RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CCSAP-201ENST00000284617 WDR97A6NE52 1622 aa25.13■■□□□ 1.61
CCSAP-201ENST00000284617 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CCSAP-201ENST00000284617 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.12■■□□□ 1.61
CCSAP-201ENST00000284617 TNMDQ9H2S6 317 aa25.12■■□□□ 1.61
CCSAP-201ENST00000284617 HECW1Q76N89 1606 aa25.12■■□□□ 1.61
CCSAP-201ENST00000284617 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CCSAP-201ENST00000284617 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CCSAP-201ENST00000284617 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.11■■□□□ 1.61
CCSAP-201ENST00000284617 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CCSAP-201ENST00000284617 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CCSAP-201ENST00000284617 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.1■■□□□ 1.61
CCSAP-201ENST00000284617 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CCSAP-201ENST00000284617 ODF2Q5BJF6 829 aa25.09■■□□□ 1.61
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CCSAP-201ENST00000284617 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa25.09■■□□□ 1.61
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM22Q8IYM9 498 aa25.08■■□□□ 1.61
CCSAP-201ENST00000284617 DACH1Q9UI36 760 aa25.08■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 TOP2BQ02880 1626 aa25.08■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 SPC24Q8NBT2 197 aa25.07■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.07■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 ME1P48163 572 aa25.07■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 NAIPQ13075 1403 aa25.07■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC66A2RUB6 948 aa25.07■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 MYO6Q9UM54 1294 aa25.07■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 NACAP1Q9BZK3 213 aa25.07■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 NFE2L2Q16236 605 aa25.06■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 SRGAP3O43295 1099 aa25.06■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINC1P01008 464 aa25.06■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 TTLL5Q6EMB2 1281 aa25.06■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa25.06■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 KDM4AO75164 1064 aa25.05■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 KRT32Q14532 448 aa25.05■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.05■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 DCTN1Q14203 1278 aa25.04■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa25.04■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 STK3Q13188 491 aa25.04■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 CFAP45Q9UL16 551 aa25.04■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 MTMR7Q9Y216 660 aa25.04■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 IL27Q8NEV9 243 aa25.04■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 PDRG1Q9NUG6 133 aa25.03■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC112Q8NEF3 446 aa25.03■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 SIL1Q9H173 461 aa25.03■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.03■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 AACSQ86V21 672 aa25.02■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 CTNNA3Q9UI47 895 aa25.02■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.02■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA32Q96LK8 384 aa25.01■■□□□ 1.6
CCSAP-201ENST00000284617 ESPNB1AK53 854 aa25.01■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 SPG7Q9UQ90 795 aa25.01■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 IFT140Q96RY7 1462 aa25.01■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 CABP4P57796 275 aa25.01■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 PPFIBP1Q86W92 1011 aa25.01■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 CDKL5O76039 1030 aa25■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 RDXP35241 583 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 IKQ13123 557 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 CBFA2T2O43439 604 aa25■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 CEP57L1Q8IYX8 460 aa24.99■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 NUP62CLQ9H1M0 184 aa24.99■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 FAM177BA6PVY3 158 aa24.99■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 STIM1Q13586 685 aa24.99■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 ABCC11Q96J66 1382 aa24.98■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.98■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC69A6NI79 296 aa24.98■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.98■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 H0YHG0 523 aa24.97■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa24.97■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa24.97■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 TOPBP1Q92547 1522 aa24.96■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 CEP126Q9P2H0 1117 aa24.96■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
CCSAP-201ENST00000284617 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 TXLNBQ8N3L3 684 aa24.95■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.95■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 KRT18P05783 430 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 RBM10P98175 930 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.94■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 LEKR1Q6ZMV7 388 aa24.94■■□□□ 1.58
CCSAP-201ENST00000284617 KIF1BPQ96EK5 621 aa24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms