RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 NUTM2GQ5VZR2 741 aa19.63■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa19.63■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa19.63■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC61Q9Y6R9 512 aa19.62■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 SDF4Q9BRK5 362 aa19.62■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC192P0DO97 292 aa19.62■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 GPS2Q13227 327 aa19.61■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 RAPGEF3O95398 923 aa19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 APPP05067 770 aa19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 RBM10P98175 930 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 ABTB2Q8N961 1025 aa19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 NEUROD6Q96NK8 337 aa19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 TEX14Q8IWB6 1497 aa19.6■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 KRT85P78386 507 aa19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 ANKRD1Q15327 319 aa19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 PZPP20742 1482 aa19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 KINO60870 393 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 SSFA2P28290 1259 aa19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 NOS1P29475 1434 aa19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 FOSBP53539 338 aa19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 WDR62O43379 1518 aa19.59■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 PIK3C2GO75747 1445 aa19.58■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa19.58■□□□□ 0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 ATP10BO94823 1461 aa19.58■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 ADGRL1O94910 1474 aa19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 PES1O00541 588 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 SYCE3A1L190 88 aa19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 FBXW7Q969H0 707 aa19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 SRGAP3O43295 1099 aa19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa19.56■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 TEX35Q5T0J7 233 aa19.56■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 MX1P20591 662 aa19.55■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 MNS1Q8NEH6 495 aa19.55■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 UQCRHLA0A096LP55 91 aa19.55■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 UQCRHP07919 91 aa19.55■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa19.55■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP19.54■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 NFXL1Q6ZNB6 911 aa19.54■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 SPC24Q8NBT2 197 aa19.54■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa19.54■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 SHANK2Q9UPX8 1470 aa19.54■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 WASHC4Q2M389 1173 aa19.54■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 DUOX2Q9NRD8 1548 aa19.54■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 NUCB1Q02818 461 aa19.54■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 DCTN1Q14203 1278 aa19.54■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 TNMDQ9H2S6 317 aa19.54■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 ARHGAP45Q92619 1136 aa19.53■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa19.52■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 MCM10Q7L590 875 aa19.52■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 PDRG1Q9NUG6 133 aa19.52■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 NLRP2Q9NX02 1062 aa19.52■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa19.52■□□□□ 0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 KLHL40Q2TBA0 621 aa19.52■□□□□ 0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 MPNDQ8N594 471 aa19.52■□□□□ 0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 BAG4O95429 457 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 INSRP06213 1382 aa19.51■□□□□ 0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 PPP6R1Q9UPN7 881 aa19.51■□□□□ 0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 OLFM4Q6UX06 510 aa19.5■□□□□ 0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 WAPLQ7Z5K2 1190 aa19.5■□□□□ 0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 KIF1BPQ96EK5 621 aa19.5■□□□□ 0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 NME9Q86XW9 330 aa19.5■□□□□ 0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 PTPRCP08575 1304 aa19.5■□□□□ 0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 KIAA0556O60303 1618 aa19.49■□□□□ 0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 IDI1Q13907 227 aa19.49■□□□□ 0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 ERICH2A1L162 156 aa19.49■□□□□ 0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 RAB11FIP3O75154 756 aa19.49■□□□□ 0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 NUP62CLQ9H1M0 184 aa19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms