RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325558.10

PGA3-201, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGA3, Length 1,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-201ENST00000325558 RLBP1P12271 317 aa14.62□□□□□ -0.07
PGA3-201ENST00000325558 PANK1Q8TE04 598 aa14.62□□□□□ -0.07
PGA3-201ENST00000325558 KIF24Q5T7B8 1368 aa14.62□□□□□ -0.07
PGA3-201ENST00000325558 MAP3K19Q56UN5 1328 aa14.62□□□□□ -0.07
PGA3-201ENST00000325558 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa14.61□□□□□ -0.07
PGA3-201ENST00000325558 SBNO1A3KN83 1393 aa14.61□□□□□ -0.07
PGA3-201ENST00000325558 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PGA3-201ENST00000325558 SSH1Q8WYL5 1049 aa14.61□□□□□ -0.07
PGA3-201ENST00000325558 ZNF428Q96B54 188 aa14.61□□□□□ -0.07
PGA3-201ENST00000325558 TNNQ9UQP3 1299 aa14.61□□□□□ -0.07
PGA3-201ENST00000325558 KDRP35968 1356 aa14.6□□□□□ -0.07
PGA3-201ENST00000325558 IFT57Q9NWB7 429 aa14.6□□□□□ -0.07
PGA3-201ENST00000325558 ALDH1L2Q3SY69 923 aa14.59□□□□□ -0.07
PGA3-201ENST00000325558 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.59□□□□□ -0.07
PGA3-201ENST00000325558 COG6Q9Y2V7 657 aa14.59□□□□□ -0.07
PGA3-201ENST00000325558 ARHGEF10O15013 1369 aa14.58□□□□□ -0.07
PGA3-201ENST00000325558 FLT4P35916 1363 aa14.58□□□□□ -0.07
PGA3-201ENST00000325558 IGHDP01880 384 aa14.58□□□□□ -0.07
PGA3-201ENST00000325558 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
PGA3-201ENST00000325558 AEBP1Q8IUX7 1158 aa14.58□□□□□ -0.07
PGA3-201ENST00000325558 VAMP4O75379 141 aa14.58□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 NEFMP07197 916 aa14.58□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa14.58□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 MSH5O43196 834 aa14.57□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 GNAI1P63096 354 aa14.57□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 LMOD3Q0VAK6 560 aa14.57□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 SULT6B1Q6IMI4 303 aa14.57□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 CFAP44Q96MT7 982 aa14.57□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 BCL2L13Q9BXK5 485 aa14.57□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 BACH2Q9BYV9 841 aa14.57□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 PHF8Q9UPP1 1060 aa14.57□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 IGSF1Q8N6C5 1336 aa14.56□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 PDE4AP27815 886 aa14.55□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa14.55□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 TRIM27P14373 513 aa14.55□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 SKAP1Q86WV1 359 aa14.55□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 MBIPQ9NS73 344 aa14.55□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 NFAT5O94916 1531 aa14.54□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 NLRP6P59044 892 aa14.54□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa14.54□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 SMC4Q9NTJ3 1288 aa14.53□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 FAM83GA6ND36 823 aa14.52□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 CHL1O00533 1208 aa14.52□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 CANXP27824 592 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 ARHGAP45Q92619 1136 aa14.52□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 EYA1Q99502 592 aa14.52□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 CRB1P82279 1406 aa14.52□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 MST1RQ04912 1400 aa14.52□□□□□ -0.08
PGA3-201ENST00000325558 HOXC9P31274 260 aa14.52□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 TSPYL6Q8N831 410 aa14.52□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 RTL1A6NKG5 1358 aa14.51□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 KIF16BQ96L93 1317 aa14.5□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 ABTB2Q8N961 1025 aa14.5□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 LTN1O94822 1766 aa14.5□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 KIAA0232Q92628 1395 aa14.5□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 DCTN1Q14203 1278 aa14.49□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 C8orf58Q8NAV2 365 aa14.49□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 STRCP1A6NGW2 1772 aa14.49□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 SLIT3O75094 1523 aa14.49□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 AMPHP49418 695 aa14.49□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa14.48□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa14.48□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 LRRC37A3O60309 1634 aa14.48□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 TMEM57Q8N5G2 664 aa14.47□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 IP6K1Q92551 441 aa14.47□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 DDX19BQ9UMR2 479 aa14.47□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 KIF1AQ12756 1690 aa14.47□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 C1orf167Q5SNV9 1468 aa14.46□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 SOX12O15370 315 aa14.46□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 ESCO1Q5FWF5 840 aa14.46□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 ORAI2Q96SN7 254 aa14.46□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
PGA3-201ENST00000325558 C19orf44Q9H6X5 657 aa14.46□□□□□ -0.1
PGA3-201ENST00000325558 NCAPD2Q15021 1401 aa14.46□□□□□ -0.1
PGA3-201ENST00000325558 ABCC4O15439 1325 aa14.45□□□□□ -0.1
PGA3-201ENST00000325558 PSME1Q06323 249 aa14.45□□□□□ -0.1
PGA3-201ENST00000325558 C8orf34Q49A92 452 aa14.45□□□□□ -0.1
PGA3-201ENST00000325558 NUTM2GQ5VZR2 741 aa14.45□□□□□ -0.1
PGA3-201ENST00000325558 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
PGA3-201ENST00000325558 USP19O94966 1318 aa14.45□□□□□ -0.1
PGA3-201ENST00000325558 FOXO3O43524 673 aa14.44□□□□□ -0.1
PGA3-201ENST00000325558 MCM10Q7L590 875 aa14.44□□□□□ -0.1
PGA3-201ENST00000325558 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
PGA3-201ENST00000325558 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
PGA3-201ENST00000325558 KCNH5Q8NCM2 988 aa14.44□□□□□ -0.1
PGA3-201ENST00000325558 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms