RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215570.7

TIMM13-201, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMM13, Length 1,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM13-201ENST00000215570 PTCH1Q13635 1447 aa23.57■■□□□ 1.36
TIMM13-201ENST00000215570 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
TIMM13-201ENST00000215570 ZNF853P0CG23 659 aa23.56■■□□□ 1.36
TIMM13-201ENST00000215570 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
TIMM13-201ENST00000215570 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
TIMM13-201ENST00000215570 CCDC61Q9Y6R9 512 aa23.56■■□□□ 1.36
TIMM13-201ENST00000215570 FBLN1P23142 703 aa23.55■■□□□ 1.36
TIMM13-201ENST00000215570 NME9Q86XW9 330 aa23.55■■□□□ 1.36
TIMM13-201ENST00000215570 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
TIMM13-201ENST00000215570 CFAP44Q96MT7 982 aa23.54■■□□□ 1.36
TIMM13-201ENST00000215570 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
TIMM13-201ENST00000215570 MBIPQ9NS73 344 aa23.52■■□□□ 1.36
TIMM13-201ENST00000215570 TECPR2O15040 1411 aa23.52■■□□□ 1.36
TIMM13-201ENST00000215570 METP08581 1390 aa23.52■■□□□ 1.36
TIMM13-201ENST00000215570 HSCBQ8IWL3 235 aa23.52■■□□□ 1.36
TIMM13-201ENST00000215570 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TIMM13-201ENST00000215570 LNPKQ9C0E8 428 aa23.52■■□□□ 1.36
TIMM13-201ENST00000215570 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.52■■□□□ 1.36
TIMM13-201ENST00000215570 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
TIMM13-201ENST00000215570 BMP2KLQ5H9B9 411 aa23.51■■□□□ 1.35
TIMM13-201ENST00000215570 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.51■■□□□ 1.35
TIMM13-201ENST00000215570 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.51■■□□□ 1.35
TIMM13-201ENST00000215570 MLECQ14165 292 aa23.51■■□□□ 1.35
TIMM13-201ENST00000215570 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TIMM13-201ENST00000215570 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.51■■□□□ 1.35
TIMM13-201ENST00000215570 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.5■■□□□ 1.35
TIMM13-201ENST00000215570 ABCC4O15439 1325 aa23.5■■□□□ 1.35
TIMM13-201ENST00000215570 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TIMM13-201ENST00000215570 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
TIMM13-201ENST00000215570 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.49■■□□□ 1.35
TIMM13-201ENST00000215570 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.49■■□□□ 1.35
TIMM13-201ENST00000215570 TSPYL6Q8N831 410 aa23.49■■□□□ 1.35
TIMM13-201ENST00000215570 TSPOAP1O95153 1857 aa23.48■■□□□ 1.35
TIMM13-201ENST00000215570 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
TIMM13-201ENST00000215570 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.48■■□□□ 1.35
TIMM13-201ENST00000215570 CPS1P31327 1500 aa23.46■■□□□ 1.35
TIMM13-201ENST00000215570 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
TIMM13-201ENST00000215570 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.46■■□□□ 1.35
TIMM13-201ENST00000215570 SNX21Q969T3 373 aa23.45■■□□□ 1.35
TIMM13-201ENST00000215570 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
TIMM13-201ENST00000215570 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
TIMM13-201ENST00000215570 C3P01024 1663 aa23.44■■□□□ 1.34
TIMM13-201ENST00000215570 ITSN1Q15811 1721 aa23.43■■□□□ 1.34
TIMM13-201ENST00000215570 AKAP12Q02952 1782 aa23.43■■□□□ 1.34
TIMM13-201ENST00000215570 MCM4P33991 863 aa23.43■■□□□ 1.34
TIMM13-201ENST00000215570 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.43■■□□□ 1.34
TIMM13-201ENST00000215570 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.42■■□□□ 1.34
TIMM13-201ENST00000215570 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TIMM13-201ENST00000215570 TNRQ92752 1358 aa23.41■■□□□ 1.34
TIMM13-201ENST00000215570 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.4■■□□□ 1.34
TIMM13-201ENST00000215570 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.39■■□□□ 1.34
TIMM13-201ENST00000215570 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.38■■□□□ 1.33
TIMM13-201ENST00000215570 DLG5Q8TDM6 1919 aa23.38■■□□□ 1.33
TIMM13-201ENST00000215570 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.38■■□□□ 1.33
TIMM13-201ENST00000215570 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.38■■□□□ 1.33
TIMM13-201ENST00000215570 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.38■■□□□ 1.33
TIMM13-201ENST00000215570 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.37■■□□□ 1.33
TIMM13-201ENST00000215570 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
TIMM13-201ENST00000215570 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.36■■□□□ 1.33
TIMM13-201ENST00000215570 FAM83GA6ND36 823 aa23.36■■□□□ 1.33
TIMM13-201ENST00000215570 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
TIMM13-201ENST00000215570 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
TIMM13-201ENST00000215570 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.36■■□□□ 1.33
TIMM13-201ENST00000215570 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.35■■□□□ 1.33
TIMM13-201ENST00000215570 KIAA0232Q92628 1395 aa23.35■■□□□ 1.33
TIMM13-201ENST00000215570 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.34■■□□□ 1.33
TIMM13-201ENST00000215570 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
TIMM13-201ENST00000215570 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.34■■□□□ 1.33
TIMM13-201ENST00000215570 CDC45O75419 566 aa23.34■■□□□ 1.33
TIMM13-201ENST00000215570 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.34■■□□□ 1.33
TIMM13-201ENST00000215570 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.34■■□□□ 1.33
TIMM13-201ENST00000215570 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.33■■□□□ 1.33
TIMM13-201ENST00000215570 CHL1O00533 1208 aa23.33■■□□□ 1.33
TIMM13-201ENST00000215570 DCTN1Q14203 1278 aa23.33■■□□□ 1.33
TIMM13-201ENST00000215570 DCTPP1Q9H773 170 aa23.33■■□□□ 1.33
TIMM13-201ENST00000215570 ACEP12821 1306 aa23.32■■□□□ 1.32
TIMM13-201ENST00000215570 DDIT3P35638 169 aa23.32■■□□□ 1.32
TIMM13-201ENST00000215570 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
TIMM13-201ENST00000215570 PTPRCP08575 1304 aa23.31■■□□□ 1.32
TIMM13-201ENST00000215570 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.31■■□□□ 1.32
TIMM13-201ENST00000215570 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.31■■□□□ 1.32
TIMM13-201ENST00000215570 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.31■■□□□ 1.32
TIMM13-201ENST00000215570 TRAK2O60296 914 aa23.31■■□□□ 1.32
TIMM13-201ENST00000215570 PTMSP20962 102 aa23.3■■□□□ 1.32
TIMM13-201ENST00000215570 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.3■■□□□ 1.32
TIMM13-201ENST00000215570 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.29■■□□□ 1.32
TIMM13-201ENST00000215570 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.29■■□□□ 1.32
TIMM13-201ENST00000215570 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.29■■□□□ 1.32
TIMM13-201ENST00000215570 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.29■■□□□ 1.32
TIMM13-201ENST00000215570 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.29■■□□□ 1.32
TIMM13-201ENST00000215570 USP6P35125 1406 aa23.28■■□□□ 1.32
TIMM13-201ENST00000215570 USP31Q70CQ4 1352 aa23.28■■□□□ 1.32
TIMM13-201ENST00000215570 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.27■■□□□ 1.32
TIMM13-201ENST00000215570 GBP4Q96PP9 640 aa23.27■■□□□ 1.32
TIMM13-201ENST00000215570 KIF2CQ99661 725 aa23.27■■□□□ 1.32
TIMM13-201ENST00000215570 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
TIMM13-201ENST00000215570 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa23.27■■□□□ 1.32
TIMM13-201ENST00000215570 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
TIMM13-201ENST00000215570 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.25■■□□□ 1.31
TIMM13-201ENST00000215570 ARHGEF10O15013 1369 aa23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms