RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000188376.9

SLC25A3-201, Transcript of solute carrier family 25 member 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A3-201ENST00000188376 FLT4P35916 1363 aa25.18■■□□□ 1.62
SLC25A3-201ENST00000188376 RIPK4P57078 832 aa25.18■■□□□ 1.62
SLC25A3-201ENST00000188376 AMPHP49418 695 aa25.17■■□□□ 1.62
SLC25A3-201ENST00000188376 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.17■■□□□ 1.62
SLC25A3-201ENST00000188376 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SLC25A3-201ENST00000188376 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.16■■□□□ 1.62
SLC25A3-201ENST00000188376 MSH6P52701 1360 aa25.15■■□□□ 1.62
SLC25A3-201ENST00000188376 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SLC25A3-201ENST00000188376 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.14■■□□□ 1.62
SLC25A3-201ENST00000188376 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25.13■■□□□ 1.61
SLC25A3-201ENST00000188376 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.13■■□□□ 1.61
SLC25A3-201ENST00000188376 RGPD1P0DJD0 1748 aa25.13■■□□□ 1.61
SLC25A3-201ENST00000188376 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SLC25A3-201ENST00000188376 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.12■■□□□ 1.61
SLC25A3-201ENST00000188376 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.12■■□□□ 1.61
SLC25A3-201ENST00000188376 LTN1O94822 1766 aa25.11■■□□□ 1.61
SLC25A3-201ENST00000188376 PLIN1O60240 522 aa25.11■■□□□ 1.61
SLC25A3-201ENST00000188376 HOXC9P31274 260 aa25.1■■□□□ 1.61
SLC25A3-201ENST00000188376 NFE2L2Q16236 605 aa25.1■■□□□ 1.61
SLC25A3-201ENST00000188376 LMOD2Q6P5Q4 547 aa25.1■■□□□ 1.61
SLC25A3-201ENST00000188376 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.09■■□□□ 1.61
SLC25A3-201ENST00000188376 NFAT5O94916 1531 aa25.09■■□□□ 1.61
SLC25A3-201ENST00000188376 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.08■■□□□ 1.61
SLC25A3-201ENST00000188376 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC25A3-201ENST00000188376 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SLC25A3-201ENST00000188376 PLEKHG5O94827 1062 aa25.06■■□□□ 1.6
SLC25A3-201ENST00000188376 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.06■■□□□ 1.6
SLC25A3-201ENST00000188376 ARHGEF10O15013 1369 aa25.06■■□□□ 1.6
SLC25A3-201ENST00000188376 RTL1A6NKG5 1358 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC25A3-201ENST00000188376 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC25A3-201ENST00000188376 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SLC25A3-201ENST00000188376 IL16Q14005 1332 aa25.03■■□□□ 1.6
SLC25A3-201ENST00000188376 EYA1Q99502 592 aa25.03■■□□□ 1.6
SLC25A3-201ENST00000188376 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.03■■□□□ 1.6
SLC25A3-201ENST00000188376 SLIT3O75094 1523 aa25.02■■□□□ 1.6
SLC25A3-201ENST00000188376 ALS2Q96Q42 1657 aa25.02■■□□□ 1.6
SLC25A3-201ENST00000188376 ZBTB7CA1YPR0 619 aa25.02■■□□□ 1.6
SLC25A3-201ENST00000188376 BCAR3O75815 825 aa25.02■■□□□ 1.6
SLC25A3-201ENST00000188376 GCP02774 474 aa25.02■■□□□ 1.6
SLC25A3-201ENST00000188376 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SLC25A3-201ENST00000188376 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.02■■□□□ 1.6
SLC25A3-201ENST00000188376 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.01■■□□□ 1.59
SLC25A3-201ENST00000188376 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.01■■□□□ 1.59
SLC25A3-201ENST00000188376 IP6K1Q92551 441 aa25■■□□□ 1.59
SLC25A3-201ENST00000188376 USP19O94966 1318 aa25■■□□□ 1.59
SLC25A3-201ENST00000188376 KDRP35968 1356 aa25■■□□□ 1.59
SLC25A3-201ENST00000188376 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
SLC25A3-201ENST00000188376 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
SLC25A3-201ENST00000188376 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.98■■□□□ 1.59
SLC25A3-201ENST00000188376 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.98■■□□□ 1.59
SLC25A3-201ENST00000188376 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SLC25A3-201ENST00000188376 FAM83GA6ND36 823 aa24.96■■□□□ 1.59
SLC25A3-201ENST00000188376 BRINP3Q76B58 766 aa24.96■■□□□ 1.59
SLC25A3-201ENST00000188376 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
SLC25A3-201ENST00000188376 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.96■■□□□ 1.59
SLC25A3-201ENST00000188376 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
SLC25A3-201ENST00000188376 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
SLC25A3-201ENST00000188376 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
SLC25A3-201ENST00000188376 CRBNQ96SW2 442 aa24.95■■□□□ 1.58
SLC25A3-201ENST00000188376 PXDNQ92626 1479 aa24.95■■□□□ 1.58
SLC25A3-201ENST00000188376 SLAIN2Q9P270 581 aa24.94■■□□□ 1.58
SLC25A3-201ENST00000188376 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SLC25A3-201ENST00000188376 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.94■■□□□ 1.58
SLC25A3-201ENST00000188376 DCTN1Q14203 1278 aa24.93■■□□□ 1.58
SLC25A3-201ENST00000188376 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.93■■□□□ 1.58
SLC25A3-201ENST00000188376 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
SLC25A3-201ENST00000188376 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
SLC25A3-201ENST00000188376 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.9■■□□□ 1.58
SLC25A3-201ENST00000188376 BCL2L13Q9BXK5 485 aa24.9■■□□□ 1.58
SLC25A3-201ENST00000188376 IFT57Q9NWB7 429 aa24.9■■□□□ 1.58
SLC25A3-201ENST00000188376 GNAI1P63096 354 aa24.89■■□□□ 1.58
SLC25A3-201ENST00000188376 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.89■■□□□ 1.57
SLC25A3-201ENST00000188376 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.89■■□□□ 1.57
SLC25A3-201ENST00000188376 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SLC25A3-201ENST00000188376 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SLC25A3-201ENST00000188376 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.88■■□□□ 1.57
SLC25A3-201ENST00000188376 NBPF4Q96M43 638 aa24.88■■□□□ 1.57
SLC25A3-201ENST00000188376 ZNF853P0CG23 659 aa24.87■■□□□ 1.57
SLC25A3-201ENST00000188376 MCM10Q7L590 875 aa24.87■■□□□ 1.57
SLC25A3-201ENST00000188376 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SLC25A3-201ENST00000188376 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.86■■□□□ 1.57
SLC25A3-201ENST00000188376 CFAP44Q96MT7 982 aa24.86■■□□□ 1.57
SLC25A3-201ENST00000188376 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
SLC25A3-201ENST00000188376 MBIPQ9NS73 344 aa24.86■■□□□ 1.57
SLC25A3-201ENST00000188376 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.85■■□□□ 1.57
SLC25A3-201ENST00000188376 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24.85■■□□□ 1.57
SLC25A3-201ENST00000188376 RGPD5Q99666 1765 aa24.85■■□□□ 1.57
SLC25A3-201ENST00000188376 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.84■■□□□ 1.57
SLC25A3-201ENST00000188376 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.83■■□□□ 1.56
SLC25A3-201ENST00000188376 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SLC25A3-201ENST00000188376 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SLC25A3-201ENST00000188376 PDE3AQ14432 1141 aa24.81■■□□□ 1.56
SLC25A3-201ENST00000188376 SMC4Q9NTJ3 1288 aa24.81■■□□□ 1.56
SLC25A3-201ENST00000188376 SSH1Q8WYL5 1049 aa24.8■■□□□ 1.56
SLC25A3-201ENST00000188376 PANK1Q8TE04 598 aa24.78■■□□□ 1.56
SLC25A3-201ENST00000188376 TSPYL6Q8N831 410 aa24.78■■□□□ 1.56
SLC25A3-201ENST00000188376 CRB1P82279 1406 aa24.78■■□□□ 1.56
SLC25A3-201ENST00000188376 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.77■■□□□ 1.56
SLC25A3-201ENST00000188376 TNNQ9UQP3 1299 aa24.77■■□□□ 1.56
SLC25A3-201ENST00000188376 ERBB3P21860 1342 aa24.77■■□□□ 1.56
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