RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 USP31Q70CQ4 1352 aa13.66□□□□□ -0.22
GTPBP1-211ENST00000487538 RGS12O14924 1447 aa13.65□□□□□ -0.22
GTPBP1-211ENST00000487538 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
GTPBP1-211ENST00000487538 PLCH1Q4KWH8 1693 aa13.65□□□□□ -0.22
GTPBP1-211ENST00000487538 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 RCAN3Q9UKA8 241 aa13.64□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 PHF8Q9UPP1 1060 aa13.64□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa13.64□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 EP400Q96L91 3159 aa13.64□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa13.64□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 PIK3C2AO00443 1686 aa13.63□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 FBLN1P23142 703 aa13.63□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 TCP11L2Q8N4U5 519 aa13.63□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 C8orf37Q96NL8 207 aa13.63□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 USP54Q70EL1 1684 aa13.63□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 SBNO1A3KN83 1393 aa13.62□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 SLFN5Q08AF3 891 aa13.62□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC27Q2M243 656 aa13.62□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 ATRNO75882 1429 aa13.62□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa13.62□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 BCL9LQ86UU0 1499 aa13.61□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 SLIT2O94813 1529 aa13.61□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 E9PSI1 815 aa13.61□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 ADAMTS2O95450 1211 aa13.61□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 DUSP27Q5VZP5 1158 aa13.61□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 WWC1Q8IX03 1113 aa13.61□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 PLEKHF1Q96S99 279 aa13.61□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 NRAPQ86VF7 1730 aa13.61□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 NWD2Q9ULI1 1742 aa13.61□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 FCHSD2O94868 740 aa13.6□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 IL13P35225 146 aa13.6□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 GLI3P10071 1580 aa13.59□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 RRP1P56182 461 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 KRT28Q7Z3Y7 464 aa13.59□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
GTPBP1-211ENST00000487538 NEUROD2Q15784 382 aa13.58□□□□□ -0.24
GTPBP1-211ENST00000487538 WDR63Q8IWG1 891 aa13.58□□□□□ -0.24
GTPBP1-211ENST00000487538 RSPH6AQ9H0K4 717 aa13.58□□□□□ -0.24
GTPBP1-211ENST00000487538 PEAK1Q9H792 1746 aa13.58□□□□□ -0.24
GTPBP1-211ENST00000487538 ARHGEF10O15013 1369 aa13.58□□□□□ -0.24
GTPBP1-211ENST00000487538 NEFMP07197 916 aa13.57□□□□□ -0.24
GTPBP1-211ENST00000487538 NLRP6P59044 892 aa13.57□□□□□ -0.24
GTPBP1-211ENST00000487538 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
GTPBP1-211ENST00000487538 RXRBP28702 533 aa13.56□□□□□ -0.24
GTPBP1-211ENST00000487538 PRKAR2BP31323 418 aa13.56□□□□□ -0.24
GTPBP1-211ENST00000487538 TMPOP42166 694 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
GTPBP1-211ENST00000487538 PSME1Q06323 249 aa13.56□□□□□ -0.24
GTPBP1-211ENST00000487538 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
GTPBP1-211ENST00000487538 ABTB2Q8N961 1025 aa13.56□□□□□ -0.24
GTPBP1-211ENST00000487538 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
GTPBP1-211ENST00000487538 PPP4R2Q9NY27 417 aa13.56□□□□□ -0.24
GTPBP1-211ENST00000487538 MAP3K19Q56UN5 1328 aa13.56□□□□□ -0.24
GTPBP1-211ENST00000487538 FLT4P35916 1363 aa13.56□□□□□ -0.24
GTPBP1-211ENST00000487538 NGLY1Q96IV0 654 aa13.55□□□□□ -0.24
GTPBP1-211ENST00000487538 USP21Q9UK80 565 aa13.55□□□□□ -0.24
GTPBP1-211ENST00000487538 KIF24Q5T7B8 1368 aa13.55□□□□□ -0.24
GTPBP1-211ENST00000487538 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
GTPBP1-211ENST00000487538 SOX12O15370 315 aa13.54□□□□□ -0.24
GTPBP1-211ENST00000487538 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
GTPBP1-211ENST00000487538 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
GTPBP1-211ENST00000487538 HMOX1P09601 288 aa13.53□□□□□ -0.24
GTPBP1-211ENST00000487538 MYH16Q9H6N6 1097 aa13.53□□□□□ -0.24
GTPBP1-211ENST00000487538 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
GTPBP1-211ENST00000487538 RGPD1P0DJD0 1748 aa13.53□□□□□ -0.24
GTPBP1-211ENST00000487538 AMPHP49418 695 aa13.52□□□□□ -0.25
GTPBP1-211ENST00000487538 RIPK4P57078 832 aa13.52□□□□□ -0.25
GTPBP1-211ENST00000487538 NFE2L2Q16236 605 aa13.52□□□□□ -0.25
GTPBP1-211ENST00000487538 NUTM2GQ5VZR2 741 aa13.52□□□□□ -0.25
GTPBP1-211ENST00000487538 CABLES1Q8TDN4 633 aa13.52□□□□□ -0.25
GTPBP1-211ENST00000487538 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
GTPBP1-211ENST00000487538 TRIM35Q9UPQ4 493 aa13.52□□□□□ -0.25
GTPBP1-211ENST00000487538 IL16Q14005 1332 aa13.52□□□□□ -0.25
GTPBP1-211ENST00000487538 RTL1A6NKG5 1358 aa13.52□□□□□ -0.25
GTPBP1-211ENST00000487538 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa13.51□□□□□ -0.25
GTPBP1-211ENST00000487538 NFAT5O94916 1531 aa13.5□□□□□ -0.25
GTPBP1-211ENST00000487538 LMO7Q8WWI1 1683 aa13.5□□□□□ -0.25
GTPBP1-211ENST00000487538 BRWD3Q6RI45 1802 aa13.49□□□□□ -0.25
GTPBP1-211ENST00000487538 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
GTPBP1-211ENST00000487538 KCNH5Q8NCM2 988 aa13.49□□□□□ -0.25
GTPBP1-211ENST00000487538 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP13.49□□□□□ -0.25
GTPBP1-211ENST00000487538 PHACTR3Q96KR7 559 aa13.49□□□□□ -0.25
GTPBP1-211ENST00000487538 SLIT3O75094 1523 aa13.49□□□□□ -0.25
GTPBP1-211ENST00000487538 HOXC9P31274 260 aa13.48□□□□□ -0.25
GTPBP1-211ENST00000487538 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
GTPBP1-211ENST00000487538 LMOD3Q0VAK6 560 aa13.48□□□□□ -0.25
GTPBP1-211ENST00000487538 SULT6B1Q6IMI4 303 aa13.48□□□□□ -0.25
GTPBP1-211ENST00000487538 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa13.47□□□□□ -0.25
GTPBP1-211ENST00000487538 AEBP1Q8IUX7 1158 aa13.47□□□□□ -0.25
GTPBP1-211ENST00000487538 UNC5CLQ8IV45 518 aa13.47□□□□□ -0.25
GTPBP1-211ENST00000487538 USP19O94966 1318 aa13.46□□□□□ -0.25
GTPBP1-211ENST00000487538 IGSF1Q8N6C5 1336 aa13.46□□□□□ -0.25
GTPBP1-211ENST00000487538 FANCIQ9NVI1 1328 aa13.46□□□□□ -0.25
GTPBP1-211ENST00000487538 LTN1O94822 1766 aa13.46□□□□□ -0.25
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