RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 ANO10Q9NW15 660 aa12.24□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 FANCLQ9NW38 375 aa12.24□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 SPASTQ9UBP0 616 aa12.24□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 RABGEF1Q9UJ41 708 aa12.24□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa12.24□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 YY2O15391 372 aa12.23□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 KLK10O43240 276 aa12.23□□□□□ -0.45
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CTIF-208ENST00000590422 STAT1P42224 750 aa12.23□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
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CTIF-208ENST00000590422 CYTH1Q15438 398 aa12.23□□□□□ -0.45
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CTIF-208ENST00000590422 SCYL2Q6P3W7 929 aa12.23□□□□□ -0.45
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CTIF-208ENST00000590422 PCDH19Q8TAB3 1148 aa12.23□□□□□ -0.45
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CTIF-208ENST00000590422 TBATAQ96M53 351 aa12.23□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 SLC13A1Q9BZW2 595 aa12.23□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 PDFQ9HBH1 243 aa12.23□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 THSD1Q9NS62 852 aa12.23□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa12.23□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa12.23□□□□□ -0.45
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CTIF-208ENST00000590422 FZD10Q9ULW2 581 aa12.23□□□□□ -0.45
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CTIF-208ENST00000590422 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
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CTIF-208ENST00000590422 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 TSPAN11A1L157 253 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 SIGLEC16A6NMB1 481 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 LGALS16A8MUM7 142 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 WASH4PA8MWX3 477 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 CDRT15L2A8MXV6 281 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 CALB1P05937 261 aa12.22□□□□□ -0.45
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CTIF-208ENST00000590422 C6P13671 934 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 PLA2G2AP14555 144 aa12.22□□□□□ -0.45
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CTIF-208ENST00000590422 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 DNAJC24Q6P3W2 148 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 IGF2-ASQ6U949 168 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 PDXPQ96GD0 296 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 SLC46A1Q96NT5 459 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 CCDC3Q9BQI4 270 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 ANP32EQ9BTT0 268 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 SEMA4CQ9C0C4 833 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 LRRC19Q9H756 370 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 PCDH12Q9NPG4 1184 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 SIRPGQ9P1W8 387 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 OR1A2Q9Y585 309 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 LRRC10BA6NIK2 292 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 J3KR12 359 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 ERVH48-1M5A8F1 160 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 TCEA3O75764 348 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 MMP12P39900 470 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 HK3P52790 923 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 RAD51Q06609 339 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 LRRC14Q15048 493 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 UGP2Q16851 508 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 BROXQ5VW32 411 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 FOXR1Q6PIV2 292 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 CAMK1DQ8IU85 385 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 HID1Q8IV36 788 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 ARL10Q8N8L6 244 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 NAT6Q93015 286 aa12.21□□□□□ -0.45
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