RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	TNR	Q92752	1358 aa		21.48	■■□□□ 1.03
TOM1-210	ENST00000449058	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	21.48	■■□□□ 1.03
TOM1-210	ENST00000449058	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	21.48	■■□□□ 1.03
TOM1-210	ENST00000449058	BECN1	Q14457	450 aa		21.47	■■□□□ 1.03
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF853	P0CG23	659 aa		21.46	■■□□□ 1.03
TOM1-210	ENST00000449058	COG3	Q96JB2	828 aa		21.46	■■□□□ 1.03
TOM1-210	ENST00000449058	IFT57	Q9NWB7	429 aa		21.46	■■□□□ 1.03
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		21.46	■■□□□ 1.03
TOM1-210	ENST00000449058	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		21.46	■■□□□ 1.03
TOM1-210	ENST00000449058	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		21.46	■■□□□ 1.03
TOM1-210	ENST00000449058	VAMP4	O75379	141 aa		21.45	■■□□□ 1.02
TOM1-210	ENST00000449058	GNAI1	P63096	354 aa		21.45	■■□□□ 1.02
TOM1-210	ENST00000449058	PIK3R4	Q99570	1358 aa		21.45	■■□□□ 1.02
TOM1-210	ENST00000449058	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		21.44	■■□□□ 1.02
TOM1-210	ENST00000449058	PTCH1	Q13635	1447 aa		21.44	■■□□□ 1.02
TOM1-210	ENST00000449058	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	21.44	■■□□□ 1.02
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	21.44	■■□□□ 1.02
TOM1-210	ENST00000449058	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		21.44	■■□□□ 1.02
TOM1-210	ENST00000449058	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		21.44	■■□□□ 1.02
TOM1-210	ENST00000449058	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	21.43	■■□□□ 1.02
TOM1-210	ENST00000449058	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		21.43	■■□□□ 1.02
TOM1-210	ENST00000449058	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		21.43	■■□□□ 1.02
TOM1-210	ENST00000449058	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	21.42	■■□□□ 1.02
TOM1-210	ENST00000449058	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		21.41	■■□□□ 1.02
TOM1-210	ENST00000449058	MBIP	Q9NS73	344 aa		21.41	■■□□□ 1.02
TOM1-210	ENST00000449058	GSE1	Q14687	1217 aa		21.41	■■□□□ 1.02
TOM1-210	ENST00000449058	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
TOM1-210	ENST00000449058	TSPYL6	Q8N831	410 aa		21.41	■■□□□ 1.02
TOM1-210	ENST00000449058	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	21.4	■■□□□ 1.02
TOM1-210	ENST00000449058	NUCB1	Q02818	461 aa		21.4	■■□□□ 1.02
TOM1-210	ENST00000449058	CFAP44	Q96MT7	982 aa		21.39	■■□□□ 1.02
TOM1-210	ENST00000449058	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	21.38	■■□□□ 1.01
TOM1-210	ENST00000449058	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		21.38	■■□□□ 1.01
TOM1-210	ENST00000449058	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	21.37	■■□□□ 1.01
TOM1-210	ENST00000449058	ABCC4	O15439	1325 aa		21.37	■■□□□ 1.01
TOM1-210	ENST00000449058	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		21.37	■■□□□ 1.01
TOM1-210	ENST00000449058	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		21.36	■■□□□ 1.01
TOM1-210	ENST00000449058	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		21.36	■■□□□ 1.01
TOM1-210	ENST00000449058	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		21.36	■■□□□ 1.01
TOM1-210	ENST00000449058	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		21.36	■■□□□ 1.01
TOM1-210	ENST00000449058	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	21.36	■■□□□ 1.01
TOM1-210	ENST00000449058	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		21.35	■■□□□ 1.01
TOM1-210	ENST00000449058	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		21.34	■■□□□ 1.01
TOM1-210	ENST00000449058	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		21.34	■■□□□ 1.01
TOM1-210	ENST00000449058	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		21.34	■■□□□ 1.01
TOM1-210	ENST00000449058	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		21.33	■■□□□ 1.01
TOM1-210	ENST00000449058	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		21.33	■■□□□ 1.01
TOM1-210	ENST00000449058	PEAK1	Q9H792	1746 aa		21.33	■■□□□ 1
TOM1-210	ENST00000449058	FAM83G	A6ND36	823 aa		21.32	■■□□□ 1
TOM1-210	ENST00000449058	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
TOM1-210	ENST00000449058	USP6	P35125	1406 aa		21.32	■■□□□ 1
TOM1-210	ENST00000449058	ACE	P12821	1306 aa		21.32	■■□□□ 1
TOM1-210	ENST00000449058	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
TOM1-210	ENST00000449058	LTK	P29376	864 aa		21.31	■■□□□ 1
TOM1-210	ENST00000449058	GCC1	Q96CN9	775 aa		21.31	■■□□□ 1
TOM1-210	ENST00000449058	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
TOM1-210	ENST00000449058	LNPK	Q9C0E8	428 aa		21.31	■■□□□ 1
TOM1-210	ENST00000449058	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	21.3	■■□□□ 1
TOM1-210	ENST00000449058	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
TOM1-210	ENST00000449058	USP31	Q70CQ4	1352 aa		21.3	■■□□□ 1
TOM1-210	ENST00000449058	SSH2	Q76I76	1423 aa		21.29	■■□□□ 1
TOM1-210	ENST00000449058	PTPRU	Q92729	1446 aa		21.29	■■□□□ 1
TOM1-210	ENST00000449058	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		21.29	■■□□□ 1
TOM1-210	ENST00000449058	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		21.29	■■□□□ 1
TOM1-210	ENST00000449058	DCTN1	Q14203	1278 aa		21.29	■■□□□ 1
TOM1-210	ENST00000449058	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		21.28	■■□□□ 1
TOM1-210	ENST00000449058	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		21.28	■■□□□ 1
TOM1-210	ENST00000449058	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		21.27	■■□□□ 1
TOM1-210	ENST00000449058	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		21.27	■■□□□ 1
TOM1-210	ENST00000449058	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		21.26	■□□□□ 0.99
TOM1-210	ENST00000449058	SLIT1	O75093	1534 aa		21.25	■□□□□ 0.99
TOM1-210	ENST00000449058	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		21.25	■□□□□ 0.99
TOM1-210	ENST00000449058	CHL1	O00533	1208 aa		21.24	■□□□□ 0.99
TOM1-210	ENST00000449058	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	21.24	■□□□□ 0.99
TOM1-210	ENST00000449058	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		21.24	■□□□□ 0.99
TOM1-210	ENST00000449058	KIAA0232	Q92628	1395 aa		21.24	■□□□□ 0.99
TOM1-210	ENST00000449058	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		21.23	■□□□□ 0.99
TOM1-210	ENST00000449058	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	21.22	■□□□□ 0.99
TOM1-210	ENST00000449058	RGS12	O14924	1447 aa		21.22	■□□□□ 0.99
TOM1-210	ENST00000449058	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		21.22	■□□□□ 0.99
TOM1-210	ENST00000449058	NUTM2F	A1L443	756 aa		21.22	■□□□□ 0.99
TOM1-210	ENST00000449058	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	21.22	■□□□□ 0.99
TOM1-210	ENST00000449058	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		21.21	■□□□□ 0.99
TOM1-210	ENST00000449058	ARHGEF10	O15013	1369 aa		21.21	■□□□□ 0.99
TOM1-210	ENST00000449058	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	21.2	■□□□□ 0.99
TOM1-210	ENST00000449058	EID1	Q9Y6B2	187 aa		21.2	■□□□□ 0.98
TOM1-210	ENST00000449058	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	21.2	■□□□□ 0.98
TOM1-210	ENST00000449058	CRB1	P82279	1406 aa		21.2	■□□□□ 0.98
TOM1-210	ENST00000449058	DIP2A	Q14689	1571 aa		21.19	■□□□□ 0.98
TOM1-210	ENST00000449058	MCM10	Q7L590	875 aa		21.19	■□□□□ 0.98
TOM1-210	ENST00000449058	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		21.18	■□□□□ 0.98
TOM1-210	ENST00000449058	TBX22	Q9Y458	520 aa		21.18	■□□□□ 0.98
TOM1-210	ENST00000449058	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	21.18	■□□□□ 0.98
TOM1-210	ENST00000449058	KRT24	Q2M2I5	525 aa		21.18	■□□□□ 0.98
TOM1-210	ENST00000449058	IL27	Q8NEV9	243 aa		21.18	■□□□□ 0.98
TOM1-210	ENST00000449058	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		21.17	■□□□□ 0.98
TOM1-210	ENST00000449058	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		21.17	■□□□□ 0.98
TOM1-210	ENST00000449058	ATP10D	Q9P241	1426 aa		21.16	■□□□□ 0.98
TOM1-210	ENST00000449058	SNX21	Q969T3	373 aa		21.16	■□□□□ 0.98
TOM1-210	ENST00000449058	SBNO1	A3KN83	1393 aa		21.16	■□□□□ 0.98

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