RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	GRIA2	P42262	883 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	XIAP	P98170	497 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	7.32	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	RUNX3	Q13761	415 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	TGFBI	Q15582	683 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	TRNP1	Q6NT89	227 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	LINGO4	Q6UY18	593 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	C12orf40	Q86WS4	652 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	DEFB119	Q8N690	84 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	SEC14L1	Q92503	715 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	SPATA17	Q96L03	361 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	TCF12	Q99081	682 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	SAR1A	Q9NR31	198 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	RAD54B	Q9Y620	910 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1W2PQJ5	194 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	KRBA1	A5PL33	1030 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	SOBP	A7XYQ1	873 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495		H0Y858	1186 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	PFDN6	O15212	129 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	PMM2	O15305	246 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	KRT36	O76013	467 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	CHRNB1	P11230	501 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	HLA-E	P13747	358 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	PRKACB	P22694	351 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	ETV3	P41162	512 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	GSS	P48637	474 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	PCYT1A	P49585	367 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	NEK3	P51956	506 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	MGAT5	Q09328	741 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	ASPH	Q12797	758 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	MED21	Q13503	144 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	PKDCC	Q504Y2	493 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	MTSS1L	Q765P7	747 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	ALLC	Q8N6M5	410 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC185	Q8N715	623 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	MS4A14	Q96JA4	679 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	CTRC	Q99895	268 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	HAO1	Q9UJM8	370 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC188	H7C350	402 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	CYBB	P04839	570 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	CDH3	P22223	829 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	IL4R	P24394	825 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	CCR1	P32246	355 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC11A2	P49281	568 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	SNX16	P57768	344 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	OGDH	Q02218	1023 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	DHCR24	Q15392	516 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	TRADD	Q15628	312 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	FIGN	Q5HY92	759 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM124A	Q86V42	546 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	SUN5	Q8TC36	379 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	GANC	Q8TET4	914 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM3C	Q92520	227 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	ERP27	Q96DN0	273 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	SGF29	Q96ES7	293 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	MUC3B	Q9H195	1237 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	KLHL3	Q9UH77	587 aa		7.31	□□□□□ -1.24

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