RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370206.8

CNN3-201, Transcript of calponin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNN3, Length 2,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-201ENST00000370206 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
CNN3-201ENST00000370206 TMEM57Q8N5G2 664 aa28.04■■■□□ 2.08
CNN3-201ENST00000370206 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
CNN3-201ENST00000370206 SEC24BO95487 1268 aa28.02■■■□□ 2.08
CNN3-201ENST00000370206 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa28.02■■■□□ 2.08
CNN3-201ENST00000370206 NRKQ7Z2Y5 1582 aa28.02■■■□□ 2.08
CNN3-201ENST00000370206 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.08
CNN3-201ENST00000370206 IFT57Q9NWB7 429 aa28.01■■■□□ 2.08
CNN3-201ENST00000370206 GNAI1P63096 354 aa28■■■□□ 2.07
CNN3-201ENST00000370206 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa28■■■□□ 2.07
CNN3-201ENST00000370206 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
CNN3-201ENST00000370206 ZNF853P0CG23 659 aa27.99■■■□□ 2.07
CNN3-201ENST00000370206 LTKP29376 864 aa27.99■■■□□ 2.07
CNN3-201ENST00000370206 LMOD3Q0VAK6 560 aa27.98■■■□□ 2.07
CNN3-201ENST00000370206 VAMP4O75379 141 aa27.97■■■□□ 2.07
CNN3-201ENST00000370206 DLG5Q8TDM6 1919 aa27.97■■■□□ 2.07
CNN3-201ENST00000370206 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa27.96■■■□□ 2.07
CNN3-201ENST00000370206 PLEKHG3A1L390 1219 aa27.96■■■□□ 2.07
CNN3-201ENST00000370206 SMC5Q8IY18 1101 aa27.96■■■□□ 2.07
CNN3-201ENST00000370206 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa27.94■■■□□ 2.06
CNN3-201ENST00000370206 OVOS2Q6IE36 1432 aa27.94■■■□□ 2.06
CNN3-201ENST00000370206 MBIPQ9NS73 344 aa27.94■■■□□ 2.06
CNN3-201ENST00000370206 PTCH1Q13635 1447 aa27.93■■■□□ 2.06
CNN3-201ENST00000370206 ACEP12821 1306 aa27.93■■■□□ 2.06
CNN3-201ENST00000370206 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
CNN3-201ENST00000370206 ARHGAP45Q92619 1136 aa27.93■■■□□ 2.06
CNN3-201ENST00000370206 PTPRUQ92729 1446 aa27.92■■■□□ 2.06
CNN3-201ENST00000370206 USP6P35125 1406 aa27.92■■■□□ 2.06
CNN3-201ENST00000370206 PIK3R4Q99570 1358 aa27.92■■■□□ 2.06
CNN3-201ENST00000370206 TSPYL6Q8N831 410 aa27.92■■■□□ 2.06
CNN3-201ENST00000370206 CFAP44Q96MT7 982 aa27.92■■■□□ 2.06
CNN3-201ENST00000370206 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
CNN3-201ENST00000370206 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.9■■■□□ 2.06
CNN3-201ENST00000370206 SLIT1O75093 1534 aa27.9■■■□□ 2.06
CNN3-201ENST00000370206 NFKBIBQ15653 356 aa27.89■■■□□ 2.06
CNN3-201ENST00000370206 ARHGAP23Q9P227 1491 aa27.89■■■□□ 2.06
CNN3-201ENST00000370206 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
CNN3-201ENST00000370206 TBC1D32Q96NH3 1257 aa27.89■■■□□ 2.05
CNN3-201ENST00000370206 BCL11AQ9H165 835 aa27.89■■■□□ 2.05
CNN3-201ENST00000370206 EID1Q9Y6B2 187 aa27.88■■■□□ 2.05
CNN3-201ENST00000370206 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
CNN3-201ENST00000370206 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
CNN3-201ENST00000370206 SLC26A8Q96RN1 970 aa27.86■■■□□ 2.05
CNN3-201ENST00000370206 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
CNN3-201ENST00000370206 USP31Q70CQ4 1352 aa27.86■■■□□ 2.05
CNN3-201ENST00000370206 BECN1Q14457 450 aa27.86■■■□□ 2.05
CNN3-201ENST00000370206 SSH2Q76I76 1423 aa27.86■■■□□ 2.05
CNN3-201ENST00000370206 FAM83GA6ND36 823 aa27.84■■■□□ 2.05
CNN3-201ENST00000370206 PEAK1Q9H792 1746 aa27.84■■■□□ 2.05
CNN3-201ENST00000370206 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
CNN3-201ENST00000370206 ABCC4O15439 1325 aa27.84■■■□□ 2.05
CNN3-201ENST00000370206 NUTM2FA1L443 756 aa27.83■■■□□ 2.05
CNN3-201ENST00000370206 AEBP1Q8IUX7 1158 aa27.83■■■□□ 2.05
CNN3-201ENST00000370206 C8orf58Q8NAV2 365 aa27.83■■■□□ 2.05
CNN3-201ENST00000370206 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
CNN3-201ENST00000370206 NUCB1Q02818 461 aa27.83■■■□□ 2.05
CNN3-201ENST00000370206 RGPD1P0DJD0 1748 aa27.83■■■□□ 2.04
CNN3-201ENST00000370206 SULT6B1Q6IMI4 303 aa27.82■■■□□ 2.04
CNN3-201ENST00000370206 TBX22Q9Y458 520 aa27.82■■■□□ 2.04
CNN3-201ENST00000370206 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa27.82■■■□□ 2.04
CNN3-201ENST00000370206 DCTN1Q14203 1278 aa27.8■■■□□ 2.04
CNN3-201ENST00000370206 TTC21AQ8NDW8 1320 aa27.79■■■□□ 2.04
CNN3-201ENST00000370206 DIP2AQ14689 1571 aa27.79■■■□□ 2.04
CNN3-201ENST00000370206 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
CNN3-201ENST00000370206 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa27.77■■■□□ 2.04
CNN3-201ENST00000370206 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.76■■■□□ 2.03
CNN3-201ENST00000370206 CHD1LQ86WJ1 897 aa27.76■■■□□ 2.03
CNN3-201ENST00000370206 GCC1Q96CN9 775 aa27.75■■■□□ 2.03
CNN3-201ENST00000370206 KIF24Q5T7B8 1368 aa27.74■■■□□ 2.03
CNN3-201ENST00000370206 LNPKQ9C0E8 428 aa27.73■■■□□ 2.03
CNN3-201ENST00000370206 ARHGEF10O15013 1369 aa27.73■■■□□ 2.03
CNN3-201ENST00000370206 CHL1O00533 1208 aa27.73■■■□□ 2.03
CNN3-201ENST00000370206 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.73■■■□□ 2.03
CNN3-201ENST00000370206 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
CNN3-201ENST00000370206 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
CNN3-201ENST00000370206 C1orf115Q9H7X2 142 aa27.72■■■□□ 2.03
CNN3-201ENST00000370206 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
CNN3-201ENST00000370206 MAP3K19Q56UN5 1328 aa27.71■■■□□ 2.03
CNN3-201ENST00000370206 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
CNN3-201ENST00000370206 KIAA0232Q92628 1395 aa27.71■■■□□ 2.03
CNN3-201ENST00000370206 C22orf23Q9BZE7 217 aa27.7■■■□□ 2.03
CNN3-201ENST00000370206 SBNO1A3KN83 1393 aa27.7■■■□□ 2.02
CNN3-201ENST00000370206 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
CNN3-201ENST00000370206 TBC1D2Q9BYX2 928 aa27.69■■■□□ 2.02
CNN3-201ENST00000370206 FLT4P35916 1363 aa27.69■■■□□ 2.02
CNN3-201ENST00000370206 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
CNN3-201ENST00000370206 SIRT2Q8IXJ6 389 aa27.69■■■□□ 2.02
CNN3-201ENST00000370206 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
CNN3-201ENST00000370206 MCM10Q7L590 875 aa27.68■■■□□ 2.02
CNN3-201ENST00000370206 SOX12O15370 315 aa27.67■■■□□ 2.02
CNN3-201ENST00000370206 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
CNN3-201ENST00000370206 CRB1P82279 1406 aa27.67■■■□□ 2.02
CNN3-201ENST00000370206 PIK3C2AO00443 1686 aa27.66■■■□□ 2.02
CNN3-201ENST00000370206 BMP2KLQ5H9B9 411 aa27.66■■■□□ 2.02
CNN3-201ENST00000370206 ANKRD45Q5TZF3 282 aa27.66■■■□□ 2.02
CNN3-201ENST00000370206 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.66■■■□□ 2.02
CNN3-201ENST00000370206 ANTXR1Q9H6X2 564 aa27.66■■■□□ 2.02
CNN3-201ENST00000370206 ANKARQ7Z5J8 1434 aa27.66■■■□□ 2.02
CNN3-201ENST00000370206 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
CNN3-201ENST00000370206 KDRP35968 1356 aa27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms