RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293778.10

CXCL16-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 16, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL16, Length 2,222 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL16-201ENST00000293778 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
CXCL16-201ENST00000293778 KIF16BQ96L93 1317 aa25.52■■□□□ 1.68
CXCL16-201ENST00000293778 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.52■■□□□ 1.68
CXCL16-201ENST00000293778 NUTM2FA1L443 756 aa25.52■■□□□ 1.68
CXCL16-201ENST00000293778 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.52■■□□□ 1.68
CXCL16-201ENST00000293778 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.51■■□□□ 1.67
CXCL16-201ENST00000293778 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.51■■□□□ 1.67
CXCL16-201ENST00000293778 TBX22Q9Y458 520 aa25.51■■□□□ 1.67
CXCL16-201ENST00000293778 USP6P35125 1406 aa25.5■■□□□ 1.67
CXCL16-201ENST00000293778 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CXCL16-201ENST00000293778 NBR1Q14596 966 aa25.49■■□□□ 1.67
CXCL16-201ENST00000293778 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CXCL16-201ENST00000293778 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa25.49■■□□□ 1.67
CXCL16-201ENST00000293778 OVOS2Q6IE36 1432 aa25.49■■□□□ 1.67
CXCL16-201ENST00000293778 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.49■■□□□ 1.67
CXCL16-201ENST00000293778 ZNF428Q96B54 188 aa25.49■■□□□ 1.67
CXCL16-201ENST00000293778 GNAI1P63096 354 aa25.48■■□□□ 1.67
CXCL16-201ENST00000293778 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
CXCL16-201ENST00000293778 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.48■■□□□ 1.67
CXCL16-201ENST00000293778 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
CXCL16-201ENST00000293778 IFT57Q9NWB7 429 aa25.48■■□□□ 1.67
CXCL16-201ENST00000293778 PTCH1Q13635 1447 aa25.47■■□□□ 1.67
CXCL16-201ENST00000293778 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.47■■□□□ 1.67
CXCL16-201ENST00000293778 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.45■■□□□ 1.66
CXCL16-201ENST00000293778 DIP2AQ14689 1571 aa25.44■■□□□ 1.66
CXCL16-201ENST00000293778 ZNF853P0CG23 659 aa25.44■■□□□ 1.66
CXCL16-201ENST00000293778 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CXCL16-201ENST00000293778 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CXCL16-201ENST00000293778 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.43■■□□□ 1.66
CXCL16-201ENST00000293778 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.43■■□□□ 1.66
CXCL16-201ENST00000293778 SSH2Q76I76 1423 aa25.43■■□□□ 1.66
CXCL16-201ENST00000293778 VAMP4O75379 141 aa25.42■■□□□ 1.66
CXCL16-201ENST00000293778 MBIPQ9NS73 344 aa25.42■■□□□ 1.66
CXCL16-201ENST00000293778 USP31Q70CQ4 1352 aa25.41■■□□□ 1.66
CXCL16-201ENST00000293778 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CXCL16-201ENST00000293778 CFAP44Q96MT7 982 aa25.4■■□□□ 1.66
CXCL16-201ENST00000293778 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.39■■□□□ 1.66
CXCL16-201ENST00000293778 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.39■■□□□ 1.66
CXCL16-201ENST00000293778 TSPYL6Q8N831 410 aa25.39■■□□□ 1.66
CXCL16-201ENST00000293778 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.39■■□□□ 1.66
CXCL16-201ENST00000293778 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.39■■□□□ 1.65
CXCL16-201ENST00000293778 PEAK1Q9H792 1746 aa25.38■■□□□ 1.65
CXCL16-201ENST00000293778 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CXCL16-201ENST00000293778 FAM83GA6ND36 823 aa25.37■■□□□ 1.65
CXCL16-201ENST00000293778 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
CXCL16-201ENST00000293778 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
CXCL16-201ENST00000293778 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.36■■□□□ 1.65
CXCL16-201ENST00000293778 ARHGAP45Q92619 1136 aa25.36■■□□□ 1.65
CXCL16-201ENST00000293778 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
CXCL16-201ENST00000293778 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
CXCL16-201ENST00000293778 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
CXCL16-201ENST00000293778 DCTN1Q14203 1278 aa25.35■■□□□ 1.65
CXCL16-201ENST00000293778 SOX12O15370 315 aa25.34■■□□□ 1.65
CXCL16-201ENST00000293778 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
CXCL16-201ENST00000293778 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CXCL16-201ENST00000293778 RGPD1P0DJD0 1748 aa25.33■■□□□ 1.65
CXCL16-201ENST00000293778 USP19O94966 1318 aa25.33■■□□□ 1.65
CXCL16-201ENST00000293778 SEC24BO95487 1268 aa25.33■■□□□ 1.65
CXCL16-201ENST00000293778 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.64
CXCL16-201ENST00000293778 C8orf58Q8NAV2 365 aa25.32■■□□□ 1.64
CXCL16-201ENST00000293778 SLC4A3P48751 1232 aa25.32■■□□□ 1.64
CXCL16-201ENST00000293778 SMC5Q8IY18 1101 aa25.32■■□□□ 1.64
CXCL16-201ENST00000293778 PIK3R4Q99570 1358 aa25.31■■□□□ 1.64
CXCL16-201ENST00000293778 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CXCL16-201ENST00000293778 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CXCL16-201ENST00000293778 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.3■■□□□ 1.64
CXCL16-201ENST00000293778 ANKARQ7Z5J8 1434 aa25.3■■□□□ 1.64
CXCL16-201ENST00000293778 KCNA6P17658 529 aa25.29■■□□□ 1.64
CXCL16-201ENST00000293778 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CXCL16-201ENST00000293778 SBNO1A3KN83 1393 aa25.28■■□□□ 1.64
CXCL16-201ENST00000293778 ARHGEF10O15013 1369 aa25.28■■□□□ 1.64
CXCL16-201ENST00000293778 FMN2Q9NZ56 1722 aa25.28■■□□□ 1.64
CXCL16-201ENST00000293778 FLT4P35916 1363 aa25.28■■□□□ 1.64
CXCL16-201ENST00000293778 ABCC4O15439 1325 aa25.27■■□□□ 1.64
CXCL16-201ENST00000293778 PIK3C2AO00443 1686 aa25.26■■□□□ 1.63
CXCL16-201ENST00000293778 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CXCL16-201ENST00000293778 MCM10Q7L590 875 aa25.24■■□□□ 1.63
CXCL16-201ENST00000293778 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CXCL16-201ENST00000293778 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CXCL16-201ENST00000293778 CHL1O00533 1208 aa25.24■■□□□ 1.63
CXCL16-201ENST00000293778 AMPHP49418 695 aa25.22■■□□□ 1.63
CXCL16-201ENST00000293778 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CXCL16-201ENST00000293778 USP35Q9P2H5 1018 aa25.22■■□□□ 1.63
CXCL16-201ENST00000293778 DEKP35659 375 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CXCL16-201ENST00000293778 NLRP6P59044 892 aa25.21■■□□□ 1.63
CXCL16-201ENST00000293778 NUCB1Q02818 461 aa25.21■■□□□ 1.63
CXCL16-201ENST00000293778 KDRP35968 1356 aa25.19■■□□□ 1.62
CXCL16-201ENST00000293778 KIAA0232Q92628 1395 aa25.19■■□□□ 1.62
CXCL16-201ENST00000293778 CRB1P82279 1406 aa25.18■■□□□ 1.62
CXCL16-201ENST00000293778 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.18■■□□□ 1.62
CXCL16-201ENST00000293778 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.18■■□□□ 1.62
CXCL16-201ENST00000293778 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CXCL16-201ENST00000293778 KRT24Q2M2I5 525 aa25.17■■□□□ 1.62
CXCL16-201ENST00000293778 TBC1D32Q96NH3 1257 aa25.17■■□□□ 1.62
CXCL16-201ENST00000293778 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.17■■□□□ 1.62
CXCL16-201ENST00000293778 EYA1Q99502 592 aa25.17■■□□□ 1.62
CXCL16-201ENST00000293778 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.16■■□□□ 1.62
CXCL16-201ENST00000293778 GCC1Q96CN9 775 aa25.16■■□□□ 1.62
CXCL16-201ENST00000293778 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.15■■□□□ 1.62
CXCL16-201ENST00000293778 FOXO3O43524 673 aa25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms