RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 RUNDC1Q96C34 613 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 PLEKHF1Q96S99 279 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 GGNBP2Q9H3C7 697 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 DLG5Q8TDM6 1919 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 POTEJP0CG39 1038 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 WWC1Q8IX03 1113 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC146Q8IYE0 955 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC61Q9Y6R9 512 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 USP31Q70CQ4 1352 aa7.46□□□□□ -1.21
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PTPRC-210ENST00000462363 METRNQ9UJH8 293 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-210ENST00000462363 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-210ENST00000462363 EID1Q9Y6B2 187 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-210ENST00000462363 E9PSI1 815 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-210ENST00000462363 WDR63Q8IWG1 891 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-210ENST00000462363 TCP11L2Q8N4U5 519 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRC-210ENST00000462363 PROM2Q8N271 834 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-210ENST00000462363 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-210ENST00000462363 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa7.44□□□□□ -1.22
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PTPRC-210ENST00000462363 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-210ENST00000462363 EXOC6Q8TAG9 804 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-210ENST00000462363 SLC39A7Q92504 469 aa7.43□□□□□ -1.22
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PTPRC-210ENST00000462363 ACEP12821 1306 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-210ENST00000462363 IL16Q14005 1332 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-210ENST00000462363 STRCP1A6NGW2 1772 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-210ENST00000462363 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-210ENST00000462363 C7P10643 843 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-210ENST00000462363 KCNA6P17658 529 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-210ENST00000462363 C20orf194Q5TEA3 1177 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-210ENST00000462363 RSPH6AQ9H0K4 717 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-210ENST00000462363 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC37A3O60309 1634 aa7.41□□□□□ -1.22
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PTPRC-210ENST00000462363 TTC21AQ8NDW8 1320 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-210ENST00000462363 KDM2BQ8NHM5 1336 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-210ENST00000462363 MST1RQ04912 1400 aa7.41□□□□□ -1.22
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PTPRC-210ENST00000462363 PLIN1O60240 522 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-210ENST00000462363 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
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PTPRC-210ENST00000462363 KIF1AQ12756 1690 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 SLIT3O75094 1523 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 KDRP35968 1356 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 KIF24Q5T7B8 1368 aa7.39□□□□□ -1.23
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PTPRC-210ENST00000462363 ANKLE2Q86XL3 938 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 KIF12Q96FN5 646 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 ALS2Q96Q42 1657 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 FANCIQ9NVI1 1328 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 BCAR3O75815 825 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
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PTPRC-210ENST00000462363 COG3Q96JB2 828 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 TRPC6Q9Y210 931 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa7.38□□□□□ -1.23
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PTPRC-210ENST00000462363 ARHGEF10O15013 1369 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRC-210ENST00000462363 CCDC136Q96JN2 1154 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 PHACTR3Q96KR7 559 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 STRCQ7RTU9 1775 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 LMO7Q8WWI1 1683 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 PRKAR2BP31323 418 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 MYH16Q9H6N6 1097 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 FLT4P35916 1363 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 MAP3K19Q56UN5 1328 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
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