RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
PDE4D-204ENST00000358923 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.12■■□□□ 1.29
PDE4D-204ENST00000358923 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PDE4D-204ENST00000358923 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PDE4D-204ENST00000358923 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PDE4D-204ENST00000358923 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PDE4D-204ENST00000358923 ITSN1Q15811 1721 aa23.11■■□□□ 1.29
PDE4D-204ENST00000358923 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.11■■□□□ 1.29
PDE4D-204ENST00000358923 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.11■■□□□ 1.29
PDE4D-204ENST00000358923 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
PDE4D-204ENST00000358923 FCHSD2O94868 740 aa23.1■■□□□ 1.29
PDE4D-204ENST00000358923 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
PDE4D-204ENST00000358923 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.09■■□□□ 1.29
PDE4D-204ENST00000358923 ADGRB2O60241 1585 aa23.09■■□□□ 1.29
PDE4D-204ENST00000358923 AKAP12Q02952 1782 aa23.09■■□□□ 1.29
PDE4D-204ENST00000358923 WDR63Q8IWG1 891 aa23.08■■□□□ 1.29
PDE4D-204ENST00000358923 COG6Q9Y2V7 657 aa23.08■■□□□ 1.29
PDE4D-204ENST00000358923 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
PDE4D-204ENST00000358923 PSME1Q06323 249 aa23.07■■□□□ 1.28
PDE4D-204ENST00000358923 AMPHP49418 695 aa23.07■■□□□ 1.28
PDE4D-204ENST00000358923 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.07■■□□□ 1.28
PDE4D-204ENST00000358923 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.07■■□□□ 1.28
PDE4D-204ENST00000358923 SSH2Q76I76 1423 aa23.06■■□□□ 1.28
PDE4D-204ENST00000358923 RLBP1P12271 317 aa23.06■■□□□ 1.28
PDE4D-204ENST00000358923 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.05■■□□□ 1.28
PDE4D-204ENST00000358923 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.05■■□□□ 1.28
PDE4D-204ENST00000358923 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.04■■□□□ 1.28
PDE4D-204ENST00000358923 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.04■■□□□ 1.28
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC27Q2M243 656 aa23.04■■□□□ 1.28
PDE4D-204ENST00000358923 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.03■■□□□ 1.28
PDE4D-204ENST00000358923 NEFMP07197 916 aa23.03■■□□□ 1.28
PDE4D-204ENST00000358923 MCM10Q7L590 875 aa23.03■■□□□ 1.28
PDE4D-204ENST00000358923 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PDE4D-204ENST00000358923 NFE2L2Q16236 605 aa23.02■■□□□ 1.28
PDE4D-204ENST00000358923 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.02■■□□□ 1.28
PDE4D-204ENST00000358923 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.01■■□□□ 1.27
PDE4D-204ENST00000358923 USP35Q9P2H5 1018 aa23.01■■□□□ 1.27
PDE4D-204ENST00000358923 PIK3R4Q99570 1358 aa23.01■■□□□ 1.27
PDE4D-204ENST00000358923 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.01■■□□□ 1.27
PDE4D-204ENST00000358923 TSPYL6Q8N831 410 aa23.01■■□□□ 1.27
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PDE4D-204ENST00000358923 KRT24Q2M2I5 525 aa23■■□□□ 1.27
PDE4D-204ENST00000358923 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23■■□□□ 1.27
PDE4D-204ENST00000358923 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PDE4D-204ENST00000358923 PEAK1Q9H792 1746 aa22.99■■□□□ 1.27
PDE4D-204ENST00000358923 NGEFQ8N5V2 710 aa22.99■■□□□ 1.27
PDE4D-204ENST00000358923 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.98■■□□□ 1.27
PDE4D-204ENST00000358923 EYA1Q99502 592 aa22.98■■□□□ 1.27
PDE4D-204ENST00000358923 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.97■■□□□ 1.27
PDE4D-204ENST00000358923 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PDE4D-204ENST00000358923 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.97■■□□□ 1.27
PDE4D-204ENST00000358923 PIK3C2AO00443 1686 aa22.95■■□□□ 1.26
PDE4D-204ENST00000358923 USP31Q70CQ4 1352 aa22.95■■□□□ 1.26
PDE4D-204ENST00000358923 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.95■■□□□ 1.26
PDE4D-204ENST00000358923 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.94■■□□□ 1.26
PDE4D-204ENST00000358923 MBIPQ9NS73 344 aa22.94■■□□□ 1.26
PDE4D-204ENST00000358923 HOXC9P31274 260 aa22.93■■□□□ 1.26
PDE4D-204ENST00000358923 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.93■■□□□ 1.26
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM94Q12767 1356 aa22.93■■□□□ 1.26
PDE4D-204ENST00000358923 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PDE4D-204ENST00000358923 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.92■■□□□ 1.26
PDE4D-204ENST00000358923 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PDE4D-204ENST00000358923 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PDE4D-204ENST00000358923 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.91■■□□□ 1.26
PDE4D-204ENST00000358923 IGHDP01880 384 aa22.91■■□□□ 1.26
PDE4D-204ENST00000358923 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.91■■□□□ 1.26
PDE4D-204ENST00000358923 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PDE4D-204ENST00000358923 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PDE4D-204ENST00000358923 FLT4P35916 1363 aa22.89■■□□□ 1.25
PDE4D-204ENST00000358923 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.89■■□□□ 1.25
PDE4D-204ENST00000358923 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.88■■□□□ 1.25
PDE4D-204ENST00000358923 TRIM27P14373 513 aa22.87■■□□□ 1.25
PDE4D-204ENST00000358923 SBNO1A3KN83 1393 aa22.87■■□□□ 1.25
PDE4D-204ENST00000358923 ATF3P18847 181 aa22.86■■□□□ 1.25
PDE4D-204ENST00000358923 RGS3P49796 1198 aa22.86■■□□□ 1.25
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PDE4D-204ENST00000358923 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.84■■□□□ 1.25
PDE4D-204ENST00000358923 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PDE4D-204ENST00000358923 NBPF4Q96M43 638 aa22.84■■□□□ 1.25
PDE4D-204ENST00000358923 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.84■■□□□ 1.25
PDE4D-204ENST00000358923 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.84■■□□□ 1.25
PDE4D-204ENST00000358923 GCP02774 474 aa22.84■■□□□ 1.25
PDE4D-204ENST00000358923 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.83■■□□□ 1.25
PDE4D-204ENST00000358923 VAMP4O75379 141 aa22.82■■□□□ 1.24
PDE4D-204ENST00000358923 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PDE4D-204ENST00000358923 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.82■■□□□ 1.24
PDE4D-204ENST00000358923 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.82■■□□□ 1.24
PDE4D-204ENST00000358923 PDE3AQ14432 1141 aa22.81■■□□□ 1.24
PDE4D-204ENST00000358923 GSE1Q14687 1217 aa22.81■■□□□ 1.24
PDE4D-204ENST00000358923 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.81■■□□□ 1.24
PDE4D-204ENST00000358923 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.81■■□□□ 1.24
PDE4D-204ENST00000358923 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.81■■□□□ 1.24
PDE4D-204ENST00000358923 IL16Q14005 1332 aa22.81■■□□□ 1.24
PDE4D-204ENST00000358923 NECTIN2Q92692 538 aa22.8■■□□□ 1.24
PDE4D-204ENST00000358923 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PDE4D-204ENST00000358923 CFAP44Q96MT7 982 aa22.8■■□□□ 1.24
PDE4D-204ENST00000358923 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.8■■□□□ 1.24
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF853P0CG23 659 aa22.8■■□□□ 1.24
PDE4D-204ENST00000358923 GNAI1P63096 354 aa22.8■■□□□ 1.24
PDE4D-204ENST00000358923 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms