RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365174.1

RNA5SP223-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 223, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP223, Length 120 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP223-201ENST00000365174 C1orf115Q9H7X2 142 aa6.8□□□□□ -1.32
RNA5SP223-201ENST00000365174 RCAN3Q9UKA8 241 aa6.8□□□□□ -1.32
RNA5SP223-201ENST00000365174 KIF1AQ12756 1690 aa6.8□□□□□ -1.32
RNA5SP223-201ENST00000365174 HSPA2P54652 639 aa6.79□□□□□ -1.32
RNA5SP223-201ENST00000365174 NLRP6P59044 892 aa6.79□□□□□ -1.32
RNA5SP223-201ENST00000365174 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RNA5SP223-201ENST00000365174 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RNA5SP223-201ENST00000365174 LMOD3Q0VAK6 560 aa6.79□□□□□ -1.32
RNA5SP223-201ENST00000365174 ERICH6BQ5W0A0 696 aa6.79□□□□□ -1.32
RNA5SP223-201ENST00000365174 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RNA5SP223-201ENST00000365174 ABTB2Q8N961 1025 aa6.79□□□□□ -1.32
RNA5SP223-201ENST00000365174 PKNOX2Q96KN3 472 aa6.79□□□□□ -1.32
RNA5SP223-201ENST00000365174 MYH16Q9H6N6 1097 aa6.79□□□□□ -1.32
RNA5SP223-201ENST00000365174 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa6.78□□□□□ -1.32
RNA5SP223-201ENST00000365174 DCCP43146 1447 aa6.78□□□□□ -1.32
RNA5SP223-201ENST00000365174 OVOS2Q6IE36 1432 aa6.78□□□□□ -1.32
RNA5SP223-201ENST00000365174 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RNA5SP223-201ENST00000365174 LMOD2Q6P5Q4 547 aa6.78□□□□□ -1.32
RNA5SP223-201ENST00000365174 CADPS2Q86UW7 1296 aa6.78□□□□□ -1.32
RNA5SP223-201ENST00000365174 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RNA5SP223-201ENST00000365174 IQSEC2Q5JU85 1478 aa6.78□□□□□ -1.32
RNA5SP223-201ENST00000365174 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa6.77□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 LRRC7Q96NW7 1537 aa6.77□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 FGD1P98174 961 aa6.77□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 TICAM2Q86XR7 235 aa6.77□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 TCP11L2Q8N4U5 519 aa6.77□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 C19orf44Q9H6X5 657 aa6.77□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 POLKQ9UBT6 870 aa6.77□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 DMRT2Q9Y5R5 561 aa6.77□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa6.77□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 FLT4P35916 1363 aa6.77□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 FCHSD2O94868 740 aa6.76□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 CLSTN1O94985 981 aa6.76□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 PRKAR2BP31323 418 aa6.76□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 RRP1P56182 461 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 KCNH5Q8NCM2 988 aa6.76□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 ZRANB1Q9UGI0 708 aa6.76□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 SBNO1A3KN83 1393 aa6.76□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 TMEM94Q12767 1356 aa6.76□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 LMTK3Q96Q04 1460 aa6.76□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 PIK3C2AO00443 1686 aa6.75□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 C1orf167Q5SNV9 1468 aa6.75□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 RTL1A6NKG5 1358 aa6.75□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 USP31Q70CQ4 1352 aa6.75□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 PNPLA6Q8IY17 1366 aa6.75□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa6.75□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 HMOX1P09601 288 aa6.75□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 RBM25P49756 843 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 CCDC27Q2M243 656 aa6.75□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 NUTM2GQ5VZR2 741 aa6.75□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 WDR63Q8IWG1 891 aa6.75□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 CDCA7LQ96GN5 454 aa6.75□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 PPP4R2Q9NY27 417 aa6.75□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 NPHP3Q7Z494 1330 aa6.75□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 ARHGEF10O15013 1369 aa6.74□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 KIF24Q5T7B8 1368 aa6.74□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 TMPOP42166 694 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 RIPK4P57078 832 aa6.74□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 SLFN5Q08AF3 891 aa6.74□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.74□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 WWC1Q8IX03 1113 aa6.74□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 CCDC136Q96JN2 1154 aa6.74□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 TRAIPQ9BWF2 469 aa6.74□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 MTMR7Q9Y216 660 aa6.74□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 MAP3K19Q56UN5 1328 aa6.74□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 FOXO3O43524 673 aa6.73□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 NFE2L2Q16236 605 aa6.73□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 DUSP27Q5VZP5 1158 aa6.73□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa6.73□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 SULT6B1Q6IMI4 303 aa6.73□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 KRT28Q7Z3Y7 464 aa6.73□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 PSMD1Q99460 953 aa6.73□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 USP54Q70EL1 1684 aa6.73□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 SSH2Q76I76 1423 aa6.73□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 ZNF521Q96K83 1311 aa6.73□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 FBLN1P23142 703 aa6.72□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 IL13P35225 146 aa6.72□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 GAS2L2Q8NHY3 880 aa6.72□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 ORAI2Q96SN7 254 aa6.72□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 MST1RQ04912 1400 aa6.72□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 IL16Q14005 1332 aa6.72□□□□□ -1.33
RNA5SP223-201ENST00000365174 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 MS4A1P11836 297 aa6.71□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 PLEKHF1Q96S99 279 aa6.71□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 LTN1O94822 1766 aa6.7□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 STRCQ7RTU9 1775 aa6.7□□□□□ -1.34
RNA5SP223-201ENST00000365174 TNS3Q68CZ2 1445 aa6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms