RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482333.5

USP13-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

TSL 5

Gene USP13, Length 1,966 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-202ENST00000482333 FANCIQ9NVI1 1328 aa28.28■■■□□ 2.12
USP13-202ENST00000482333 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.28■■■□□ 2.12
USP13-202ENST00000482333 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
USP13-202ENST00000482333 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.27■■■□□ 2.12
USP13-202ENST00000482333 SBNO1A3KN83 1393 aa28.27■■■□□ 2.12
USP13-202ENST00000482333 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.26■■■□□ 2.11
USP13-202ENST00000482333 ORAI2Q96SN7 254 aa28.26■■■□□ 2.11
USP13-202ENST00000482333 FLT4P35916 1363 aa28.25■■■□□ 2.11
USP13-202ENST00000482333 RARSP54136 660 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
USP13-202ENST00000482333 SULT6B1Q6IMI4 303 aa28.24■■■□□ 2.11
USP13-202ENST00000482333 PSME1Q06323 249 aa28.23■■■□□ 2.11
USP13-202ENST00000482333 DLG5Q8TDM6 1919 aa28.23■■■□□ 2.11
USP13-202ENST00000482333 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.21■■■□□ 2.11
USP13-202ENST00000482333 AMPHP49418 695 aa28.2■■■□□ 2.11
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USP13-202ENST00000482333 TMEM94Q12767 1356 aa28.18■■■□□ 2.1
USP13-202ENST00000482333 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.18■■■□□ 2.1
USP13-202ENST00000482333 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.18■■■□□ 2.1
USP13-202ENST00000482333 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
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USP13-202ENST00000482333 ARHGEF10O15013 1369 aa28.17■■■□□ 2.1
USP13-202ENST00000482333 KIF24Q5T7B8 1368 aa28.16■■■□□ 2.1
USP13-202ENST00000482333 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
USP13-202ENST00000482333 HOXC9P31274 260 aa28.15■■■□□ 2.1
USP13-202ENST00000482333 BCL2L13Q9BXK5 485 aa28.15■■■□□ 2.1
USP13-202ENST00000482333 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
USP13-202ENST00000482333 NFAT5O94916 1531 aa28.14■■■□□ 2.09
USP13-202ENST00000482333 KIF1AQ12756 1690 aa28.13■■■□□ 2.09
USP13-202ENST00000482333 PDE3AQ14432 1141 aa28.13■■■□□ 2.09
USP13-202ENST00000482333 LTN1O94822 1766 aa28.12■■■□□ 2.09
USP13-202ENST00000482333 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
USP13-202ENST00000482333 EYA1Q99502 592 aa28.12■■■□□ 2.09
USP13-202ENST00000482333 STRCQ7RTU9 1775 aa28.12■■■□□ 2.09
USP13-202ENST00000482333 CANXP27824 592 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
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USP13-202ENST00000482333 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.11■■■□□ 2.09
USP13-202ENST00000482333 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.11■■■□□ 2.09
USP13-202ENST00000482333 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
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USP13-202ENST00000482333 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
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USP13-202ENST00000482333 ZNF853P0CG23 659 aa28.08■■■□□ 2.09
USP13-202ENST00000482333 IFT57Q9NWB7 429 aa28.08■■■□□ 2.09
USP13-202ENST00000482333 RTL1A6NKG5 1358 aa28.08■■■□□ 2.09
USP13-202ENST00000482333 DCTN1Q14203 1278 aa28.07■■■□□ 2.08
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USP13-202ENST00000482333 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.06■■■□□ 2.08
USP13-202ENST00000482333 TNNQ9UQP3 1299 aa28.06■■■□□ 2.08
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USP13-202ENST00000482333 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
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USP13-202ENST00000482333 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
USP13-202ENST00000482333 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28■■■□□ 2.07
USP13-202ENST00000482333 KDM2BQ8NHM5 1336 aa28■■■□□ 2.07
USP13-202ENST00000482333 GCP02774 474 aa27.99■■■□□ 2.07
USP13-202ENST00000482333 MCM10Q7L590 875 aa27.99■■■□□ 2.07
USP13-202ENST00000482333 CADPS2Q86UW7 1296 aa27.99■■■□□ 2.07
USP13-202ENST00000482333 USP19O94966 1318 aa27.99■■■□□ 2.07
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USP13-202ENST00000482333 ALDH1L2Q3SY69 923 aa27.96■■■□□ 2.07
USP13-202ENST00000482333 ARHGEF25Q86VW2 580 aa27.95■■■□□ 2.07
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USP13-202ENST00000482333 C8orf58Q8NAV2 365 aa27.93■■■□□ 2.06
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USP13-202ENST00000482333 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
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USP13-202ENST00000482333 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
USP13-202ENST00000482333 CHL1O00533 1208 aa27.91■■■□□ 2.06
USP13-202ENST00000482333 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
USP13-202ENST00000482333 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
USP13-202ENST00000482333 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
USP13-202ENST00000482333 NBPF6Q5VWK0 638 aa27.91■■■□□ 2.06
USP13-202ENST00000482333 NBPF4Q96M43 638 aa27.91■■■□□ 2.06
USP13-202ENST00000482333 RGPD2P0DJD1 1756 aa27.91■■■□□ 2.06
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