RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 MPOP05164 745 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 GABRR2P28476 465 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 RPS9P46781 194 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 POLD2P49005 469 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 LIMK2P53671 638 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 TMPRSS15P98073 1019 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 FCHO2Q0JRZ9 810 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC153Q494R4 210 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 SCD5Q86SK9 330 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 ATPAF2Q8N5M1 289 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 DNAAF3Q8N9W5 541 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 SKA1Q96BD8 255 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC3BQ96PB8 259 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 RBBP8Q99708 897 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 KIFC1Q9BW19 673 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC13A1Q9BZW2 595 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 ATXN3LQ9H3M9 355 aa25.73■■□□□ 1.71
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 PAGE1O75459 146 aa25.72■■□□□ 1.71
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CAPNS1-204ENST00000587718 GRK2P25098 689 aa25.72■■□□□ 1.71
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CAPNS1-204ENST00000587718 KCNJ2P63252 427 aa25.72■■□□□ 1.71
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CAPNS1-204ENST00000587718 CRLF3Q8IUI8 442 aa25.72■■□□□ 1.71
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CAPNS1-204ENST00000587718 TLR6Q9Y2C9 796 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
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CAPNS1-204ENST00000587718 MAN2B1O00754 1011 aa25.71■■□□□ 1.71
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CAPNS1-204ENST00000587718 PSEN1P49768 467 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 GEMP55040 296 aa25.71■■□□□ 1.71
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CAPNS1-204ENST00000587718 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 SCAMP5Q8TAC9 235 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 WWP1Q9H0M0 922 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
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CAPNS1-204ENST00000587718 FBXO4Q9UKT5 387 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa25.71■■□□□ 1.71
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CAPNS1-204ENST00000587718 STX3Q13277 289 aa25.7■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 VEPH1Q14D04 833 aa25.7■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 CHI3L2Q15782 390 aa25.7■■□□□ 1.71
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLC39A13Q96H72 371 aa25.7■■□□□ 1.71
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CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa25.7■■□□□ 1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 NOD2Q9HC29 1040 aa25.7■■□□□ 1.71
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CAPNS1-204ENST00000587718 MIA3Q5JRA6 1907 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-204ENST00000587718 TPP1O14773 563 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-204ENST00000587718 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF528Q3MIS6 628 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-204ENST00000587718 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR158Q5T848 1215 aa25.69■■□□□ 1.7
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CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM150AQ86TG1 271 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-204ENST00000587718 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-204ENST00000587718 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-204ENST00000587718 TASP1Q9H6P5 420 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-204ENST00000587718 GLOD4Q9HC38 313 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-204ENST00000587718 OBP2AQ9NY56 170 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-204ENST00000587718 HEY2Q9UBP5 337 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-204ENST00000587718 PIAS3Q9Y6X2 628 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-204ENST00000587718 KRT16P08779 473 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-204ENST00000587718 NDST2P52849 883 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-204ENST00000587718 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-204ENST00000587718 PCID2Q5JVF3 399 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-204ENST00000587718 ARTNQ5T4W7 220 aa25.69■■□□□ 1.7
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