RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448775.3

CLMP-201, Transcript of CXADR like membrane protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLMP, Length 5,072 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMP-201ENST00000448775 SERPINC1P01008 464 aa21.49■■□□□ 1.03
CLMP-201ENST00000448775 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa21.49■■□□□ 1.03
CLMP-201ENST00000448775 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.49■■□□□ 1.03
CLMP-201ENST00000448775 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.49■■□□□ 1.03
CLMP-201ENST00000448775 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CLMP-201ENST00000448775 CCDC183Q5T5S1 534 aa21.49■■□□□ 1.03
CLMP-201ENST00000448775 CEP57L1Q8IYX8 460 aa21.49■■□□□ 1.03
CLMP-201ENST00000448775 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.48■■□□□ 1.03
CLMP-201ENST00000448775 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.48■■□□□ 1.03
CLMP-201ENST00000448775 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.48■■□□□ 1.03
CLMP-201ENST00000448775 PRIMPOLQ96LW4 560 aa21.48■■□□□ 1.03
CLMP-201ENST00000448775 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.48■■□□□ 1.03
CLMP-201ENST00000448775 USP8P40818 1118 aa21.48■■□□□ 1.03
CLMP-201ENST00000448775 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CLMP-201ENST00000448775 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CLMP-201ENST00000448775 SPATA32Q96LK8 384 aa21.47■■□□□ 1.03
CLMP-201ENST00000448775 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CLMP-201ENST00000448775 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CLMP-201ENST00000448775 CCT4P50991 539 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CLMP-201ENST00000448775 TMCO3Q6UWJ1 677 aa21.47■■□□□ 1.03
CLMP-201ENST00000448775 PTPN14Q15678 1187 aa21.46■■□□□ 1.03
CLMP-201ENST00000448775 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.46■■□□□ 1.03
CLMP-201ENST00000448775 JMYQ8N9B5 988 aa21.46■■□□□ 1.03
CLMP-201ENST00000448775 DEF6Q9H4E7 631 aa21.46■■□□□ 1.03
CLMP-201ENST00000448775 ERICH2A1L162 156 aa21.46■■□□□ 1.03
CLMP-201ENST00000448775 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CLMP-201ENST00000448775 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.46■■□□□ 1.03
CLMP-201ENST00000448775 CBFA2T2O43439 604 aa21.45■■□□□ 1.02
CLMP-201ENST00000448775 ME1P48163 572 aa21.45■■□□□ 1.02
CLMP-201ENST00000448775 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.44■■□□□ 1.02
CLMP-201ENST00000448775 CFAP45Q9UL16 551 aa21.44■■□□□ 1.02
CLMP-201ENST00000448775 BAG4O95429 457 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CLMP-201ENST00000448775 KIAA0754O94854 1291 aa21.44■■□□□ 1.02
CLMP-201ENST00000448775 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa21.44■■□□□ 1.02
CLMP-201ENST00000448775 ERC1Q8IUD2 1116 aa21.44■■□□□ 1.02
CLMP-201ENST00000448775 KIF18AQ8NI77 898 aa21.44■■□□□ 1.02
CLMP-201ENST00000448775 USP25Q9UHP3 1055 aa21.44■■□□□ 1.02
CLMP-201ENST00000448775 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.43■■□□□ 1.02
CLMP-201ENST00000448775 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.43■■□□□ 1.02
CLMP-201ENST00000448775 PANK2Q9BZ23 570 aa21.43■■□□□ 1.02
CLMP-201ENST00000448775 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CLMP-201ENST00000448775 HECW1Q76N89 1606 aa21.42■■□□□ 1.02
CLMP-201ENST00000448775 SLC4A2P04920 1241 aa21.42■■□□□ 1.02
CLMP-201ENST00000448775 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CLMP-201ENST00000448775 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CLMP-201ENST00000448775 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CLMP-201ENST00000448775 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.41■■□□□ 1.02
CLMP-201ENST00000448775 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.41■■□□□ 1.02
CLMP-201ENST00000448775 WASHC4Q2M389 1173 aa21.4■■□□□ 1.02
CLMP-201ENST00000448775 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.4■■□□□ 1.02
CLMP-201ENST00000448775 DAPK1P53355 1430 aa21.4■■□□□ 1.02
CLMP-201ENST00000448775 PPFIBP1Q86W92 1011 aa21.4■■□□□ 1.02
CLMP-201ENST00000448775 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CLMP-201ENST00000448775 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.4■■□□□ 1.02
CLMP-201ENST00000448775 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.4■■□□□ 1.02
CLMP-201ENST00000448775 XBP1P17861 261 aa21.39■■□□□ 1.02
CLMP-201ENST00000448775 TNNT1P13805 278 aa21.39■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 DACH1Q9UI36 760 aa21.39■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 UVSSAQ2YD98 709 aa21.39■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 SKIDA1Q1XH10 827 aa21.38■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 VPS53Q5VIR6 699 aa21.38■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 BRMS1Q9HCU9 246 aa21.38■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 IGHDP01880 384 aa21.37■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 STK3Q13188 491 aa21.37■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.37■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.37■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.37■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 MAP3K1Q13233 1512 aa21.37■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.37■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 C8orf34Q49A92 452 aa21.37■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 BMP2KLQ5H9B9 411 aa21.37■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 SMTNL1A8MU46 457 aa21.36■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.36■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 OFD1O75665 1012 aa21.36■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 NEMFO60524 1076 aa21.36■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa21.35■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 CCDC102AQ96A19 550 aa21.35■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 ADCY5O95622 1261 aa21.35■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 GBP3Q9H0R5 595 aa21.35■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 MYO6Q9UM54 1294 aa21.35■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.35■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.34■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 HS1BP3Q53T59 392 aa21.34■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa21.34■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.34■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 LRSAM1Q6UWE0 723 aa21.33■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 CAMK4Q16566 473 aa21.33■■□□□ 1.01
CLMP-201ENST00000448775 FCHSD2O94868 740 aa21.33■■□□□ 1
CLMP-201ENST00000448775 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms