RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365444.1

SNORD6-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 6, humanhuman

BASIC

Gene SNORD6, Length 73 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleolus, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD6-201ENST00000365444 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 PRR12Q9ULL5 1215 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 AKAP2Q9Y2D5 859 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 CARNS1A5YM72 827 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 KIF3CO14782 793 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 SEMA3EO15041 775 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 HMMRO75330 724 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 ATG7O95352 703 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 FAM163BP0C2L3 166 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 ZNF853P0CG23 659 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 NAT2P11245 290 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 MS4A1P11836 297 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 TRPC1P48995 793 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 PLEKHG6Q3KR16 790 aa4.57□□□□□ -1.68
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SNORD6-201ENST00000365444 SDE2Q6IQ49 451 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 NYAP1Q6ZVC0 841 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 CATIPQ7Z7H3 387 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 CADPS2Q86UW7 1296 aa4.57□□□□□ -1.68
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SNORD6-201ENST00000365444 IL17RAQ96F46 866 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 CFAP53Q96M91 514 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 AGAP3Q96P47 875 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 NCAPGQ9BPX3 1015 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 DONSONQ9NYP3 566 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 USTQ9Y2C2 406 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 TBX22Q9Y458 520 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 TBC1D12O60347 775 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 MTA2O94776 668 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 FGAP02671 866 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 CAPN2P17655 700 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 CD53P19397 219 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 ABCD1P33897 745 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 CLCN1P35523 988 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 TERF1P54274 439 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 POLA2Q14181 598 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 TTC30AQ86WT1 665 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 DRC7Q8IY82 874 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 JMYQ8N9B5 988 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 VPS37AQ8NEZ2 397 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 SLC39A13Q96H72 371 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 SLX1AQ9BQ83 275 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 TBC1D2Q9BYX2 928 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 TSPYL1Q9H0U9 437 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 SPC25Q9HBM1 224 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 ODF2LQ9ULJ1 636 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 IL16Q14005 1332 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 COL6A1P12109 1028 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 KCNA2P16389 499 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 ATICP31939 592 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 CLK1P49759 484 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 KCTD2Q14681 263 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 COL19A1Q14993 1142 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 TCEAL1Q15170 157 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 AMOTQ4VCS5 1084 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 CCDC70Q6NSX1 233 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 CCDC174Q6PII3 467 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 KRT77Q7Z794 578 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 MICALL1Q8N3F8 863 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 SAMD3Q8N6K7 520 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 STAG1Q8WVM7 1258 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 SMC4Q9NTJ3 1288 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 ANKRD33BA6NCL7 494 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 HIP1RO75146 1068 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 LDHCP07864 332 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 INHBEP58166 350 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP4.54□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 E2F5Q15329 346 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 MFSD4BQ5TF39 518 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 NUTM2GQ5VZR2 741 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 NPAS4Q8IUM7 802 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 HSCBQ8IWL3 235 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SNORD6-201ENST00000365444 CCDC102AQ96A19 550 aa4.54□□□□□ -1.68
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