RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587256.1

ATG4D-207, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-207ENST00000587256 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ATG4D-207ENST00000587256 KLHDC7BQ96G42 594 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4D-207ENST00000587256 RNF157Q96PX1 679 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4D-207ENST00000587256 MGME1Q9BQP7 344 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4D-207ENST00000587256 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
ATG4D-207ENST00000587256 SCUBE2Q9NQ36 999 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4D-207ENST00000587256 TTLL3Q9Y4R7 772 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4D-207ENST00000587256 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4D-207ENST00000587256 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4D-207ENST00000587256 KNL1Q8NG31 2342 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 A0A1B0GTQ1 180 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 A6NNZ2 444 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 ZNF487B1APH4 448 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 YKT6O15498 198 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 MMP20O60882 483 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 ADRB1P08588 477 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 ITIH2P19823 946 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 MAXP61244 160 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 DYNLT1P63172 113 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 FGL2Q14314 439 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 UGP2Q16851 508 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 DAAM2Q86T65 1068 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 KIAA1328Q86T90 577 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 ZSWIM9Q86XI8 627 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 VSIG1Q86XK7 387 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 CCNYQ8ND76 341 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 ACRBPQ8NEB7 543 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 CAMK1GQ96NX5 476 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 NUDCD1Q96RS6 583 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 NT5MQ9NPB1 228 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 PCDH12Q9NPG4 1184 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 HAUS2Q9NVX0 235 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 HEY1Q9Y5J3 304 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 SHROOM3Q8TF72 1996 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 TRPM6Q9BX84 2022 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 FPGTO14772 594 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 RAD51BO15315 384 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 SOCS5O75159 536 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 TM7SF2O76062 418 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 PRKCGP05129 697 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 MMP12P39900 470 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 GRK6P43250 576 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 VAV2P52735 878 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 FAM193AP78312 1265 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 ITKQ08881 620 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 PGBD5Q8N414 524 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 PLD5Q8N7P1 536 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 DENND6BQ8NEG7 585 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 OR13H1Q8NG92 308 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 DTLQ9NZJ0 730 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 ALG6Q9Y672 507 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 DOCK9Q9BZ29 2069 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 RCCD1A6NED2 376 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 MATN3O15232 486 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 PCDHGA12O60330 932 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 CPP00450 1065 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 ITGAVP06756 1048 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 CR2P20023 1033 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 CCNCP24863 283 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 SEMG2Q02383 582 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 TMEM52BQ4KMG9 183 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 RALGPS1Q5JS13 557 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 SLC9A4Q6AI14 798 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 MFSD7Q6UXD7 560 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 GATAD2AQ86YP4 633 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 TMEM139Q8IV31 216 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 CCDC50Q8IVM0 306 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 CCDC13Q8IYE1 715 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 TXLNBQ8N3L3 684 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 TPCN2Q8NHX9 752 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 FAM174AQ8TBP5 190 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 RHBDD1Q8TEB9 315 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 LRRN4Q8WUT4 740 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 ASB12Q8WXK4 309 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 HDAC11Q96DB2 347 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4D-207ENST00000587256 ECHDC3Q96DC8 303 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms