RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384569.1

SNORD56.6-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 71 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56.6-201ENST00000384569 PKD1L3Q7Z443 1732 aa7.15□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 NLRP6P59044 892 aa7.14□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 NEUROD2Q15784 382 aa7.14□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 PLCH1Q4KWH8 1693 aa7.14□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 TCP11L2Q8N4U5 519 aa7.14□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 ABTB2Q8N961 1025 aa7.14□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZNF521Q96K83 1311 aa7.14□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 MYH16Q9H6N6 1097 aa7.14□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 POLKQ9UBT6 870 aa7.14□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 SCN11AQ9UI33 1791 aa7.14□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 LAMB4A4D0S4 1761 aa7.13□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 PXDNQ92626 1479 aa7.13□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 PRKAR2BP31323 418 aa7.13□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 AMPHP49418 695 aa7.13□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 PSME1Q06323 249 aa7.13□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 CCDC27Q2M243 656 aa7.13□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 CADPS2Q86UW7 1296 aa7.13□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZRANB1Q9UGI0 708 aa7.13□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 COL18A1P39060 1754 aa7.13□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 NPHP3Q7Z494 1330 aa7.12□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa7.12□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 FCHSD2O94868 740 aa7.12□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 HMOX1P09601 288 aa7.12□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 KCNH5Q8NCM2 988 aa7.12□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 CDCA7LQ96GN5 454 aa7.12□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 C19orf44Q9H6X5 657 aa7.12□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 MAP3K19Q56UN5 1328 aa7.11□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 RNF123Q5XPI4 1314 aa7.11□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZBTB7CA1YPR0 619 aa7.11□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 SLFN5Q08AF3 891 aa7.11□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 DUSP27Q5VZP5 1158 aa7.11□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.11□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 WDR63Q8IWG1 891 aa7.11□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 WWC1Q8IX03 1113 aa7.11□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 RSPH6AQ9H0K4 717 aa7.11□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 PPP4R2Q9NY27 417 aa7.11□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 IL16Q14005 1332 aa7.1□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 IL13P35225 146 aa7.1□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 TMPOP42166 694 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 RIPK4P57078 832 aa7.1□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 NFE2L2Q16236 605 aa7.1□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 NUTM2GQ5VZR2 741 aa7.1□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 DMRT2Q9Y5R5 561 aa7.1□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 NCAPD2Q15021 1401 aa7.1□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 KDRP35968 1356 aa7.09□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 USP19O94966 1318 aa7.09□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 IGSF1Q8N6C5 1336 aa7.09□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 FANCIQ9NVI1 1328 aa7.09□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 HOXC9P31274 260 aa7.09□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 CCDC136Q96JN2 1154 aa7.09□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 SHANK3Q9BYB0 1731 aa7.09□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa7.09□□□□□ -1.27
SNORD56.6-201ENST00000384569 NWD2Q9ULI1 1742 aa7.08□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 FOXO3O43524 673 aa7.08□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 SULT6B1Q6IMI4 303 aa7.08□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 PLEKHF1Q96S99 279 aa7.08□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 ORAI2Q96SN7 254 aa7.08□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 MAP3K5Q99683 1374 aa7.08□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 KIF16BQ96L93 1317 aa7.07□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 C5P01031 1676 aa7.07□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 FBLN1P23142 703 aa7.07□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 GNAI1P63096 354 aa7.07□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa7.07□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 KRT28Q7Z3Y7 464 aa7.07□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 GAS2L2Q8NHY3 880 aa7.07□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 NRAPQ86VF7 1730 aa7.07□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 LTBP4Q8N2S1 1624 aa7.06□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 ADRA2BP18089 450 aa7.06□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 IFT57Q9NWB7 429 aa7.06□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa7.06□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 PAPPAQ13219 1627 aa7.05□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 PLEKHG5O94827 1062 aa7.05□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 MS4A1P11836 297 aa7.05□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.05□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 SMC4Q9NTJ3 1288 aa7.05□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa7.05□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 UBR2Q8IWV8 1755 aa7.05□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 DOT1LQ8TEK3 1739 aa7.04□□□□□ -1.28
SNORD56.6-201ENST00000384569 ITGB4P16144 1822 aa7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms