RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320857.7

SSR4-201, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SSR4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-201ENST00000320857 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SSR4-201ENST00000320857 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SSR4-201ENST00000320857 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SSR4-201ENST00000320857 CERKQ8TCT0 537 aa21.96■■□□□ 1.11
SSR4-201ENST00000320857 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SSR4-201ENST00000320857 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.94■■□□□ 1.1
SSR4-201ENST00000320857 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.94■■□□□ 1.1
SSR4-201ENST00000320857 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.94■■□□□ 1.1
SSR4-201ENST00000320857 PEAK1Q9H792 1746 aa21.94■■□□□ 1.1
SSR4-201ENST00000320857 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SSR4-201ENST00000320857 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa21.93■■□□□ 1.1
SSR4-201ENST00000320857 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SSR4-201ENST00000320857 NLRP6P59044 892 aa21.92■■□□□ 1.1
SSR4-201ENST00000320857 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.92■■□□□ 1.1
SSR4-201ENST00000320857 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SSR4-201ENST00000320857 SBNO1A3KN83 1393 aa21.91■■□□□ 1.1
SSR4-201ENST00000320857 FLT4P35916 1363 aa21.9■■□□□ 1.1
SSR4-201ENST00000320857 MSH6P52701 1360 aa21.9■■□□□ 1.1
SSR4-201ENST00000320857 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.9■■□□□ 1.1
SSR4-201ENST00000320857 ABTB2Q8N961 1025 aa21.9■■□□□ 1.1
SSR4-201ENST00000320857 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SSR4-201ENST00000320857 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa21.89■■□□□ 1.1
SSR4-201ENST00000320857 SOX12O15370 315 aa21.88■■□□□ 1.09
SSR4-201ENST00000320857 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SSR4-201ENST00000320857 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SSR4-201ENST00000320857 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SSR4-201ENST00000320857 ATF3P18847 181 aa21.88■■□□□ 1.09
SSR4-201ENST00000320857 PSME1Q06323 249 aa21.88■■□□□ 1.09
SSR4-201ENST00000320857 AAMPQ13685 434 aa21.88■■□□□ 1.09
SSR4-201ENST00000320857 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.87■■□□□ 1.09
SSR4-201ENST00000320857 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.87■■□□□ 1.09
SSR4-201ENST00000320857 MS4A1P11836 297 aa21.87■■□□□ 1.09
SSR4-201ENST00000320857 DCCP43146 1447 aa21.87■■□□□ 1.09
SSR4-201ENST00000320857 AMPHP49418 695 aa21.87■■□□□ 1.09
SSR4-201ENST00000320857 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.87■■□□□ 1.09
SSR4-201ENST00000320857 ORAI2Q96SN7 254 aa21.87■■□□□ 1.09
SSR4-201ENST00000320857 ARHGEF10O15013 1369 aa21.87■■□□□ 1.09
SSR4-201ENST00000320857 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.86■■□□□ 1.09
SSR4-201ENST00000320857 GNAI1P63096 354 aa21.86■■□□□ 1.09
SSR4-201ENST00000320857 IFT57Q9NWB7 429 aa21.86■■□□□ 1.09
SSR4-201ENST00000320857 KIF1AQ12756 1690 aa21.86■■□□□ 1.09
SSR4-201ENST00000320857 RGPD1P0DJD0 1748 aa21.86■■□□□ 1.09
SSR4-201ENST00000320857 PANK1Q8TE04 598 aa21.85■■□□□ 1.09
SSR4-201ENST00000320857 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.85■■□□□ 1.09
SSR4-201ENST00000320857 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.85■■□□□ 1.09
SSR4-201ENST00000320857 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.84■■□□□ 1.09
SSR4-201ENST00000320857 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.84■■□□□ 1.09
SSR4-201ENST00000320857 ZNF428Q96B54 188 aa21.84■■□□□ 1.09
SSR4-201ENST00000320857 UBAP1LF5GYI3 381 aa21.83■■□□□ 1.09
SSR4-201ENST00000320857 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.83■■□□□ 1.09
SSR4-201ENST00000320857 COG6Q9Y2V7 657 aa21.83■■□□□ 1.09
SSR4-201ENST00000320857 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SSR4-201ENST00000320857 MST1RQ04912 1400 aa21.82■■□□□ 1.08
SSR4-201ENST00000320857 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.82■■□□□ 1.08
SSR4-201ENST00000320857 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.82■■□□□ 1.08
SSR4-201ENST00000320857 FOXO3O43524 673 aa21.81■■□□□ 1.08
SSR4-201ENST00000320857 ZNF853P0CG23 659 aa21.81■■□□□ 1.08
SSR4-201ENST00000320857 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.81■■□□□ 1.08
SSR4-201ENST00000320857 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.81■■□□□ 1.08
SSR4-201ENST00000320857 PIP4K2BP78356 416 aa21.8■■□□□ 1.08
SSR4-201ENST00000320857 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
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SSR4-201ENST00000320857 TOM1O60784 492 aa21.79■■□□□ 1.08
SSR4-201ENST00000320857 RTL1A6NKG5 1358 aa21.78■■□□□ 1.08
SSR4-201ENST00000320857 NFAT5O94916 1531 aa21.78■■□□□ 1.08
SSR4-201ENST00000320857 HOXC9P31274 260 aa21.78■■□□□ 1.08
SSR4-201ENST00000320857 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SSR4-201ENST00000320857 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SSR4-201ENST00000320857 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.78■■□□□ 1.08
SSR4-201ENST00000320857 KIF16BQ96L93 1317 aa21.78■■□□□ 1.08
SSR4-201ENST00000320857 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SSR4-201ENST00000320857 RLBP1P12271 317 aa21.77■■□□□ 1.08
SSR4-201ENST00000320857 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.77■■□□□ 1.08
SSR4-201ENST00000320857 SLAIN2Q9P270 581 aa21.77■■□□□ 1.08
SSR4-201ENST00000320857 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.77■■□□□ 1.08
SSR4-201ENST00000320857 KDRP35968 1356 aa21.77■■□□□ 1.08
SSR4-201ENST00000320857 KRT28Q7Z3Y7 464 aa21.76■■□□□ 1.07
SSR4-201ENST00000320857 MBIPQ9NS73 344 aa21.76■■□□□ 1.07
SSR4-201ENST00000320857 LTN1O94822 1766 aa21.76■■□□□ 1.07
SSR4-201ENST00000320857 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
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SSR4-201ENST00000320857 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.75■■□□□ 1.07
SSR4-201ENST00000320857 EYA1Q99502 592 aa21.75■■□□□ 1.07
SSR4-201ENST00000320857 TNNQ9UQP3 1299 aa21.75■■□□□ 1.07
SSR4-201ENST00000320857 SLIT3O75094 1523 aa21.74■■□□□ 1.07
SSR4-201ENST00000320857 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SSR4-201ENST00000320857 FAM83GA6ND36 823 aa21.73■■□□□ 1.07
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SSR4-201ENST00000320857 VAMP4O75379 141 aa21.72■■□□□ 1.07
SSR4-201ENST00000320857 TRIM27P14373 513 aa21.72■■□□□ 1.07
SSR4-201ENST00000320857 DCTN1Q14203 1278 aa21.72■■□□□ 1.07
SSR4-201ENST00000320857 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.72■■□□□ 1.07
SSR4-201ENST00000320857 IP6K1Q92551 441 aa21.72■■□□□ 1.07
SSR4-201ENST00000320857 USP19O94966 1318 aa21.71■■□□□ 1.07
SSR4-201ENST00000320857 ALS2Q96Q42 1657 aa21.7■■□□□ 1.07
SSR4-201ENST00000320857 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SSR4-201ENST00000320857 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SSR4-201ENST00000320857 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.69■■□□□ 1.06
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