RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM57Q8N5G2 664 aa24.81■■□□□ 1.56
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SPNS1-201ENST00000311008 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.8■■□□□ 1.56
SPNS1-201ENST00000311008 ITSN1Q15811 1721 aa24.8■■□□□ 1.56
SPNS1-201ENST00000311008 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.8■■□□□ 1.56
SPNS1-201ENST00000311008 C3P01024 1663 aa24.8■■□□□ 1.56
SPNS1-201ENST00000311008 SEC24BO95487 1268 aa24.79■■□□□ 1.56
SPNS1-201ENST00000311008 SMC5Q8IY18 1101 aa24.79■■□□□ 1.56
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SPNS1-201ENST00000311008 TBC1D32Q96NH3 1257 aa24.75■■□□□ 1.55
SPNS1-201ENST00000311008 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.75■■□□□ 1.55
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SPNS1-201ENST00000311008 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.74■■□□□ 1.55
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SPNS1-201ENST00000311008 PIK3R4Q99570 1358 aa24.73■■□□□ 1.55
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SPNS1-201ENST00000311008 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
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SPNS1-201ENST00000311008 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
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SPNS1-201ENST00000311008 EID1Q9Y6B2 187 aa24.66■■□□□ 1.54
SPNS1-201ENST00000311008 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.66■■□□□ 1.54
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SPNS1-201ENST00000311008 GCC1Q96CN9 775 aa24.65■■□□□ 1.54
SPNS1-201ENST00000311008 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.64■■□□□ 1.54
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SPNS1-201ENST00000311008 KIF24Q5T7B8 1368 aa24.63■■□□□ 1.53
SPNS1-201ENST00000311008 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SPNS1-201ENST00000311008 USP31Q70CQ4 1352 aa24.62■■□□□ 1.53
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SPNS1-201ENST00000311008 CHD1LQ86WJ1 897 aa24.62■■□□□ 1.53
SPNS1-201ENST00000311008 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.6■■□□□ 1.53
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SPNS1-201ENST00000311008 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.59■■□□□ 1.53
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SPNS1-201ENST00000311008 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
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SPNS1-201ENST00000311008 KIAA0232Q92628 1395 aa24.55■■□□□ 1.52
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SPNS1-201ENST00000311008 CHL1O00533 1208 aa24.54■■□□□ 1.52
SPNS1-201ENST00000311008 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.54■■□□□ 1.52
SPNS1-201ENST00000311008 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.54■■□□□ 1.52
SPNS1-201ENST00000311008 DIP2AQ14689 1571 aa24.53■■□□□ 1.52
SPNS1-201ENST00000311008 ARHGEF10O15013 1369 aa24.53■■□□□ 1.52
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SPNS1-201ENST00000311008 ANTXR1Q9H6X2 564 aa24.53■■□□□ 1.52
SPNS1-201ENST00000311008 DCTN1Q14203 1278 aa24.53■■□□□ 1.52
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SPNS1-201ENST00000311008 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
SPNS1-201ENST00000311008 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SPNS1-201ENST00000311008 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
SPNS1-201ENST00000311008 RBM25P49756 843 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
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SPNS1-201ENST00000311008 FLT4P35916 1363 aa24.48■■□□□ 1.51
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SPNS1-201ENST00000311008 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.47■■□□□ 1.51
SPNS1-201ENST00000311008 SIRT2Q8IXJ6 389 aa24.47■■□□□ 1.51
SPNS1-201ENST00000311008 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
SPNS1-201ENST00000311008 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.46■■□□□ 1.51
SPNS1-201ENST00000311008 CRB1P82279 1406 aa24.44■■□□□ 1.5
SPNS1-201ENST00000311008 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.44■■□□□ 1.5
SPNS1-201ENST00000311008 MCM10Q7L590 875 aa24.44■■□□□ 1.5
SPNS1-201ENST00000311008 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
SPNS1-201ENST00000311008 KDRP35968 1356 aa24.44■■□□□ 1.5
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