RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 MAFKO60675 156 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 RFPL1O75677 317 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 ADH1CP00326 375 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 SERPINB4P48594 390 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 NLRP9Q7RTR0 991 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 CCNJLQ8IV13 435 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 SPON2Q9BUD6 331 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 MOCS1Q9NZB8 636 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 LIMD1Q9UGP4 676 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 SDR42E2A6NKP2 422 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 KLF11O14901 512 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 UGT1A9O60656 530 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 TGDSO95455 350 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 CNTFP26441 200 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 CSKP41240 450 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 SERINC3Q13530 473 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 PARP6Q2NL67 630 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 IL31Q6EBC2 164 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 TRIM42Q8IWZ5 723 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 KIF2BQ8N4N8 673 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 TTC8Q8TAM2 541 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 TSGA13Q96PP4 275 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 BRD8Q9H0E9 1235 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 UGT1A7Q9HAW7 530 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 UGT1A10Q9HAW8 530 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 UGT1A8Q9HAW9 530 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 NOD2Q9HC29 1040 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 GTSE1Q9NYZ3 720 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 PLLPQ9Y342 182 aa20.16■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 J3KR12 359 aa20.15■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 ALDH1A2O94788 518 aa20.15■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 KRT16P08779 473 aa20.15■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 IL9P15248 144 aa20.15■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 CCNCP24863 283 aa20.15■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 SLC8A1P32418 973 aa20.15■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 CD70P32970 193 aa20.15■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 LMAN2Q12907 356 aa20.15■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 RUNX3Q13761 415 aa20.15■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 BMPR2Q13873 1038 aa20.15■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 LRRC49Q8IUZ0 686 aa20.15■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 PLCD3Q8N3E9 789 aa20.15■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 FEM1AQ9BSK4 669 aa20.15■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 ATP13A1Q9HD20 1204 aa20.15■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 SEPT10Q9P0V9 454 aa20.15■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 TRIM33Q9UPN9 1127 aa20.15■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 F5H423 210 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 KCNK1O00180 336 aa20.14■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 BGNP21810 368 aa20.14■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 HLA-FP30511 346 aa20.14■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 WASHC5Q12768 1159 aa20.14■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 OVGP1Q12889 678 aa20.14■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 AAK1Q2M2I8 961 aa20.14■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 CASC4Q6P4E1 433 aa20.14■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 ZNF783Q6ZMS7 281 aa20.14■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 APCDD1Q8J025 514 aa20.14■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 NAT9Q9BTE0 207 aa20.14■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 LRMDAQ9H2I8 198 aa20.14■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 KCNK12Q9HB15 430 aa20.14■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 ABCB8Q9NUT2 735 aa20.14■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 IGSF9Q9P2J2 1179 aa20.14■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 ZFP69BQ9UJL9 534 aa20.14■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 COL4A3Q01955 1670 aa20.14■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 TRIM24O15164 1050 aa20.13■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 PGAM1P18669 254 aa20.13■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 GLDCP23378 1020 aa20.13■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 PSMB4P28070 264 aa20.13■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 TIFABQ6ZNK6 161 aa20.13■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa20.13■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 ZNF567Q8N184 647 aa20.13■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 CPA6Q8N4T0 437 aa20.13■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 RFWD2Q8NHY2 731 aa20.13■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 INPP5DQ92835 1189 aa20.13■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 ALG14Q96F25 216 aa20.13■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 LMLNQ96KR4 655 aa20.13■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 CEP41Q9BYV8 373 aa20.13■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 BRD9Q9H8M2 597 aa20.13■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 SP110Q9HB58 689 aa20.13■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 DCTN4Q9UJW0 460 aa20.13■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 VPS28Q9UK41 221 aa20.13■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 OR51B4Q9Y5P0 310 aa20.13■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa20.13■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 CACNG3O60359 315 aa20.13■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 ZNF33AQ06730 810 aa20.13■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 NAB1Q13506 487 aa20.13■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 GAB4Q2WGN9 574 aa20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms