RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368309.3

UBQLN4-201, Transcript of ubiquilin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN4, Length 3,576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4-201ENST00000368309 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.88■■□□□ 1.25
UBQLN4-201ENST00000368309 LNPKQ9C0E8 428 aa22.87■■□□□ 1.25
UBQLN4-201ENST00000368309 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
UBQLN4-201ENST00000368309 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
UBQLN4-201ENST00000368309 CPS1P31327 1500 aa22.86■■□□□ 1.25
UBQLN4-201ENST00000368309 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
UBQLN4-201ENST00000368309 IFT57Q9NWB7 429 aa22.86■■□□□ 1.25
UBQLN4-201ENST00000368309 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.85■■□□□ 1.25
UBQLN4-201ENST00000368309 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.85■■□□□ 1.25
UBQLN4-201ENST00000368309 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.85■■□□□ 1.25
UBQLN4-201ENST00000368309 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.85■■□□□ 1.25
UBQLN4-201ENST00000368309 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.84■■□□□ 1.25
UBQLN4-201ENST00000368309 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
UBQLN4-201ENST00000368309 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
UBQLN4-201ENST00000368309 SOX12O15370 315 aa22.84■■□□□ 1.25
UBQLN4-201ENST00000368309 ZNF853P0CG23 659 aa22.84■■□□□ 1.25
UBQLN4-201ENST00000368309 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.84■■□□□ 1.25
UBQLN4-201ENST00000368309 ZNF428Q96B54 188 aa22.84■■□□□ 1.25
UBQLN4-201ENST00000368309 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.83■■□□□ 1.25
UBQLN4-201ENST00000368309 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.83■■□□□ 1.25
UBQLN4-201ENST00000368309 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
UBQLN4-201ENST00000368309 TNRQ92752 1358 aa22.83■■□□□ 1.25
UBQLN4-201ENST00000368309 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.83■■□□□ 1.24
UBQLN4-201ENST00000368309 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.82■■□□□ 1.24
UBQLN4-201ENST00000368309 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
UBQLN4-201ENST00000368309 NUCB1Q02818 461 aa22.82■■□□□ 1.24
UBQLN4-201ENST00000368309 CFAP44Q96MT7 982 aa22.82■■□□□ 1.24
UBQLN4-201ENST00000368309 SIRT1Q96EB6 747 aa22.81■■□□□ 1.24
UBQLN4-201ENST00000368309 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.81■■□□□ 1.24
UBQLN4-201ENST00000368309 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
UBQLN4-201ENST00000368309 LTKP29376 864 aa22.8■■□□□ 1.24
UBQLN4-201ENST00000368309 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.8■■□□□ 1.24
UBQLN4-201ENST00000368309 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.8■■□□□ 1.24
UBQLN4-201ENST00000368309 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.8■■□□□ 1.24
UBQLN4-201ENST00000368309 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.8■■□□□ 1.24
UBQLN4-201ENST00000368309 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
UBQLN4-201ENST00000368309 ACEP12821 1306 aa22.79■■□□□ 1.24
UBQLN4-201ENST00000368309 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.79■■□□□ 1.24
UBQLN4-201ENST00000368309 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
UBQLN4-201ENST00000368309 IL27Q8NEV9 243 aa22.79■■□□□ 1.24
UBQLN4-201ENST00000368309 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.78■■□□□ 1.24
UBQLN4-201ENST00000368309 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.77■■□□□ 1.24
UBQLN4-201ENST00000368309 KRT24Q2M2I5 525 aa22.76■■□□□ 1.23
UBQLN4-201ENST00000368309 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.76■■□□□ 1.23
UBQLN4-201ENST00000368309 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.76■■□□□ 1.23
UBQLN4-201ENST00000368309 TECPR2O15040 1411 aa22.76■■□□□ 1.23
UBQLN4-201ENST00000368309 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.75■■□□□ 1.23
UBQLN4-201ENST00000368309 MCM10Q7L590 875 aa22.75■■□□□ 1.23
UBQLN4-201ENST00000368309 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.72■■□□□ 1.23
UBQLN4-201ENST00000368309 ABCC4O15439 1325 aa22.72■■□□□ 1.23
UBQLN4-201ENST00000368309 PTCH1Q13635 1447 aa22.71■■□□□ 1.23
UBQLN4-201ENST00000368309 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
UBQLN4-201ENST00000368309 GCC1Q96CN9 775 aa22.7■■□□□ 1.22
UBQLN4-201ENST00000368309 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
UBQLN4-201ENST00000368309 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
UBQLN4-201ENST00000368309 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.7■■□□□ 1.22
UBQLN4-201ENST00000368309 PIK3R4Q99570 1358 aa22.69■■□□□ 1.22
UBQLN4-201ENST00000368309 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.69■■□□□ 1.22
UBQLN4-201ENST00000368309 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.68■■□□□ 1.22
UBQLN4-201ENST00000368309 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.67■■□□□ 1.22
UBQLN4-201ENST00000368309 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.67■■□□□ 1.22
UBQLN4-201ENST00000368309 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.66■■□□□ 1.22
UBQLN4-201ENST00000368309 C3P01024 1663 aa22.66■■□□□ 1.22
UBQLN4-201ENST00000368309 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.66■■□□□ 1.22
UBQLN4-201ENST00000368309 FOXO3O43524 673 aa22.65■■□□□ 1.22
UBQLN4-201ENST00000368309 EID1Q9Y6B2 187 aa22.65■■□□□ 1.22
UBQLN4-201ENST00000368309 CHL1O00533 1208 aa22.65■■□□□ 1.22
UBQLN4-201ENST00000368309 USP6P35125 1406 aa22.64■■□□□ 1.21
UBQLN4-201ENST00000368309 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
UBQLN4-201ENST00000368309 PTPRUQ92729 1446 aa22.63■■□□□ 1.21
UBQLN4-201ENST00000368309 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.63■■□□□ 1.21
UBQLN4-201ENST00000368309 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.63■■□□□ 1.21
UBQLN4-201ENST00000368309 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
UBQLN4-201ENST00000368309 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.62■■□□□ 1.21
UBQLN4-201ENST00000368309 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.62■■□□□ 1.21
UBQLN4-201ENST00000368309 HSCBQ8IWL3 235 aa22.62■■□□□ 1.21
UBQLN4-201ENST00000368309 AKAP12Q02952 1782 aa22.62■■□□□ 1.21
UBQLN4-201ENST00000368309 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.62■■□□□ 1.21
UBQLN4-201ENST00000368309 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.62■■□□□ 1.21
UBQLN4-201ENST00000368309 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.62■■□□□ 1.21
UBQLN4-201ENST00000368309 ITSN1Q15811 1721 aa22.61■■□□□ 1.21
UBQLN4-201ENST00000368309 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
UBQLN4-201ENST00000368309 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.6■■□□□ 1.21
UBQLN4-201ENST00000368309 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
UBQLN4-201ENST00000368309 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
UBQLN4-201ENST00000368309 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
UBQLN4-201ENST00000368309 APBB1O00213 710 aa22.58■■□□□ 1.21
UBQLN4-201ENST00000368309 SLC4A2P04920 1241 aa22.58■■□□□ 1.21
UBQLN4-201ENST00000368309 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.58■■□□□ 1.2
UBQLN4-201ENST00000368309 AMPHP49418 695 aa22.57■■□□□ 1.2
UBQLN4-201ENST00000368309 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.57■■□□□ 1.2
UBQLN4-201ENST00000368309 DCTPP1Q9H773 170 aa22.56■■□□□ 1.2
UBQLN4-201ENST00000368309 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
UBQLN4-201ENST00000368309 USP31Q70CQ4 1352 aa22.56■■□□□ 1.2
UBQLN4-201ENST00000368309 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
UBQLN4-201ENST00000368309 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.55■■□□□ 1.2
UBQLN4-201ENST00000368309 MEIS3Q99687 375 aa22.55■■□□□ 1.2
UBQLN4-201ENST00000368309 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.55■■□□□ 1.2
UBQLN4-201ENST00000368309 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
UBQLN4-201ENST00000368309 EYA1Q99502 592 aa22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms