RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 TBX22Q9Y458 520 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 EID1Q9Y6B2 187 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 PIK3C2GO75747 1445 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 ZSCAN30Q86W11 494 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 SIRT1Q96EB6 747 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 QRICH2Q9H0J4 1663 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 DDX11L8A8MPP1 907 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 KIF1AQ12756 1690 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 UQCRHLA0A096LP55 91 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 UQCRHP07919 91 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 IDI1Q13907 227 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 NHSL1Q5SYE7 1610 aa10.54□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 CLSTN1O94985 981 aa10.54□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM135BQ49AJ0 1406 aa10.54□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC173Q0VFZ6 552 aa10.54□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 ADAMTS8Q9UP79 889 aa10.54□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa10.53□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 BCAR3O75815 825 aa10.53□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa10.53□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 TERF1P54274 439 aa10.52□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 GOLGA2Q08379 1002 aa10.52□□□□□ -0.72
RABGEF1-203ENST00000439720 NALCNQ8IZF0 1738 aa10.52□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 DISP3Q9P2K9 1392 aa10.52□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 FMN2Q9NZ56 1722 aa10.52□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNA6P17658 529 aa10.52□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 NASPP49321 788 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 WWC1Q8IX03 1113 aa10.52□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 SHPRHQ149N8 1683 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNG1Q9UIX4 513 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 ITSN1Q15811 1721 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 DMTNQ08495 405 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP1R9BQ96SB3 815 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 CANXP27824 592 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 VGFO15240 615 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 RGS22Q8NE09 1264 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 CLUAP1Q96AJ1 413 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 COG6Q9Y2V7 657 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 C22orf23Q9BZE7 217 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 HSCBQ8IWL3 235 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 PANK1Q8TE04 598 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 KDM4AO75164 1064 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 SLFN5Q08AF3 891 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 DYNC1I1O14576 645 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP10.47□□□□□ -0.731e-6■■□□□ 14.5
RABGEF1-203ENST00000439720 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 USP54Q70EL1 1684 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 ABCC11Q96J66 1382 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 CGNL1Q0VF96 1302 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 TXNDC2Q86VQ3 553 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 GBP4Q96PP9 640 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF521Q96K83 1311 aa10.46□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
RABGEF1-203ENST00000439720 LTKP29376 864 aa10.46□□□□□ -0.74
RABGEF1-203ENST00000439720 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
RABGEF1-203ENST00000439720 HSPA2P54652 639 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-203ENST00000439720 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC146Q8IYE0 955 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-203ENST00000439720 PANK3Q9H999 370 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXD4L1Q9NU39 408 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-203ENST00000439720 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-203ENST00000439720 MST1RQ04912 1400 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-203ENST00000439720 PTPRUQ92729 1446 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-203ENST00000439720 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKARQ7Z5J8 1434 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-203ENST00000439720 CBX1P83916 185 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-203ENST00000439720 PLCD4Q9BRC7 762 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-203ENST00000439720 TULP4Q9NRJ4 1543 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-203ENST00000439720 TEX2Q8IWB9 1127 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-203ENST00000439720 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-203ENST00000439720 DDIT3P35638 169 aa10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms