RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000204679.8

GNPTG-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTG, Length 1,983 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTG-201ENST00000204679 SBNO1A3KN83 1393 aa30.1■■■□□ 2.41
GNPTG-201ENST00000204679 NFE2L2Q16236 605 aa30.09■■■□□ 2.41
GNPTG-201ENST00000204679 FLT4P35916 1363 aa30.09■■■□□ 2.41
GNPTG-201ENST00000204679 AMPHP49418 695 aa30.08■■■□□ 2.41
GNPTG-201ENST00000204679 CRBNQ96SW2 442 aa30.08■■■□□ 2.41
GNPTG-201ENST00000204679 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.07■■■□□ 2.4
GNPTG-201ENST00000204679 TMEM94Q12767 1356 aa30.07■■■□□ 2.4
GNPTG-201ENST00000204679 SULT6B1Q6IMI4 303 aa30.06■■■□□ 2.4
GNPTG-201ENST00000204679 AEBP1Q8IUX7 1158 aa30.06■■■□□ 2.4
GNPTG-201ENST00000204679 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
GNPTG-201ENST00000204679 IL16Q14005 1332 aa30.05■■■□□ 2.4
GNPTG-201ENST00000204679 FANCIQ9NVI1 1328 aa30.05■■■□□ 2.4
GNPTG-201ENST00000204679 FOXO3O43524 673 aa30.05■■■□□ 2.4
GNPTG-201ENST00000204679 RGPD1P0DJD0 1748 aa30.04■■■□□ 2.4
GNPTG-201ENST00000204679 C1orf167Q5SNV9 1468 aa30.03■■■□□ 2.4
GNPTG-201ENST00000204679 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
GNPTG-201ENST00000204679 RARSP54136 660 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
GNPTG-201ENST00000204679 ATF3P18847 181 aa30■■■□□ 2.39
GNPTG-201ENST00000204679 DLG5Q8TDM6 1919 aa30■■■□□ 2.39
GNPTG-201ENST00000204679 STRCQ7RTU9 1775 aa29.99■■■□□ 2.39
GNPTG-201ENST00000204679 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa29.99■■■□□ 2.39
GNPTG-201ENST00000204679 HOXC9P31274 260 aa29.98■■■□□ 2.39
GNPTG-201ENST00000204679 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
GNPTG-201ENST00000204679 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
GNPTG-201ENST00000204679 ARHGEF10O15013 1369 aa29.97■■■□□ 2.39
GNPTG-201ENST00000204679 KIF24Q5T7B8 1368 aa29.97■■■□□ 2.39
GNPTG-201ENST00000204679 KIF1AQ12756 1690 aa29.97■■■□□ 2.39
GNPTG-201ENST00000204679 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.96■■■□□ 2.39
GNPTG-201ENST00000204679 MST1RQ04912 1400 aa29.95■■■□□ 2.38
GNPTG-201ENST00000204679 LTN1O94822 1766 aa29.94■■■□□ 2.38
GNPTG-201ENST00000204679 CANXP27824 592 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
GNPTG-201ENST00000204679 DCCP43146 1447 aa29.94■■■□□ 2.38
GNPTG-201ENST00000204679 LMOD3Q0VAK6 560 aa29.94■■■□□ 2.38
GNPTG-201ENST00000204679 BCL2L13Q9BXK5 485 aa29.94■■■□□ 2.38
GNPTG-201ENST00000204679 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
GNPTG-201ENST00000204679 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.93■■■□□ 2.38
GNPTG-201ENST00000204679 EYA1Q99502 592 aa29.93■■■□□ 2.38
GNPTG-201ENST00000204679 NFAT5O94916 1531 aa29.93■■■□□ 2.38
GNPTG-201ENST00000204679 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
GNPTG-201ENST00000204679 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
GNPTG-201ENST00000204679 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
GNPTG-201ENST00000204679 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.92■■■□□ 2.38
GNPTG-201ENST00000204679 FAM83GA6ND36 823 aa29.91■■■□□ 2.38
GNPTG-201ENST00000204679 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
GNPTG-201ENST00000204679 IGSF1Q8N6C5 1336 aa29.91■■■□□ 2.38
GNPTG-201ENST00000204679 KCNH5Q8NCM2 988 aa29.9■■■□□ 2.38
GNPTG-201ENST00000204679 RTL1A6NKG5 1358 aa29.9■■■□□ 2.38
GNPTG-201ENST00000204679 PLEKHG5O94827 1062 aa29.89■■■□□ 2.38
GNPTG-201ENST00000204679 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.88■■■□□ 2.37
GNPTG-201ENST00000204679 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
GNPTG-201ENST00000204679 KDRP35968 1356 aa29.88■■■□□ 2.37
GNPTG-201ENST00000204679 MSH6P52701 1360 aa29.87■■■□□ 2.37
GNPTG-201ENST00000204679 DCTN1Q14203 1278 aa29.87■■■□□ 2.37
GNPTG-201ENST00000204679 PDE3AQ14432 1141 aa29.87■■■□□ 2.37
GNPTG-201ENST00000204679 ZBTB7CA1YPR0 619 aa29.86■■■□□ 2.37
GNPTG-201ENST00000204679 IFT57Q9NWB7 429 aa29.86■■■□□ 2.37
GNPTG-201ENST00000204679 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
GNPTG-201ENST00000204679 GNAI1P63096 354 aa29.86■■■□□ 2.37
GNPTG-201ENST00000204679 IP6K1Q92551 441 aa29.85■■■□□ 2.37
GNPTG-201ENST00000204679 GCP02774 474 aa29.84■■■□□ 2.37
GNPTG-201ENST00000204679 PANK1Q8TE04 598 aa29.84■■■□□ 2.37
GNPTG-201ENST00000204679 ZNF853P0CG23 659 aa29.83■■■□□ 2.37
GNPTG-201ENST00000204679 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
GNPTG-201ENST00000204679 SLIT3O75094 1523 aa29.83■■■□□ 2.37
GNPTG-201ENST00000204679 SMC4Q9NTJ3 1288 aa29.82■■■□□ 2.36
GNPTG-201ENST00000204679 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
GNPTG-201ENST00000204679 SSH1Q8WYL5 1049 aa29.81■■■□□ 2.36
GNPTG-201ENST00000204679 CFAP44Q96MT7 982 aa29.81■■■□□ 2.36
GNPTG-201ENST00000204679 MBIPQ9NS73 344 aa29.81■■■□□ 2.36
GNPTG-201ENST00000204679 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
GNPTG-201ENST00000204679 USP19O94966 1318 aa29.8■■■□□ 2.36
GNPTG-201ENST00000204679 MCM10Q7L590 875 aa29.79■■■□□ 2.36
GNPTG-201ENST00000204679 TNNQ9UQP3 1299 aa29.79■■■□□ 2.36
GNPTG-201ENST00000204679 COG6Q9Y2V7 657 aa29.79■■■□□ 2.36
GNPTG-201ENST00000204679 ALS2Q96Q42 1657 aa29.78■■■□□ 2.36
GNPTG-201ENST00000204679 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
GNPTG-201ENST00000204679 ARHGEF25Q86VW2 580 aa29.76■■■□□ 2.35
GNPTG-201ENST00000204679 USHBP1Q8N6Y0 703 aa29.76■■■□□ 2.35
GNPTG-201ENST00000204679 RLBP1P12271 317 aa29.75■■■□□ 2.35
GNPTG-201ENST00000204679 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.75■■■□□ 2.35
GNPTG-201ENST00000204679 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa29.75■■■□□ 2.35
GNPTG-201ENST00000204679 CLUAP1Q96AJ1 413 aa29.75■■■□□ 2.35
GNPTG-201ENST00000204679 GAS2L2Q8NHY3 880 aa29.74■■■□□ 2.35
GNPTG-201ENST00000204679 TSPYL6Q8N831 410 aa29.73■■■□□ 2.35
GNPTG-201ENST00000204679 ALDH1L2Q3SY69 923 aa29.72■■■□□ 2.35
GNPTG-201ENST00000204679 NBPF6Q5VWK0 638 aa29.72■■■□□ 2.35
GNPTG-201ENST00000204679 NBPF4Q96M43 638 aa29.72■■■□□ 2.35
GNPTG-201ENST00000204679 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
GNPTG-201ENST00000204679 VAMP4O75379 141 aa29.71■■■□□ 2.35
GNPTG-201ENST00000204679 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
GNPTG-201ENST00000204679 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
GNPTG-201ENST00000204679 ZNF428Q96B54 188 aa29.7■■■□□ 2.35
GNPTG-201ENST00000204679 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
GNPTG-201ENST00000204679 RGPD2P0DJD1 1756 aa29.69■■■□□ 2.34
GNPTG-201ENST00000204679 C8orf58Q8NAV2 365 aa29.69■■■□□ 2.34
GNPTG-201ENST00000204679 CRB1P82279 1406 aa29.68■■■□□ 2.34
GNPTG-201ENST00000204679 CHL1O00533 1208 aa29.68■■■□□ 2.34
GNPTG-201ENST00000204679 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
GNPTG-201ENST00000204679 BRINP3Q76B58 766 aa29.68■■■□□ 2.34
GNPTG-201ENST00000204679 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms