RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP1-202ENST00000417536 IL16Q14005 1332 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP1-202ENST00000417536 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SH3BP1-202ENST00000417536 TECPR2O15040 1411 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP7BP35670 1465 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP1-202ENST00000417536 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP1-202ENST00000417536 PLEKHG5O94827 1062 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP1-202ENST00000417536 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SH3BP1-202ENST00000417536 MED14O60244 1454 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP1-202ENST00000417536 ACEP12821 1306 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP1-202ENST00000417536 TBX22Q9Y458 520 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP1-202ENST00000417536 SMC5Q8IY18 1101 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP1-202ENST00000417536 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP1-202ENST00000417536 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF16BQ96L93 1317 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP1-202ENST00000417536 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SH3BP1-202ENST00000417536 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SH3BP1-202ENST00000417536 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP1-202ENST00000417536 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP1-202ENST00000417536 PRKAR2BP31323 418 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP1-202ENST00000417536 POLKQ9UBT6 870 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP1-202ENST00000417536 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SH3BP1-202ENST00000417536 HMOX1P09601 288 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP1-202ENST00000417536 FCHSD2O94868 740 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP1-202ENST00000417536 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP1-202ENST00000417536 LNPKQ9C0E8 428 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP1-202ENST00000417536 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP1-202ENST00000417536 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP1-202ENST00000417536 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP1-202ENST00000417536 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP1-202ENST00000417536 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SH3BP1-202ENST00000417536 SIRT1Q96EB6 747 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP1-202ENST00000417536 COG3Q96JB2 828 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP1-202ENST00000417536 NUCB1Q02818 461 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP1-202ENST00000417536 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SH3BP1-202ENST00000417536 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP1-202ENST00000417536 ITSN1Q15811 1721 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP1-202ENST00000417536 C14orf37Q86TY3 774 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP1-202ENST00000417536 HSPA2P54652 639 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP1-202ENST00000417536 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP1-202ENST00000417536 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP1-202ENST00000417536 ARXQ96QS3 562 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP1-202ENST00000417536 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SH3BP1-202ENST00000417536 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SH3BP1-202ENST00000417536 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SH3BP1-202ENST00000417536 DIP2AQ14689 1571 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP1-202ENST00000417536 MCM4P33991 863 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP1-202ENST00000417536 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP1-202ENST00000417536 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP1-202ENST00000417536 HSCBQ8IWL3 235 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP1-202ENST00000417536 NFE2L2Q16236 605 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP1-202ENST00000417536 TSPYL6Q8N831 410 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP1-202ENST00000417536 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP1-202ENST00000417536 AKAP12Q02952 1782 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP1-202ENST00000417536 VAMP4O75379 141 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP1-202ENST00000417536 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SH3BP1-202ENST00000417536 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP1-202ENST00000417536 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SH3BP1-202ENST00000417536 PTCH1Q13635 1447 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP1-202ENST00000417536 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF428Q96B54 188 aa23.39■■□□□ 1.34
SH3BP1-202ENST00000417536 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SH3BP1-202ENST00000417536 USP6P35125 1406 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP1-202ENST00000417536 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BP1-202ENST00000417536 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP1-202ENST00000417536 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP1-202ENST00000417536 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SH3BP1-202ENST00000417536 GNAI1P63096 354 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP1-202ENST00000417536 MBIPQ9NS73 344 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP1-202ENST00000417536 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SH3BP1-202ENST00000417536 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SH3BP1-202ENST00000417536 IL13P35225 146 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP1-202ENST00000417536 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP1-202ENST00000417536 BMP2KLQ5H9B9 411 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP1-202ENST00000417536 IFT57Q9NWB7 429 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP1-202ENST00000417536 GCC1Q96CN9 775 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP1-202ENST00000417536 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SH3BP1-202ENST00000417536 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP1-202ENST00000417536 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAK2O60296 914 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP1-202ENST00000417536 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
SH3BP1-202ENST00000417536 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.33■■□□□ 1.32
SH3BP1-202ENST00000417536 ESCO1Q5FWF5 840 aa23.33■■□□□ 1.32
SH3BP1-202ENST00000417536 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SH3BP1-202ENST00000417536 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP1-202ENST00000417536 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM83GA6ND36 823 aa23.31■■□□□ 1.32
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