RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617055.4

UBE2C-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene UBE2C, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-208ENST00000617055 PHF19Q5T6S3 580 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 KLHL10Q6JEL2 608 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 BORAQ6PGQ7 559 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 ENPP7Q6UWV6 458 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 SPRED1Q7Z699 444 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 FAM81BQ96LP2 452 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 HAPLN3Q96S86 360 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 SLC12A9Q9BXP2 914 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 TMEM51Q9NW97 253 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 RNF215Q9Y6U7 377 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 CLEC18AA5D8T8 446 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 ITIH2P19823 946 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 ETFBP38117 255 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 KCNAB2Q13303 367 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 LRRC14Q15048 493 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 IGFBP7Q16270 282 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 SLC25A52Q3SY17 297 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 CERCAMQ5T4B2 595 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 TMEM164Q5U3C3 297 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 ISM2Q6H9L7 571 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 TRIM65Q6PJ69 517 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 CLEC18BQ6UXF7 455 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 GDPD4Q6W3E5 623 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 NYAP1Q6ZVC0 841 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 SLITRK4Q8IW52 837 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 CLEC18CQ8NCF0 446 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 CRACR2AQ9BSW2 395 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 B3GNT4Q9C0J1 378 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 GDPD2Q9HCC8 539 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 KLQ9UEF7 1012 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 STMND1H3BQB6 276 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 GNA14O95837 355 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 PNLIPP16233 465 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 KRT9P35527 623 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 CASRP41180 1078 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 PPP1R2P41236 205 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 MARSP56192 900 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 POLE2P56282 527 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 WSCD2Q2TBF2 565 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 ATL2Q8NHH9 583 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 NELFBQ8WX92 580 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 SHC3Q92529 594 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP18.29■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 COQ6Q9Y2Z9 468 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 OR1A2Q9Y585 309 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 ANKRD36A6QL64 1941 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 BICDL2A1A5D9 508 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 TNFP01375 233 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 ATP1A2P50993 1020 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 PTK2Q05397 1052 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 SERINC3Q13530 473 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 ARHGEF7Q14155 803 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 C16orf72Q14CZ0 275 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 FOXR2Q6PJQ5 311 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 OGFOD3Q6PK18 319 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 LEKR1Q6ZMV7 388 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 APOOQ9BUR5 198 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 SEMA6CQ9H3T2 930 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 PLCB1Q9NQ66 1216 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 LRIT1Q9P2V4 623 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 TUBD1Q9UJT1 453 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 HPCAL4Q9UM19 191 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 UNC79Q9P2D8 2635 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 TIMP2P16035 220 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 APBA1Q02410 837 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 INPP5AQ14642 412 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 MAP9Q49MG5 647 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 TMEM52BQ4KMG9 183 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 C14orf28Q4W4Y0 310 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 KCTD16Q68DU8 428 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 TAF8Q7Z7C8 310 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 FAM131BQ86XD5 332 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 FAM46DQ8NEK8 389 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 PDXPQ96GD0 296 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 WDR92Q96MX6 357 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 NDFIP2Q9NV92 336 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 DKK3Q9UBP4 350 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 APEX2Q9UBZ4 518 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 MAN1B1Q9UKM7 699 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 CTNND2Q9UQB3 1225 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 DGKBQ9Y6T7 804 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2C-208ENST00000617055 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2C-208ENST00000617055 CCL4P13236 92 aa18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms