RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 C1orf115Q9H7X2 142 aa18.66■□□□□ 0.58
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SYP-201ENST00000263233 PTCH1Q13635 1447 aa18.65■□□□□ 0.58
SYP-201ENST00000263233 RAB3GAP1Q15042 981 aa18.65■□□□□ 0.58
SYP-201ENST00000263233 PIK3R4Q99570 1358 aa18.65■□□□□ 0.58
SYP-201ENST00000263233 CLCN1P35523 988 aa18.65■□□□□ 0.58
SYP-201ENST00000263233 CDK19Q9BWU1 502 aa18.65■□□□□ 0.58
SYP-201ENST00000263233 CABP1Q9NZU7 370 aa18.65■□□□□ 0.58
SYP-201ENST00000263233 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.58
SYP-201ENST00000263233 FBLN1P23142 703 aa18.64■□□□□ 0.58
SYP-201ENST00000263233 ARHGAP45Q92619 1136 aa18.64■□□□□ 0.58
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SYP-201ENST00000263233 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa18.64■□□□□ 0.57
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SYP-201ENST00000263233 TSPYL6Q8N831 410 aa18.63■□□□□ 0.57
SYP-201ENST00000263233 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
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SYP-201ENST00000263233 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa18.61■□□□□ 0.57
SYP-201ENST00000263233 HMOX1P09601 288 aa18.61■□□□□ 0.57
SYP-201ENST00000263233 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP18.61■□□□□ 0.57
SYP-201ENST00000263233 PREX1Q8TCU6 1659 aa18.61■□□□□ 0.57
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SYP-201ENST00000263233 MBIPQ9NS73 344 aa18.58■□□□□ 0.57
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SYP-201ENST00000263233 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa18.52■□□□□ 0.56
SYP-201ENST00000263233 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
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SYP-201ENST00000263233 RIMS2Q9UQ26 1411 aa18.49■□□□□ 0.55
SYP-201ENST00000263233 FAM83GA6ND36 823 aa18.49■□□□□ 0.55
SYP-201ENST00000263233 NME9Q86XW9 330 aa18.49■□□□□ 0.55
SYP-201ENST00000263233 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
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SYP-201ENST00000263233 DCTN1Q14203 1278 aa18.46■□□□□ 0.55
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SYP-201ENST00000263233 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
SYP-201ENST00000263233 ATP10DQ9P241 1426 aa18.45■□□□□ 0.54
SYP-201ENST00000263233 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
SYP-201ENST00000263233 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
SYP-201ENST00000263233 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
SYP-201ENST00000263233 ANKRD44Q8N8A2 993 aa18.44■□□□□ 0.54
SYP-201ENST00000263233 RGS12O14924 1447 aa18.43■□□□□ 0.54
SYP-201ENST00000263233 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SYP-201ENST00000263233 NASPP49321 788 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SYP-201ENST00000263233 CCDC173Q0VFZ6 552 aa18.43■□□□□ 0.54
SYP-201ENST00000263233 PPP1R9BQ96SB3 815 aa18.43■□□□□ 0.54
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