RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390664.2

CHST6-202, Transcript of carbohydrate sulfotransferase 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHST6, Length 2,093 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST6-202ENST00000390664 MSH6P52701 1360 aa29.83■■■□□ 2.37
CHST6-202ENST00000390664 LTN1O94822 1766 aa29.83■■■□□ 2.37
CHST6-202ENST00000390664 RRP1P56182 461 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
CHST6-202ENST00000390664 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa29.83■■■□□ 2.37
CHST6-202ENST00000390664 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.81■■■□□ 2.36
CHST6-202ENST00000390664 AMPHP49418 695 aa29.8■■■□□ 2.36
CHST6-202ENST00000390664 KIF24Q5T7B8 1368 aa29.79■■■□□ 2.36
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CHST6-202ENST00000390664 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
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CHST6-202ENST00000390664 DLG5Q8TDM6 1919 aa29.77■■■□□ 2.36
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CHST6-202ENST00000390664 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.75■■■□□ 2.35
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CHST6-202ENST00000390664 ALS2Q96Q42 1657 aa29.73■■■□□ 2.35
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CHST6-202ENST00000390664 PPP4R2Q9NY27 417 aa29.72■■■□□ 2.35
CHST6-202ENST00000390664 RTL1A6NKG5 1358 aa29.72■■■□□ 2.35
CHST6-202ENST00000390664 HOXC9P31274 260 aa29.72■■■□□ 2.35
CHST6-202ENST00000390664 KCNH5Q8NCM2 988 aa29.72■■■□□ 2.35
CHST6-202ENST00000390664 SLIT3O75094 1523 aa29.71■■■□□ 2.35
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CHST6-202ENST00000390664 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.66■■■□□ 2.34
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CHST6-202ENST00000390664 USP19O94966 1318 aa29.64■■■□□ 2.34
CHST6-202ENST00000390664 IGSF1Q8N6C5 1336 aa29.64■■■□□ 2.34
CHST6-202ENST00000390664 KDRP35968 1356 aa29.63■■■□□ 2.33
CHST6-202ENST00000390664 GCP02774 474 aa29.62■■■□□ 2.33
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CHST6-202ENST00000390664 EYA1Q99502 592 aa29.62■■■□□ 2.33
CHST6-202ENST00000390664 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.62■■■□□ 2.33
CHST6-202ENST00000390664 LMOD3Q0VAK6 560 aa29.61■■■□□ 2.33
CHST6-202ENST00000390664 IP6K1Q92551 441 aa29.61■■■□□ 2.33
CHST6-202ENST00000390664 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
CHST6-202ENST00000390664 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
CHST6-202ENST00000390664 PXDNQ92626 1479 aa29.6■■■□□ 2.33
CHST6-202ENST00000390664 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
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CHST6-202ENST00000390664 PLEKHG5O94827 1062 aa29.58■■■□□ 2.33
CHST6-202ENST00000390664 ZBTB7CA1YPR0 619 aa29.57■■■□□ 2.32
CHST6-202ENST00000390664 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
CHST6-202ENST00000390664 TNS3Q68CZ2 1445 aa29.57■■■□□ 2.32
CHST6-202ENST00000390664 BRINP3Q76B58 766 aa29.57■■■□□ 2.32
CHST6-202ENST00000390664 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
CHST6-202ENST00000390664 BCAR3O75815 825 aa29.56■■■□□ 2.32
CHST6-202ENST00000390664 ARHGEF25Q86VW2 580 aa29.56■■■□□ 2.32
CHST6-202ENST00000390664 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa29.55■■■□□ 2.32
CHST6-202ENST00000390664 EXOC6Q8TAG9 804 aa29.55■■■□□ 2.32
CHST6-202ENST00000390664 SLAIN2Q9P270 581 aa29.54■■■□□ 2.32
CHST6-202ENST00000390664 RGPD2P0DJD1 1756 aa29.54■■■□□ 2.32
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CHST6-202ENST00000390664 RGPD5Q99666 1765 aa29.51■■■□□ 2.31
CHST6-202ENST00000390664 FAM83GA6ND36 823 aa29.5■■■□□ 2.31
CHST6-202ENST00000390664 C20orf194Q5TEA3 1177 aa29.5■■■□□ 2.31
CHST6-202ENST00000390664 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.5■■■□□ 2.31
CHST6-202ENST00000390664 IFT57Q9NWB7 429 aa29.49■■■□□ 2.31
CHST6-202ENST00000390664 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
CHST6-202ENST00000390664 GNAI1P63096 354 aa29.48■■■□□ 2.31
CHST6-202ENST00000390664 CRBNQ96SW2 442 aa29.48■■■□□ 2.31
CHST6-202ENST00000390664 CCDC136Q96JN2 1154 aa29.48■■■□□ 2.31
CHST6-202ENST00000390664 DCTN1Q14203 1278 aa29.46■■■□□ 2.31
CHST6-202ENST00000390664 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
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CHST6-202ENST00000390664 ZNF853P0CG23 659 aa29.44■■■□□ 2.3
CHST6-202ENST00000390664 USHBP1Q8N6Y0 703 aa29.44■■■□□ 2.3
CHST6-202ENST00000390664 CFAP44Q96MT7 982 aa29.44■■■□□ 2.3
CHST6-202ENST00000390664 NHSL1Q5SYE7 1610 aa29.44■■■□□ 2.3
CHST6-202ENST00000390664 CANXP27824 592 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
CHST6-202ENST00000390664 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
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CHST6-202ENST00000390664 NBPF4Q96M43 638 aa29.43■■■□□ 2.3
CHST6-202ENST00000390664 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa29.42■■■□□ 2.3
CHST6-202ENST00000390664 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
CHST6-202ENST00000390664 BCL2L13Q9BXK5 485 aa29.41■■■□□ 2.3
CHST6-202ENST00000390664 MCM10Q7L590 875 aa29.41■■■□□ 2.3
CHST6-202ENST00000390664 MBIPQ9NS73 344 aa29.41■■■□□ 2.3
CHST6-202ENST00000390664 COL18A1P39060 1754 aa29.4■■■□□ 2.3
CHST6-202ENST00000390664 ANKRD24Q8TF21 1146 aa29.4■■■□□ 2.3
CHST6-202ENST00000390664 CABLES1Q8TDN4 633 aa29.4■■■□□ 2.3
CHST6-202ENST00000390664 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
CHST6-202ENST00000390664 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
CHST6-202ENST00000390664 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
CHST6-202ENST00000390664 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29.39■■■□□ 2.3
CHST6-202ENST00000390664 ABCC6O95255 1503 aa29.37■■■□□ 2.29
CHST6-202ENST00000390664 NCAPD2Q15021 1401 aa29.37■■■□□ 2.29
CHST6-202ENST00000390664 PDE3AQ14432 1141 aa29.37■■■□□ 2.29
CHST6-202ENST00000390664 LRRC37A3O60309 1634 aa29.37■■■□□ 2.29
CHST6-202ENST00000390664 SMC4Q9NTJ3 1288 aa29.36■■■□□ 2.29
CHST6-202ENST00000390664 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.35■■■□□ 2.29
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