RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 XBP1P17861 261 aa20.47■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EPS15P42566 896 aa20.47■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ABCC5O15440 1437 aa20.46■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RDXP35241 583 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMARCE1Q969G3 411 aa20.46■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.46■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FBXO3Q9UK99 471 aa20.46■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDK19Q9BWU1 502 aa20.45■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FYB1O15117 783 aa20.45■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SKIDA1Q1XH10 827 aa20.45■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FILIP1LQ4L180 1135 aa20.45■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.45■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.45■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.45■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.44■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC112Q8NEF3 446 aa20.44■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HIP1O00291 1037 aa20.44■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC191Q8NCU4 936 aa20.44■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TNMDQ9H2S6 317 aa20.43■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STK38Q15208 465 aa20.43■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MCM4P33991 863 aa20.43■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa20.43■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FANCAO15360 1455 aa20.43■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ESPNB1AK53 854 aa20.42■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATP2B1P20020 1258 aa20.42■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa20.42■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRKAR2BP31323 418 aa20.42■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.42■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GNAI2P04899 355 aa20.41■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SERPINC1P01008 464 aa20.41■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ODF2Q5BJF6 829 aa20.41■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CABP1Q9NZU7 370 aa20.41■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.4■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RRP9O43818 475 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TSPYL1Q9H0U9 437 aa20.4■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa20.4■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STK3Q13188 491 aa20.4■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MYO6Q9UM54 1294 aa20.39■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MSH5O43196 834 aa20.38■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SART3Q15020 963 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CHD1LQ86WJ1 897 aa20.38■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MTMR7Q9Y216 660 aa20.38■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAP3K1Q13233 1512 aa20.37■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.37■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRT85P78386 507 aa20.36■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa20.36■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.36■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.36■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC184Q52MB2 194 aa20.36■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.35■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.35■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ME1P48163 572 aa20.35■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANKRD1Q15327 319 aa20.35■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC4A2P04920 1241 aa20.34■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.34■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.34■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPFIBP1Q86W92 1011 aa20.34■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WDR63Q8IWG1 891 aa20.33■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ASXL2Q76L83 1435 aa20.33■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TXLNAP40222 546 aa20.33■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 JMYQ8N9B5 988 aa20.33■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATP10BO94823 1461 aa20.32■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.32■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NCOA1Q15788 1441 aa20.32■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZSCAN30Q86W11 494 aa20.31■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCT4P50991 539 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPATA32Q96LK8 384 aa20.31■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ERLIN1O75477 346 aa20.31■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa20.31■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DACH1Q9UI36 760 aa20.31■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STRN4Q9NRL3 753 aa20.3■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CBFA2T2O43439 604 aa20.3■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NUP62CLQ9H1M0 184 aa20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms