RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
SPNS1-204ENST00000352260 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa23.98■■□□□ 1.43
SPNS1-204ENST00000352260 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.98■■□□□ 1.43
SPNS1-204ENST00000352260 GSE1Q14687 1217 aa23.98■■□□□ 1.43
SPNS1-204ENST00000352260 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.98■■□□□ 1.43
SPNS1-204ENST00000352260 PRKAR2BP31323 418 aa23.97■■□□□ 1.43
SPNS1-204ENST00000352260 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
SPNS1-204ENST00000352260 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.95■■□□□ 1.43
SPNS1-204ENST00000352260 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.95■■□□□ 1.42
SPNS1-204ENST00000352260 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
SPNS1-204ENST00000352260 BCAR3O75815 825 aa23.94■■□□□ 1.42
SPNS1-204ENST00000352260 HMOX1P09601 288 aa23.94■■□□□ 1.42
SPNS1-204ENST00000352260 RIPK4P57078 832 aa23.94■■□□□ 1.42
SPNS1-204ENST00000352260 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
SPNS1-204ENST00000352260 PIK3C2AO00443 1686 aa23.94■■□□□ 1.42
SPNS1-204ENST00000352260 NWD1Q149M9 1564 aa23.94■■□□□ 1.42
SPNS1-204ENST00000352260 PEAK1Q9H792 1746 aa23.92■■□□□ 1.42
SPNS1-204ENST00000352260 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.92■■□□□ 1.42
SPNS1-204ENST00000352260 IL16Q14005 1332 aa23.91■■□□□ 1.42
SPNS1-204ENST00000352260 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.9■■□□□ 1.42
SPNS1-204ENST00000352260 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
SPNS1-204ENST00000352260 NFE2L2Q16236 605 aa23.89■■□□□ 1.42
SPNS1-204ENST00000352260 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.89■■□□□ 1.42
SPNS1-204ENST00000352260 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
SPNS1-204ENST00000352260 SOX12O15370 315 aa23.87■■□□□ 1.41
SPNS1-204ENST00000352260 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
SPNS1-204ENST00000352260 USP54Q70EL1 1684 aa23.86■■□□□ 1.41
SPNS1-204ENST00000352260 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.86■■□□□ 1.41
SPNS1-204ENST00000352260 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
SPNS1-204ENST00000352260 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
SPNS1-204ENST00000352260 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.84■■□□□ 1.41
SPNS1-204ENST00000352260 NLRP6P59044 892 aa23.84■■□□□ 1.41
SPNS1-204ENST00000352260 SBNO1A3KN83 1393 aa23.84■■□□□ 1.41
SPNS1-204ENST00000352260 NFKBIBQ15653 356 aa23.83■■□□□ 1.41
SPNS1-204ENST00000352260 C14orf37Q86TY3 774 aa23.83■■□□□ 1.41
SPNS1-204ENST00000352260 RGPD1P0DJD0 1748 aa23.83■■□□□ 1.4
SPNS1-204ENST00000352260 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
SPNS1-204ENST00000352260 FLT4P35916 1363 aa23.82■■□□□ 1.4
SPNS1-204ENST00000352260 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
SPNS1-204ENST00000352260 PDE3AQ14432 1141 aa23.8■■□□□ 1.4
SPNS1-204ENST00000352260 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
SPNS1-204ENST00000352260 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.8■■□□□ 1.4
SPNS1-204ENST00000352260 ESCO1Q5FWF5 840 aa23.8■■□□□ 1.4
SPNS1-204ENST00000352260 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.8■■□□□ 1.4
SPNS1-204ENST00000352260 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.8■■□□□ 1.4
SPNS1-204ENST00000352260 ABTB2Q8N961 1025 aa23.8■■□□□ 1.4
SPNS1-204ENST00000352260 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM94Q12767 1356 aa23.79■■□□□ 1.4
SPNS1-204ENST00000352260 ARHGEF10O15013 1369 aa23.77■■□□□ 1.4
SPNS1-204ENST00000352260 AMPHP49418 695 aa23.77■■□□□ 1.4
SPNS1-204ENST00000352260 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
SPNS1-204ENST00000352260 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.76■■□□□ 1.39
SPNS1-204ENST00000352260 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.76■■□□□ 1.39
SPNS1-204ENST00000352260 DLG5Q8TDM6 1919 aa23.76■■□□□ 1.39
SPNS1-204ENST00000352260 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SPNS1-204ENST00000352260 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.76■■□□□ 1.39
SPNS1-204ENST00000352260 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.76■■□□□ 1.39
SPNS1-204ENST00000352260 FBXO41Q8TF61 875 aa23.76■■□□□ 1.39
SPNS1-204ENST00000352260 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
SPNS1-204ENST00000352260 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
SPNS1-204ENST00000352260 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.75■■□□□ 1.39
SPNS1-204ENST00000352260 PSME1Q06323 249 aa23.74■■□□□ 1.39
SPNS1-204ENST00000352260 PANK1Q8TE04 598 aa23.74■■□□□ 1.39
SPNS1-204ENST00000352260 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
SPNS1-204ENST00000352260 ORAI2Q96SN7 254 aa23.73■■□□□ 1.39
SPNS1-204ENST00000352260 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
SPNS1-204ENST00000352260 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
SPNS1-204ENST00000352260 IFT57Q9NWB7 429 aa23.72■■□□□ 1.39
SPNS1-204ENST00000352260 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.72■■□□□ 1.39
SPNS1-204ENST00000352260 HOXC9P31274 260 aa23.71■■□□□ 1.39
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF853P0CG23 659 aa23.71■■□□□ 1.39
SPNS1-204ENST00000352260 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
SPNS1-204ENST00000352260 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.7■■□□□ 1.38
SPNS1-204ENST00000352260 GNAI1P63096 354 aa23.7■■□□□ 1.38
SPNS1-204ENST00000352260 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.7■■□□□ 1.38
SPNS1-204ENST00000352260 TNNQ9UQP3 1299 aa23.7■■□□□ 1.38
SPNS1-204ENST00000352260 COG6Q9Y2V7 657 aa23.7■■□□□ 1.38
SPNS1-204ENST00000352260 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.7■■□□□ 1.38
SPNS1-204ENST00000352260 FAM161AQ3B820 660 aa23.69■■□□□ 1.38
SPNS1-204ENST00000352260 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.69■■□□□ 1.38
SPNS1-204ENST00000352260 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.69■■□□□ 1.38
SPNS1-204ENST00000352260 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.69■■□□□ 1.38
SPNS1-204ENST00000352260 KDRP35968 1356 aa23.69■■□□□ 1.38
SPNS1-204ENST00000352260 FAM83GA6ND36 823 aa23.69■■□□□ 1.38
SPNS1-204ENST00000352260 EYA1Q99502 592 aa23.69■■□□□ 1.38
SPNS1-204ENST00000352260 NFAT5O94916 1531 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-204ENST00000352260 RTL1A6NKG5 1358 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-204ENST00000352260 RLBP1P12271 317 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-204ENST00000352260 KIF1AQ12756 1690 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-204ENST00000352260 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-204ENST00000352260 FOXO3O43524 673 aa23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-204ENST00000352260 DCTN1Q14203 1278 aa23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-204ENST00000352260 MBIPQ9NS73 344 aa23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-204ENST00000352260 CFAP44Q96MT7 982 aa23.65■■□□□ 1.38
SPNS1-204ENST00000352260 TOM1O60784 492 aa23.65■■□□□ 1.38
SPNS1-204ENST00000352260 LTN1O94822 1766 aa23.65■■□□□ 1.38
SPNS1-204ENST00000352260 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.65■■□□□ 1.38
SPNS1-204ENST00000352260 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
SPNS1-204ENST00000352260 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.64■■□□□ 1.37
SPNS1-204ENST00000352260 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
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