RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	EFS	O43281	561 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	BUB1	O43683	1085 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	KDELR3	O43731	214 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	PIGN	O95427	931 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	TIMP2	P16035	220 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	SDC4	P31431	198 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	PTPN9	P43378	593 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	KLK7	P49862	253 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	HK3	P52790	923 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	PPARD	Q03181	441 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	PTP4A2	Q12974	167 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	HID1	Q8IV36	788 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	ARL14	Q8N4G2	192 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	ARL10	Q8N8L6	244 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	MED8	Q96G25	268 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	PDXP	Q96GD0	296 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	STK33	Q9BYT3	514 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	GULP1	Q9UBP9	304 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	LHX3	Q9UBR4	397 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	PLD2	O14939	933 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	EPHB6	O15197	1021 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	NOBOX	O60393	691 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	GFPT2	O94808	682 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	IGSF6	O95976	241 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC5A2	P31639	672 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	RHOA	P61586	193 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	CDR2	Q01850	454 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	TGIF1	Q15583	401 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	STRADA	Q7RTN6	431 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR48	Q8TAF3	677 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	GLMN	Q92990	594 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	NTAN1	Q96AB6	310 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	HMCES	Q96FZ2	354 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	DKK3	Q9UBP4	350 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	OR1A2	Q9Y585	309 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	FLNC	Q14315	2725 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	TSPAN11	A1L157	253 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC28A2	O43868	658 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	PRKCG	P05129	697 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	UGT1A5	P35504	534 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	JAM2	P57087	298 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	UBE2H	P62256	183 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	CCL7	P80098	99 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	NFATC4	Q14934	902 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC14	Q15048	493 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	ELOC	Q15369	112 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF677	Q86XU0	584 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	EXD3	Q8N9H8	876 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR34	Q9UPC5	381 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	RASA4B	C9J798	803 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	AGRP	O00253	132 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	TOR1B	O14657	336 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	CCP110	O43303	1012 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	RASA4	O43374	803 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	RASGRP1	O95267	797 aa		12.04	□□□□□ -0.48

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