RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589550.1

PIK3C3-211, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3-211ENST00000589550 PMS2CLQ68D20 193 aa5.51□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 CEP85Q6P2H3 762 aa5.51□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 PET117Q6UWS5 81 aa5.51□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 CFAP77Q6ZQR2 320 aa5.51□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 SEPT14Q6ZU15 432 aa5.51□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 TMEM217Q8N7C4 229 aa5.51□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 MCUQ8NE86 351 aa5.51□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 OR6J1Q8NGC5 347 aa5.51□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 PROKR1Q8TCW9 393 aa5.51□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 ACTRT2Q8TDY3 377 aa5.51□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 PIGOQ8TEQ8 1089 aa5.51□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 NSMCE1Q8WV22 266 aa5.51□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 IP6K1Q92551 441 aa5.51□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM162AQ96A26 154 aa5.51□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 SPAG5Q96R06 1193 aa5.51□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 WDR11Q9BZH6 1224 aa5.51□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 SETD4Q9NVD3 440 aa5.51□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 WDR35Q9P2L0 1181 aa5.51□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 LRIT1Q9P2V4 623 aa5.51□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 MTRRQ9UBK8 725 aa5.51□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 AMACRQ9UHK6 382 aa5.51□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 TRIM64A6NGJ6 449 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 TRIM64BA6NI03 449 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 DBX1A6NMT0 343 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 SMTNL1A8MU46 457 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 WDR46O15213 610 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC7A4O43246 635 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 NKX2-2O95096 273 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 SLU7O95391 586 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 LCKP06239 509 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 CYP2D6P10635 497 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 CFPP27918 469 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 EPHB2P29323 1055 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 AVPR1BP47901 424 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 CENPAP49450 140 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 CLCNKBP51801 687 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 CLDN2P57739 230 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC18A2Q05940 514 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 GRAPQ13588 217 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 NAB2Q15742 525 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 ASIC2Q16515 512 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 COL28A1Q2UY09 1125 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM153CQ494X1 144 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 C6orf141Q5SZD1 244 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 CST9LP1Q5W188 147 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 TDRPQ86YL5 185 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 C1QL4Q86Z23 238 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 LCORLQ8N3X6 602 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC44A3Q8N4M1 653 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 CHST13Q8NET6 341 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 Q8NFD4 153 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 GDAP1Q8TB36 358 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 SIPA1Q96FS4 1042 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 COQ10AQ96MF6 247 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 SIN3AQ96ST3 1273 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 PAFAH2Q99487 392 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 CCDC106Q9BWC9 280 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 NUF2Q9BZD4 464 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 OSGIN1Q9UJX0 560 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 CMAHPQ9Y471 501 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 MAU2Q9Y6X3 613 aa5.5□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa5.49□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa5.49□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 A6NL46 340 aa5.49□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 UBE2Q2LH0YL09 131 aa5.49□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 ADAMDEC1O15204 470 aa5.49□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 DAB1O75553 588 aa5.49□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 PSMD10O75832 226 aa5.49□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 FYNP06241 537 aa5.49□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 EDN2P20800 178 aa5.49□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 PTAFRP25105 342 aa5.49□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 TACR3P29371 465 aa5.49□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 CIITAP33076 1130 aa5.49□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 MCM7P33993 719 aa5.49□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 RYKP34925 604 aa5.49□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF124Q15973 351 aa5.49□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 TCTN1Q2MV58 587 aa5.49□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 SPDYAQ5MJ70 313 aa5.49□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 LRIG3Q6UXM1 1119 aa5.49□□□□□ -1.53
PIK3C3-211ENST00000589550 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms