RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301021.7

TRAPPC2L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC2L, Length 2,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FGD1P98174 961 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SLC24A1O60721 1099 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIF16BQ96L93 1317 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RBSNQ9H1K0 784 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ALKQ9UM73 1620 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NUCB1Q02818 461 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC2L-201ENST00000301021 STK26Q9P289 416 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NEUROD2Q15784 382 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC2L-201ENST00000301021 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NUCB2P80303 420 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.02■■□□□ 1.11
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.02■■□□□ 1.11
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.02■■□□□ 1.11
TRAPPC2L-201ENST00000301021 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TRIM27P14373 513 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PTPRMP28827 1452 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C3P01024 1663 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC2L-201ENST00000301021 AK9Q5TCS8 1911 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MCTP1Q6DN14 999 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MYRIPQ8NFW9 859 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UBR1Q8IWV7 1749 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIF20AO95235 890 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CHD1LQ86WJ1 897 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ADGRB2O60241 1585 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LRSAM1Q6UWE0 723 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ARID3AQ99856 593 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRIMPOLQ96LW4 560 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRAM1Q96QH2 718 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LNPKQ9C0E8 428 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HDGFP51858 240 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EVC2Q86UK5 1308 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RABEP1Q15276 862 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 METP08581 1390 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LTKP29376 864 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ABCC11Q96J66 1382 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MORC1Q86VD1 984 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GPT2Q8TD30 523 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 USP32Q8NFA0 1604 aa21.89■■□□□ 1.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CABP2Q9NPB3 220 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GCC1Q96CN9 775 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF710Q8N1W2 664 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CFAP44Q96MT7 982 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CFAP53Q96M91 514 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC2L-201ENST00000301021 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DLC1Q96QB1 1528 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TMEM63CQ9P1W3 806 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CDC45O75419 566 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MED14O60244 1454 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.84■■□□□ 1.09
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