RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465576.1

CLRN1-AS1-201, CLRN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN1-AS1, Length 2,045 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ALS2Q96Q42 1657 aa8.53□□□□□ -1.04
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TOM1O60784 492 aa8.53□□□□□ -1.04
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GCP02774 474 aa8.53□□□□□ -1.04
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PIP4K2BP78356 416 aa8.53□□□□□ -1.04
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KCNH5Q8NCM2 988 aa8.53□□□□□ -1.04
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa8.52□□□□□ -1.04
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 USP54Q70EL1 1684 aa8.52□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa8.52□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa8.52□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CABLES1Q8TDN4 633 aa8.52□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 UBAP1LF5GYI3 381 aa8.51□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 USP19O94966 1318 aa8.51□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ARHGEF10O15013 1369 aa8.51□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 INSRP06213 1382 aa8.51□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FLT4P35916 1363 aa8.51□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PEAK1Q9H792 1746 aa8.51□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NHSL1Q5SYE7 1610 aa8.5□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NFAT5O94916 1531 aa8.5□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZBED9Q6R2W3 1325 aa8.5□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HOXC9P31274 260 aa8.5□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 IL13P35225 146 aa8.5□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LTN1O94822 1766 aa8.5□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SLIT3O75094 1523 aa8.5□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 APAF1O14727 1248 aa8.49□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HMOX1P09601 288 aa8.49□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CERKQ8TCT0 537 aa8.49□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ARHGEF25Q86VW2 580 aa8.49□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RUNDC1Q96C34 613 aa8.49□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KIF24Q5T7B8 1368 aa8.48□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NEUROD2Q15784 382 aa8.48□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 IP6K1Q92551 441 aa8.48□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RTL1A6NKG5 1358 aa8.48□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa8.48□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FCHSD2O94868 740 aa8.47□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NEFMP07197 916 aa8.47□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PRKAR2BP31323 418 aa8.47□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SULT6B1Q6IMI4 303 aa8.47□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TCP11L2Q8N4U5 519 aa8.47□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RSPH6AQ9H0K4 717 aa8.47□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CHRNA2Q15822 529 aa8.46□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 AEBP1Q8IUX7 1158 aa8.46□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 AXIN2Q9Y2T1 843 aa8.46□□□□□ -1.05
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PHLPP1O60346 1717 aa8.46□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KIAA0232Q92628 1395 aa8.46□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 IQSEC2Q5JU85 1478 aa8.46□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PLEKHF1Q96S99 279 aa8.46□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 EYA1Q99502 592 aa8.46□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa8.45□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PRDM11Q9NQV5 511 aa8.45□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 USHBP1Q8N6Y0 703 aa8.44□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ANKRD24Q8TF21 1146 aa8.44□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PHACTR3Q96KR7 559 aa8.44□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RGPD5Q99666 1765 aa8.44□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CPDO75976 1380 aa8.44□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 IGSF1Q8N6C5 1336 aa8.43□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RGPD1P0DJD0 1748 aa8.43□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ABCA3Q99758 1704 aa8.43□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.43□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TMPOP42166 694 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NBPF6Q5VWK0 638 aa8.43□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NBPF4Q96M43 638 aa8.43□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SPDYE2BA6NHP3 402 aa8.42□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SPDYE6P0CI01 402 aa8.42□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RIPK4P57078 832 aa8.42□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SPDYE2Q495Y8 402 aa8.42□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 WWC1Q8IX03 1113 aa8.42□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NGEFQ8N5V2 710 aa8.42□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CDCA7LQ96GN5 454 aa8.42□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ERBB3P21860 1342 aa8.42□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NLRP2Q9NX02 1062 aa8.42□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RGPD2P0DJD1 1756 aa8.42□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KDRP35968 1356 aa8.41□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 COL18A1P39060 1754 aa8.41□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FAM83GA6ND36 823 aa8.41□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GOLGA2Q08379 1002 aa8.41□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PDE3BQ13370 1112 aa8.41□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NFE2L2Q16236 605 aa8.41□□□□□ -1.06
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZNF521Q96K83 1311 aa8.41□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms