RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262764.10

PGS1-201, Transcript of phosphatidylglycerophosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGS1, Length 2,201 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1-201ENST00000262764 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
PGS1-201ENST00000262764 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
PGS1-201ENST00000262764 TMEM57Q8N5G2 664 aa24.63■■□□□ 1.53
PGS1-201ENST00000262764 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
PGS1-201ENST00000262764 PTPRUQ92729 1446 aa24.62■■□□□ 1.53
PGS1-201ENST00000262764 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
PGS1-201ENST00000262764 IFT57Q9NWB7 429 aa24.62■■□□□ 1.53
PGS1-201ENST00000262764 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.61■■□□□ 1.53
PGS1-201ENST00000262764 ZNF853P0CG23 659 aa24.61■■□□□ 1.53
PGS1-201ENST00000262764 SLC4A3P48751 1232 aa24.61■■□□□ 1.53
PGS1-201ENST00000262764 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.6■■□□□ 1.53
PGS1-201ENST00000262764 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.6■■□□□ 1.53
PGS1-201ENST00000262764 GNAI1P63096 354 aa24.6■■□□□ 1.53
PGS1-201ENST00000262764 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.6■■□□□ 1.53
PGS1-201ENST00000262764 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.6■■□□□ 1.53
PGS1-201ENST00000262764 SEC24BO95487 1268 aa24.59■■□□□ 1.53
PGS1-201ENST00000262764 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PGS1-201ENST00000262764 ACEP12821 1306 aa24.59■■□□□ 1.53
PGS1-201ENST00000262764 SLIT1O75093 1534 aa24.59■■□□□ 1.53
PGS1-201ENST00000262764 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.59■■□□□ 1.53
PGS1-201ENST00000262764 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PGS1-201ENST00000262764 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.59■■□□□ 1.53
PGS1-201ENST00000262764 USP6P35125 1406 aa24.58■■□□□ 1.53
PGS1-201ENST00000262764 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.58■■□□□ 1.53
PGS1-201ENST00000262764 USP35Q9P2H5 1018 aa24.58■■□□□ 1.53
PGS1-201ENST00000262764 VAMP4O75379 141 aa24.58■■□□□ 1.52
PGS1-201ENST00000262764 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.57■■□□□ 1.52
PGS1-201ENST00000262764 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.56■■□□□ 1.52
PGS1-201ENST00000262764 MBIPQ9NS73 344 aa24.56■■□□□ 1.52
PGS1-201ENST00000262764 EID1Q9Y6B2 187 aa24.56■■□□□ 1.52
PGS1-201ENST00000262764 PTCH1Q13635 1447 aa24.55■■□□□ 1.52
PGS1-201ENST00000262764 TSPYL6Q8N831 410 aa24.55■■□□□ 1.52
PGS1-201ENST00000262764 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PGS1-201ENST00000262764 SMC5Q8IY18 1101 aa24.54■■□□□ 1.52
PGS1-201ENST00000262764 CFAP44Q96MT7 982 aa24.54■■□□□ 1.52
PGS1-201ENST00000262764 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
PGS1-201ENST00000262764 SSH2Q76I76 1423 aa24.53■■□□□ 1.52
PGS1-201ENST00000262764 PIK3R4Q99570 1358 aa24.53■■□□□ 1.52
PGS1-201ENST00000262764 NUTM2FA1L443 756 aa24.53■■□□□ 1.52
PGS1-201ENST00000262764 ARHGAP45Q92619 1136 aa24.53■■□□□ 1.52
PGS1-201ENST00000262764 USP31Q70CQ4 1352 aa24.52■■□□□ 1.52
PGS1-201ENST00000262764 PEAK1Q9H792 1746 aa24.51■■□□□ 1.51
PGS1-201ENST00000262764 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.51■■□□□ 1.51
PGS1-201ENST00000262764 TBX22Q9Y458 520 aa24.51■■□□□ 1.51
PGS1-201ENST00000262764 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.5■■□□□ 1.51
PGS1-201ENST00000262764 FAM83GA6ND36 823 aa24.5■■□□□ 1.51
PGS1-201ENST00000262764 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.49■■□□□ 1.51
PGS1-201ENST00000262764 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.49■■□□□ 1.51
PGS1-201ENST00000262764 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
PGS1-201ENST00000262764 DIP2AQ14689 1571 aa24.48■■□□□ 1.51
PGS1-201ENST00000262764 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.47■■□□□ 1.51
PGS1-201ENST00000262764 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.47■■□□□ 1.51
PGS1-201ENST00000262764 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
PGS1-201ENST00000262764 ABCC4O15439 1325 aa24.46■■□□□ 1.51
PGS1-201ENST00000262764 DCTN1Q14203 1278 aa24.46■■□□□ 1.51
PGS1-201ENST00000262764 TBC1D32Q96NH3 1257 aa24.46■■□□□ 1.51
PGS1-201ENST00000262764 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
PGS1-201ENST00000262764 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.46■■□□□ 1.51
PGS1-201ENST00000262764 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
PGS1-201ENST00000262764 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
PGS1-201ENST00000262764 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PGS1-201ENST00000262764 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.43■■□□□ 1.5
PGS1-201ENST00000262764 NFKBIBQ15653 356 aa24.43■■□□□ 1.5
PGS1-201ENST00000262764 NUCB1Q02818 461 aa24.42■■□□□ 1.5
PGS1-201ENST00000262764 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
PGS1-201ENST00000262764 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
PGS1-201ENST00000262764 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.41■■□□□ 1.5
PGS1-201ENST00000262764 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.4■■□□□ 1.5
PGS1-201ENST00000262764 BECN1Q14457 450 aa24.4■■□□□ 1.5
PGS1-201ENST00000262764 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
PGS1-201ENST00000262764 ARHGEF10O15013 1369 aa24.39■■□□□ 1.5
PGS1-201ENST00000262764 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
PGS1-201ENST00000262764 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.39■■□□□ 1.49
PGS1-201ENST00000262764 CHL1O00533 1208 aa24.37■■□□□ 1.49
PGS1-201ENST00000262764 SBNO1A3KN83 1393 aa24.37■■□□□ 1.49
PGS1-201ENST00000262764 PIK3C2AO00443 1686 aa24.37■■□□□ 1.49
PGS1-201ENST00000262764 SOX12O15370 315 aa24.37■■□□□ 1.49
PGS1-201ENST00000262764 CHD1LQ86WJ1 897 aa24.37■■□□□ 1.49
PGS1-201ENST00000262764 FLT4P35916 1363 aa24.36■■□□□ 1.49
PGS1-201ENST00000262764 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PGS1-201ENST00000262764 KIF24Q5T7B8 1368 aa24.36■■□□□ 1.49
PGS1-201ENST00000262764 MCM10Q7L590 875 aa24.35■■□□□ 1.49
PGS1-201ENST00000262764 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.35■■□□□ 1.49
PGS1-201ENST00000262764 GCC1Q96CN9 775 aa24.35■■□□□ 1.49
PGS1-201ENST00000262764 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.35■■□□□ 1.49
PGS1-201ENST00000262764 LNPKQ9C0E8 428 aa24.35■■□□□ 1.49
PGS1-201ENST00000262764 KIAA0232Q92628 1395 aa24.35■■□□□ 1.49
PGS1-201ENST00000262764 CRB1P82279 1406 aa24.34■■□□□ 1.49
PGS1-201ENST00000262764 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
PGS1-201ENST00000262764 KDRP35968 1356 aa24.33■■□□□ 1.48
PGS1-201ENST00000262764 SIRT2Q8IXJ6 389 aa24.33■■□□□ 1.48
PGS1-201ENST00000262764 BCL11AQ9H165 835 aa24.33■■□□□ 1.48
PGS1-201ENST00000262764 KRT24Q2M2I5 525 aa24.31■■□□□ 1.48
PGS1-201ENST00000262764 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
PGS1-201ENST00000262764 RGS12O14924 1447 aa24.3■■□□□ 1.48
PGS1-201ENST00000262764 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
PGS1-201ENST00000262764 KCNA6P17658 529 aa24.3■■□□□ 1.48
PGS1-201ENST00000262764 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.3■■□□□ 1.48
PGS1-201ENST00000262764 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.29■■□□□ 1.48
PGS1-201ENST00000262764 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.7 ms