RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468284.1

CKAP2-205, Transcript of cytoskeleton associated protein 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene CKAP2, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2-205ENST00000468284 PHOX2BQ99453 314 aa14.9□□□□□ -0.02
CKAP2-205ENST00000468284 CLIP1P30622 1438 aa14.9□□□□□ -0.02
CKAP2-205ENST00000468284 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CKAP2-205ENST00000468284 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CKAP2-205ENST00000468284 STRCP1A6NGW2 1772 aa14.88□□□□□ -0.03
CKAP2-205ENST00000468284 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
CKAP2-205ENST00000468284 SPRYD7Q5W111 196 aa14.88□□□□□ -0.03
CKAP2-205ENST00000468284 PLXNC1O60486 1568 aa14.88□□□□□ -0.03
CKAP2-205ENST00000468284 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
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CKAP2-205ENST00000468284 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.87□□□□□ -0.03
CKAP2-205ENST00000468284 SYCP2Q9BX26 1530 aa14.87□□□□□ -0.03
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CKAP2-205ENST00000468284 FUT2Q10981 343 aa14.86□□□□□ -0.03
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CKAP2-205ENST00000468284 MORN1Q5T089 497 aa14.84□□□□□ -0.03
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CKAP2-205ENST00000468284 ATP6V1AP38606 617 aa14.83□□□□□ -0.04
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CKAP2-205ENST00000468284 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CKAP2-205ENST00000468284 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
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CKAP2-205ENST00000468284 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CKAP2-205ENST00000468284 ZNF697Q5TEC3 545 aa14.81□□□□□ -0.04
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CKAP2-205ENST00000468284 PLA2G2CQ5R387 149 aa14.8□□□□□ -0.04
CKAP2-205ENST00000468284 MED14O60244 1454 aa14.79□□□□□ -0.04
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CKAP2-205ENST00000468284 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa14.78□□□□□ -0.04
CKAP2-205ENST00000468284 IQGAP1P46940 1657 aa14.77□□□□□ -0.04
CKAP2-205ENST00000468284 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
CKAP2-205ENST00000468284 EEA1Q15075 1411 aa14.77□□□□□ -0.04
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CKAP2-205ENST00000468284 FAM187AA6NFU0 413 aa14.66□□□□□ -0.06
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CKAP2-205ENST00000468284 ZNF787Q6DD87 383 aa14.66□□□□□ -0.06
CKAP2-205ENST00000468284 MSS51Q4VC12 460 aa14.65□□□□□ -0.06
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CKAP2-205ENST00000468284 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.64□□□□□ -0.07
CKAP2-205ENST00000468284 MBD5Q9P267 1494 aa14.64□□□□□ -0.07
CKAP2-205ENST00000468284 MYT1Q01538 1121 aa14.64□□□□□ -0.07
CKAP2-205ENST00000468284 CCDC102AQ96A19 550 aa14.64□□□□□ -0.07
CKAP2-205ENST00000468284 TRIM52Q96A61 297 aa14.64□□□□□ -0.07
CKAP2-205ENST00000468284 LTKP29376 864 aa14.63□□□□□ -0.07
CKAP2-205ENST00000468284 FOXC1Q12948 553 aa14.63□□□□□ -0.07
CKAP2-205ENST00000468284 Q3C1V9 767 aa14.63□□□□□ -0.07
CKAP2-205ENST00000468284 KDM4AO75164 1064 aa14.62□□□□□ -0.07
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