RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263434.5

PTPRH-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type H, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRH, Length 3,343 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRH-201ENST00000263434 RAB3GAP1Q15042 981 aa19.06■□□□□ 0.64
PTPRH-201ENST00000263434 MCTP1Q6DN14 999 aa19.06■□□□□ 0.64
PTPRH-201ENST00000263434 NEURL4Q96JN8 1562 aa19.06■□□□□ 0.64
PTPRH-201ENST00000263434 CHAMP1Q96JM3 812 aa19.06■□□□□ 0.64
PTPRH-201ENST00000263434 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
PTPRH-201ENST00000263434 GNAI1P63096 354 aa19.05■□□□□ 0.64
PTPRH-201ENST00000263434 ABCC3O15438 1527 aa19.05■□□□□ 0.64
PTPRH-201ENST00000263434 AK9Q5TCS8 1911 aa19.05■□□□□ 0.64
PTPRH-201ENST00000263434 CDC45O75419 566 aa19.05■□□□□ 0.64
PTPRH-201ENST00000263434 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
PTPRH-201ENST00000263434 TPRNQ4KMQ1 711 aa19.05■□□□□ 0.64
PTPRH-201ENST00000263434 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
PTPRH-201ENST00000263434 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
PTPRH-201ENST00000263434 POGZQ7Z3K3 1410 aa19.04■□□□□ 0.64
PTPRH-201ENST00000263434 GOLGA6L22H0YM25 854 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRH-201ENST00000263434 CLCN1P35523 988 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRH-201ENST00000263434 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
PTPRH-201ENST00000263434 PKP1Q13835 747 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRH-201ENST00000263434 LMTK2Q8IWU2 1503 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRH-201ENST00000263434 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRH-201ENST00000263434 DDIT3P35638 169 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRH-201ENST00000263434 MIS18AQ9NYP9 233 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRH-201ENST00000263434 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
PTPRH-201ENST00000263434 LRRC7Q96NW7 1537 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRH-201ENST00000263434 SLC4A10Q6U841 1118 aa19.02■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 AEBP1Q8IUX7 1158 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 USP32Q8NFA0 1604 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 MCM10Q7L590 875 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 SLC52A1Q9NWF4 448 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 TXNDC2Q86VQ3 553 aa19■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa19■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 TSHZ3Q63HK5 1081 aa19■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 CD163L1Q9NR16 1453 aa19■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 BAG4O95429 457 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 ZBTB7CA1YPR0 619 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 NASPP49321 788 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 IFT57Q9NWB7 429 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 IL13P35225 146 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 SULT6B1Q6IMI4 303 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 COG3Q96JB2 828 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 PTPRMP28827 1452 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 FAM135BQ49AJ0 1406 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 NECTIN2Q92692 538 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 CFAP44Q96MT7 982 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 YEATS2Q9ULM3 1422 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRH-201ENST00000263434 ABCC4O15439 1325 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRH-201ENST00000263434 HECW2Q9P2P5 1572 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRH-201ENST00000263434 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
PTPRH-201ENST00000263434 MEIS3Q99687 375 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRH-201ENST00000263434 PNPLA6Q8IY17 1366 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRH-201ENST00000263434 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
PTPRH-201ENST00000263434 TTC22Q5TAA0 569 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRH-201ENST00000263434 F6X3S4 739 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRH-201ENST00000263434 SDSP20132 328 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRH-201ENST00000263434 ARHGAP45Q92619 1136 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRH-201ENST00000263434 MYO5BQ9ULV0 1848 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRH-201ENST00000263434 MLH3Q9UHC1 1453 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF428Q96B54 188 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRH-201ENST00000263434 PIK3C2BO00750 1634 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRH-201ENST00000263434 RABEP1Q15276 862 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRH-201ENST00000263434 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
PTPRH-201ENST00000263434 DCTPP1Q9H773 170 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRH-201ENST00000263434 CFAP74Q9C0B2 1584 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRH-201ENST00000263434 USP26Q9BXU7 913 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRH-201ENST00000263434 SLC4A2P04920 1241 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF853P0CG23 659 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRH-201ENST00000263434 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRH-201ENST00000263434 LMOD3Q0VAK6 560 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRH-201ENST00000263434 CASC1Q6TDU7 716 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRH-201ENST00000263434 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
PTPRH-201ENST00000263434 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRH-201ENST00000263434 ZFYVE9O95405 1425 aa18.89■□□□□ 0.62
PTPRH-201ENST00000263434 MED14O60244 1454 aa18.89■□□□□ 0.62
PTPRH-201ENST00000263434 ARID3AQ99856 593 aa18.89■□□□□ 0.62
PTPRH-201ENST00000263434 RNF214Q8ND24 703 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRH-201ENST00000263434 PTCH1Q13635 1447 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRH-201ENST00000263434 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
PTPRH-201ENST00000263434 CEP85Q6P2H3 762 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRH-201ENST00000263434 VSIG10Q8N0Z9 540 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRH-201ENST00000263434 FOXO3O43524 673 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRH-201ENST00000263434 MSNP26038 577 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
PTPRH-201ENST00000263434 KLHL40Q2TBA0 621 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRH-201ENST00000263434 MSH6P52701 1360 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRH-201ENST00000263434 MPNDQ8N594 471 aa18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms