RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312492.2

HOXC5-201, Transcript of homeobox C5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC5, Length 1,805 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5-201ENST00000312492 RIPK4P57078 832 aa22.17■■□□□ 1.14
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HOXC5-201ENST00000312492 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC5-201ENST00000312492 MST1RQ04912 1400 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC5-201ENST00000312492 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
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HOXC5-201ENST00000312492 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.15■■□□□ 1.14
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HOXC5-201ENST00000312492 LTN1O94822 1766 aa22.15■■□□□ 1.14
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HOXC5-201ENST00000312492 ZNF853P0CG23 659 aa21.92■■□□□ 1.1
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HOXC5-201ENST00000312492 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.89■■□□□ 1.09
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HOXC5-201ENST00000312492 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
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HOXC5-201ENST00000312492 RGPD5Q99666 1765 aa21.88■■□□□ 1.09
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HOXC5-201ENST00000312492 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.87■■□□□ 1.09
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HOXC5-201ENST00000312492 ANKRD24Q8TF21 1146 aa21.85■■□□□ 1.09
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HOXC5-201ENST00000312492 LRRC37A3O60309 1634 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXC5-201ENST00000312492 ABCC6O95255 1503 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXC5-201ENST00000312492 CRB1P82279 1406 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXC5-201ENST00000312492 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXC5-201ENST00000312492 NCAPD2Q15021 1401 aa21.83■■□□□ 1.08
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