RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 PIP4K2BP78356 416 aa23.52■■□□□ 1.36
USP18-201ENST00000215794 COG3Q96JB2 828 aa23.52■■□□□ 1.36
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USP18-201ENST00000215794 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
USP18-201ENST00000215794 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.5■■□□□ 1.35
USP18-201ENST00000215794 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
USP18-201ENST00000215794 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
USP18-201ENST00000215794 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.5■■□□□ 1.35
USP18-201ENST00000215794 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.49■■□□□ 1.35
USP18-201ENST00000215794 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.49■■□□□ 1.35
USP18-201ENST00000215794 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.49■■□□□ 1.35
USP18-201ENST00000215794 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.49■■□□□ 1.35
USP18-201ENST00000215794 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.49■■□□□ 1.35
USP18-201ENST00000215794 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
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USP18-201ENST00000215794 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.48■■□□□ 1.35
USP18-201ENST00000215794 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
USP18-201ENST00000215794 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.48■■□□□ 1.35
USP18-201ENST00000215794 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
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USP18-201ENST00000215794 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.47■■□□□ 1.35
USP18-201ENST00000215794 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
USP18-201ENST00000215794 CERKQ8TCT0 537 aa23.45■■□□□ 1.35
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USP18-201ENST00000215794 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.45■■□□□ 1.35
USP18-201ENST00000215794 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.45■■□□□ 1.35
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USP18-201ENST00000215794 RIPK4P57078 832 aa23.42■■□□□ 1.34
USP18-201ENST00000215794 TOM1O60784 492 aa23.42■■□□□ 1.34
USP18-201ENST00000215794 PDE3AQ14432 1141 aa23.42■■□□□ 1.34
USP18-201ENST00000215794 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.42■■□□□ 1.34
USP18-201ENST00000215794 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.42■■□□□ 1.34
USP18-201ENST00000215794 TNNQ9UQP3 1299 aa23.42■■□□□ 1.34
USP18-201ENST00000215794 ALS2Q96Q42 1657 aa23.42■■□□□ 1.34
USP18-201ENST00000215794 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
USP18-201ENST00000215794 USP31Q70CQ4 1352 aa23.41■■□□□ 1.34
USP18-201ENST00000215794 NHSL1Q5SYE7 1610 aa23.41■■□□□ 1.34
USP18-201ENST00000215794 HMOX1P09601 288 aa23.41■■□□□ 1.34
USP18-201ENST00000215794 PRKAR2BP31323 418 aa23.41■■□□□ 1.34
USP18-201ENST00000215794 COG6Q9Y2V7 657 aa23.41■■□□□ 1.34
USP18-201ENST00000215794 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
USP18-201ENST00000215794 FCHSD2O94868 740 aa23.4■■□□□ 1.34
USP18-201ENST00000215794 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
USP18-201ENST00000215794 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.4■■□□□ 1.34
USP18-201ENST00000215794 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.39■■□□□ 1.34
USP18-201ENST00000215794 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.39■■□□□ 1.33
USP18-201ENST00000215794 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.39■■□□□ 1.33
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USP18-201ENST00000215794 BACH2Q9BYV9 841 aa23.33■■□□□ 1.33
USP18-201ENST00000215794 GCP02774 474 aa23.33■■□□□ 1.32
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USP18-201ENST00000215794 USP19O94966 1318 aa23.31■■□□□ 1.32
USP18-201ENST00000215794 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.3■■□□□ 1.32
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USP18-201ENST00000215794 NEFMP07197 916 aa23.29■■□□□ 1.32
USP18-201ENST00000215794 SLIT3O75094 1523 aa23.29■■□□□ 1.32
USP18-201ENST00000215794 NFE2L2Q16236 605 aa23.29■■□□□ 1.32
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USP18-201ENST00000215794 ARHGEF10O15013 1369 aa23.28■■□□□ 1.32
USP18-201ENST00000215794 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
USP18-201ENST00000215794 AMPHP49418 695 aa23.28■■□□□ 1.32
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USP18-201ENST00000215794 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.27■■□□□ 1.32
USP18-201ENST00000215794 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.27■■□□□ 1.32
USP18-201ENST00000215794 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.26■■□□□ 1.31
USP18-201ENST00000215794 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
USP18-201ENST00000215794 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
USP18-201ENST00000215794 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
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USP18-201ENST00000215794 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.25■■□□□ 1.31
USP18-201ENST00000215794 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
USP18-201ENST00000215794 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
USP18-201ENST00000215794 CHRNA2Q15822 529 aa23.24■■□□□ 1.31
USP18-201ENST00000215794 HOXC9P31274 260 aa23.23■■□□□ 1.31
USP18-201ENST00000215794 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
USP18-201ENST00000215794 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
USP18-201ENST00000215794 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.23■■□□□ 1.31
USP18-201ENST00000215794 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.23■■□□□ 1.31
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