■■□□ 2.7
TYMP-208	ENST00000487577	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
TYMP-208	ENST00000487577	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		31.93	■■■□□ 2.7
TYMP-208	ENST00000487577	NBPF4	Q96M43	638 aa		31.93	■■■□□ 2.7
TYMP-208	ENST00000487577	DCTN1	Q14203	1278 aa		31.92	■■■□□ 2.7
TYMP-208	ENST00000487577	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		31.92	■■■□□ 2.7
TYMP-208	ENST00000487577	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		31.92	■■■□□ 2.7
TYMP-208	ENST00000487577	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		31.9	■■■□□ 2.7
TYMP-208	ENST00000487577	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		31.9	■■■□□ 2.7
TYMP-208	ENST00000487577	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		31.89	■■■□□ 2.7
TYMP-208	ENST00000487577	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.7
TYMP-208	ENST00000487577	CFAP44	Q96MT7	982 aa		31.89	■■■□□ 2.7
TYMP-208	ENST00000487577	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		31.89	■■■□□ 2.7
TYMP-208	ENST00000487577	ZNF853	P0CG23	659 aa		31.89	■■■□□ 2.69
TYMP-208	ENST00000487577	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.69
TYMP-208	ENST00000487577	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		31.88	■■■□□ 2.69
TYMP-208	ENST00000487577	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		31.88	■■■□□ 2.69
TYMP-208	ENST00000487577	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		31.88	■■■□□ 2.69
TYMP-208	ENST00000487577	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
TYMP-208	ENST00000487577	MCM10	Q7L590	875 aa		31.87	■■■□□ 2.69
TYMP-208	ENST00000487577	CRBN	Q96SW2	442 aa		31.87	■■■□□ 2.69
TYMP-208	ENST00000487577	RGPD5	Q99666	1765 aa		31.87	■■■□□ 2.69
TYMP-208	ENST00000487577	MBIP	Q9NS73	344 aa		31.85	■■■□□ 2.69
TYMP-208	ENST00000487577	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		31.84	■■■□□ 2.69
TYMP-208	ENST00000487577	ERBB3	P21860	1342 aa		31.83	■■■□□ 2.69
TYMP-208	ENST00000487577	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
TYMP-208	ENST00000487577	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		31.82	■■■□□ 2.68
TYMP-208	ENST00000487577	CPD	O75976	1380 aa		31.82	■■■□□ 2.68
TYMP-208	ENST00000487577	ABCC6	O95255	1503 aa		31.82	■■■□□ 2.68
TYMP-208	ENST00000487577	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
TYMP-208	ENST00000487577	COL18A1	P39060	1754 aa		31.81	■■■□□ 2.68
TYMP-208	ENST00000487577	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		31.81	■■■□□ 2.68
TYMP-208	ENST00000487577	KIAA0232	Q92628	1395 aa		31.8	■■■□□ 2.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms