RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420504.2

TMEM200B-201, Transcript of transmembrane protein 200B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM200B, Length 2,553 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200B-201ENST00000420504 IFT57Q9NWB7 429 aa27.15■■□□□ 1.94
TMEM200B-201ENST00000420504 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
TMEM200B-201ENST00000420504 BMP2KLQ5H9B9 411 aa27.14■■□□□ 1.94
TMEM200B-201ENST00000420504 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.14■■□□□ 1.93
TMEM200B-201ENST00000420504 RIMS2Q9UQ26 1411 aa27.14■■□□□ 1.93
TMEM200B-201ENST00000420504 REREQ9P2R6 1566 aa27.13■■□□□ 1.93
TMEM200B-201ENST00000420504 GNAI1P63096 354 aa27.13■■□□□ 1.93
TMEM200B-201ENST00000420504 HSCBQ8IWL3 235 aa27.13■■□□□ 1.93
TMEM200B-201ENST00000420504 GCC1Q96CN9 775 aa27.12■■□□□ 1.93
TMEM200B-201ENST00000420504 MBIPQ9NS73 344 aa27.12■■□□□ 1.93
TMEM200B-201ENST00000420504 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa27.12■■□□□ 1.93
TMEM200B-201ENST00000420504 ABCC4O15439 1325 aa27.12■■□□□ 1.93
TMEM200B-201ENST00000420504 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
TMEM200B-201ENST00000420504 AATKQ6ZMQ8 1374 aa27.11■■□□□ 1.93
TMEM200B-201ENST00000420504 AGLP35573 1532 aa27.11■■□□□ 1.93
TMEM200B-201ENST00000420504 DDIT3P35638 169 aa27.1■■□□□ 1.93
TMEM200B-201ENST00000420504 NME9Q86XW9 330 aa27.1■■□□□ 1.93
TMEM200B-201ENST00000420504 FAM43AQ8N2R8 423 aa27.1■■□□□ 1.93
TMEM200B-201ENST00000420504 SNX21Q969T3 373 aa27.1■■□□□ 1.93
TMEM200B-201ENST00000420504 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
TMEM200B-201ENST00000420504 C1orf115Q9H7X2 142 aa27.09■■□□□ 1.93
TMEM200B-201ENST00000420504 MON2Q7Z3U7 1717 aa27.09■■□□□ 1.93
TMEM200B-201ENST00000420504 SIRT2Q8IXJ6 389 aa27.09■■□□□ 1.93
TMEM200B-201ENST00000420504 WASLO00401 505 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
TMEM200B-201ENST00000420504 ANKRD45Q5TZF3 282 aa27.08■■□□□ 1.93
TMEM200B-201ENST00000420504 ZRANB1Q9UGI0 708 aa27.08■■□□□ 1.93
TMEM200B-201ENST00000420504 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.08■■□□□ 1.93
TMEM200B-201ENST00000420504 FSD2A1L4K1 749 aa27.06■■□□□ 1.92
TMEM200B-201ENST00000420504 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
TMEM200B-201ENST00000420504 CPS1P31327 1500 aa27.06■■□□□ 1.92
TMEM200B-201ENST00000420504 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
TMEM200B-201ENST00000420504 CFAP44Q96MT7 982 aa27.05■■□□□ 1.92
TMEM200B-201ENST00000420504 ARXQ96QS3 562 aa27.05■■□□□ 1.92
TMEM200B-201ENST00000420504 KIF2CQ99661 725 aa27.05■■□□□ 1.92
TMEM200B-201ENST00000420504 C8orf58Q8NAV2 365 aa27.04■■□□□ 1.92
TMEM200B-201ENST00000420504 METP08581 1390 aa27.03■■□□□ 1.92
TMEM200B-201ENST00000420504 C3P01024 1663 aa27.03■■□□□ 1.92
TMEM200B-201ENST00000420504 AKAP12Q02952 1782 aa27.03■■□□□ 1.92
TMEM200B-201ENST00000420504 TRAK2O60296 914 aa27.03■■□□□ 1.92
TMEM200B-201ENST00000420504 LMOD3Q0VAK6 560 aa27.03■■□□□ 1.92
TMEM200B-201ENST00000420504 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.02■■□□□ 1.92
TMEM200B-201ENST00000420504 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
TMEM200B-201ENST00000420504 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP27.01■■□□□ 1.91
TMEM200B-201ENST00000420504 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa27■■□□□ 1.91
TMEM200B-201ENST00000420504 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
TMEM200B-201ENST00000420504 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa27■■□□□ 1.91
TMEM200B-201ENST00000420504 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
TMEM200B-201ENST00000420504 COG3Q96JB2 828 aa27■■□□□ 1.91
TMEM200B-201ENST00000420504 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.99■■□□□ 1.91
TMEM200B-201ENST00000420504 FAM83GA6ND36 823 aa26.99■■□□□ 1.91
TMEM200B-201ENST00000420504 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
TMEM200B-201ENST00000420504 ITSN1Q15811 1721 aa26.99■■□□□ 1.91
TMEM200B-201ENST00000420504 DIP2BQ9P265 1576 aa26.98■■□□□ 1.91
TMEM200B-201ENST00000420504 TSPOAP1O95153 1857 aa26.98■■□□□ 1.91
TMEM200B-201ENST00000420504 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.98■■□□□ 1.91
TMEM200B-201ENST00000420504 DDX11L8A8MPP1 907 aa26.98■■□□□ 1.91
TMEM200B-201ENST00000420504 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.98■■□□□ 1.91
TMEM200B-201ENST00000420504 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.97■■□□□ 1.91
TMEM200B-201ENST00000420504 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.97■■□□□ 1.91
TMEM200B-201ENST00000420504 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
TMEM200B-201ENST00000420504 TECPR2O15040 1411 aa26.96■■□□□ 1.91
TMEM200B-201ENST00000420504 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
TMEM200B-201ENST00000420504 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.95■■□□□ 1.9
TMEM200B-201ENST00000420504 DCTN1Q14203 1278 aa26.95■■□□□ 1.9
TMEM200B-201ENST00000420504 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
TMEM200B-201ENST00000420504 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
TMEM200B-201ENST00000420504 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TMEM200B-201ENST00000420504 SIRT1Q96EB6 747 aa26.93■■□□□ 1.9
TMEM200B-201ENST00000420504 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.92■■□□□ 1.9
TMEM200B-201ENST00000420504 PANK2Q9BZ23 570 aa26.92■■□□□ 1.9
TMEM200B-201ENST00000420504 RAB3GAP1Q15042 981 aa26.91■■□□□ 1.9
TMEM200B-201ENST00000420504 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.91■■□□□ 1.9
TMEM200B-201ENST00000420504 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
TMEM200B-201ENST00000420504 PRR36Q9H6K5 1346 aa26.91■■□□□ 1.9
TMEM200B-201ENST00000420504 CDC45O75419 566 aa26.9■■□□□ 1.9
TMEM200B-201ENST00000420504 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
TMEM200B-201ENST00000420504 DCTPP1Q9H773 170 aa26.9■■□□□ 1.9
TMEM200B-201ENST00000420504 RGS12O14924 1447 aa26.9■■□□□ 1.9
TMEM200B-201ENST00000420504 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa26.89■■□□□ 1.9
TMEM200B-201ENST00000420504 ATP10DQ9P241 1426 aa26.89■■□□□ 1.89
TMEM200B-201ENST00000420504 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.89■■□□□ 1.89
TMEM200B-201ENST00000420504 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
TMEM200B-201ENST00000420504 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
TMEM200B-201ENST00000420504 MLECQ14165 292 aa26.88■■□□□ 1.89
TMEM200B-201ENST00000420504 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
TMEM200B-201ENST00000420504 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
TMEM200B-201ENST00000420504 MRE11P49959 708 aa26.86■■□□□ 1.89
TMEM200B-201ENST00000420504 KRT24Q2M2I5 525 aa26.85■■□□□ 1.89
TMEM200B-201ENST00000420504 GBP4Q96PP9 640 aa26.85■■□□□ 1.89
TMEM200B-201ENST00000420504 CHL1O00533 1208 aa26.84■■□□□ 1.89
TMEM200B-201ENST00000420504 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.84■■□□□ 1.89
TMEM200B-201ENST00000420504 ANKRD44Q8N8A2 993 aa26.84■■□□□ 1.89
TMEM200B-201ENST00000420504 TTC22Q5TAA0 569 aa26.83■■□□□ 1.89
TMEM200B-201ENST00000420504 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.83■■□□□ 1.89
TMEM200B-201ENST00000420504 KIAA0232Q92628 1395 aa26.82■■□□□ 1.88
TMEM200B-201ENST00000420504 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
TMEM200B-201ENST00000420504 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.82■■□□□ 1.88
TMEM200B-201ENST00000420504 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.82■■□□□ 1.88
TMEM200B-201ENST00000420504 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.82■■□□□ 1.88
TMEM200B-201ENST00000420504 PEAK1Q9H792 1746 aa26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms