RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262395.9

TRAF4-201, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAF4, Length 2,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-201ENST00000262395 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAF4-201ENST00000262395 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAF4-201ENST00000262395 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
TRAF4-201ENST00000262395 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.33■■□□□ 1.16
TRAF4-201ENST00000262395 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TRAF4-201ENST00000262395 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TRAF4-201ENST00000262395 NFE2L2Q16236 605 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAF4-201ENST00000262395 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAF4-201ENST00000262395 AK9Q5TCS8 1911 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAF4-201ENST00000262395 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TRAF4-201ENST00000262395 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TRAF4-201ENST00000262395 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAF4-201ENST00000262395 ZMYND15Q9H091 742 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAF4-201ENST00000262395 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
TRAF4-201ENST00000262395 CDC45O75419 566 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAF4-201ENST00000262395 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
TRAF4-201ENST00000262395 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAF4-201ENST00000262395 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAF4-201ENST00000262395 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAF4-201ENST00000262395 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TRAF4-201ENST00000262395 PKP1Q13835 747 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAF4-201ENST00000262395 MCTP1Q6DN14 999 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAF4-201ENST00000262395 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TRAF4-201ENST00000262395 GNAI1P63096 354 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAF4-201ENST00000262395 KRT24Q2M2I5 525 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAF4-201ENST00000262395 PTPRMP28827 1452 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAF4-201ENST00000262395 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.27■■□□□ 1.15
TRAF4-201ENST00000262395 MED14O60244 1454 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAF4-201ENST00000262395 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAF4-201ENST00000262395 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
TRAF4-201ENST00000262395 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TRAF4-201ENST00000262395 NME9Q86XW9 330 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAF4-201ENST00000262395 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAF4-201ENST00000262395 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAF4-201ENST00000262395 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TRAF4-201ENST00000262395 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TRAF4-201ENST00000262395 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAF4-201ENST00000262395 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TRAF4-201ENST00000262395 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TRAF4-201ENST00000262395 ABCC4O15439 1325 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAF4-201ENST00000262395 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAF4-201ENST00000262395 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TRAF4-201ENST00000262395 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAF4-201ENST00000262395 IFT57Q9NWB7 429 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAF4-201ENST00000262395 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAF4-201ENST00000262395 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TRAF4-201ENST00000262395 PIK3C2BO00750 1634 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAF4-201ENST00000262395 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
TRAF4-201ENST00000262395 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
TRAF4-201ENST00000262395 ZNF428Q96B54 188 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAF4-201ENST00000262395 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TRAF4-201ENST00000262395 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAF4-201ENST00000262395 PTCH1Q13635 1447 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAF4-201ENST00000262395 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.2■■□□□ 1.15
TRAF4-201ENST00000262395 IL13P35225 146 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAF4-201ENST00000262395 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TRAF4-201ENST00000262395 TTC22Q5TAA0 569 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAF4-201ENST00000262395 ZNF853P0CG23 659 aa22.19■■□□□ 1.14
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TRAF4-201ENST00000262395 PIK3R4Q99570 1358 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAF4-201ENST00000262395 ZFYVE9O95405 1425 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAF4-201ENST00000262395 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAF4-201ENST00000262395 CFAP44Q96MT7 982 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAF4-201ENST00000262395 USP26Q9BXU7 913 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAF4-201ENST00000262395 DCTPP1Q9H773 170 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAF4-201ENST00000262395 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TRAF4-201ENST00000262395 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAF4-201ENST00000262395 SDSP20132 328 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAF4-201ENST00000262395 RABEP1Q15276 862 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAF4-201ENST00000262395 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TRAF4-201ENST00000262395 PTMSP20962 102 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAF4-201ENST00000262395 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TRAF4-201ENST00000262395 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAF4-201ENST00000262395 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAF4-201ENST00000262395 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TRAF4-201ENST00000262395 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAF4-201ENST00000262395 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAF4-201ENST00000262395 MCM10Q7L590 875 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAF4-201ENST00000262395 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAF4-201ENST00000262395 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TRAF4-201ENST00000262395 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAF4-201ENST00000262395 MEIS3Q99687 375 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAF4-201ENST00000262395 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAF4-201ENST00000262395 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAF4-201ENST00000262395 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAF4-201ENST00000262395 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAF4-201ENST00000262395 RBSNQ9H1K0 784 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAF4-201ENST00000262395 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAF4-201ENST00000262395 SOX12O15370 315 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAF4-201ENST00000262395 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TRAF4-201ENST00000262395 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAF4-201ENST00000262395 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAF4-201ENST00000262395 CEP85Q6P2H3 762 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAF4-201ENST00000262395 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAF4-201ENST00000262395 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TRAF4-201ENST00000262395 NUCB2P80303 420 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAF4-201ENST00000262395 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAF4-201ENST00000262395 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TRAF4-201ENST00000262395 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
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