RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 FGL2Q14314 439 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF235Q14590 738 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 MESDQ14696 234 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 LBRQ14739 615 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 SHBQ15464 509 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 ST3GAL2Q16842 350 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM259Q4ZIN3 620 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF542PQ5EBM4 170 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 ERAP2Q6P179 960 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 GLRX5Q86SX6 157 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 SRLQ86TD4 932 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 CAMK1DQ8IU85 385 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 CNGA4Q8IV77 575 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 TP53INP2Q8IXH6 220 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 NPWQ8N729 165 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 NIPA2Q8N8Q9 360 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM145Q8NBT3 493 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.41□□□□□ -1.06
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PTPRM-214ENST00000583153 CHP1Q99653 195 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 PACSIN1Q9BY11 444 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 PDFQ9HBH1 243 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 PCDH18Q9HCL0 1135 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 KLHL11Q9NVR0 708 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 DNAJC28Q9NX36 388 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 UVRAGQ9P2Y5 699 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 SEPT3Q9UH03 358 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 LCMT1Q9UIC8 334 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 KLK13Q9UKR3 277 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP8.41□□□□□ -1.06
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PTPRM-214ENST00000583153 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 ENC1O14682 589 aa8.4□□□□□ -1.06
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PTPRM-214ENST00000583153 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
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PTPRM-214ENST00000583153 TMEM253P0C7T8 217 aa8.4□□□□□ -1.06
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PTPRM-214ENST00000583153 ITKQ08881 620 aa8.4□□□□□ -1.06
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PTPRM-214ENST00000583153 SLC10A7Q0GE19 358 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 UGP2Q16851 508 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa8.4□□□□□ -1.06
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PTPRM-214ENST00000583153 TMCO4Q5TGY1 634 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 MARC1Q5VT66 337 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 AFMIDQ63HM1 303 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 BRAT1Q6PJG6 821 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa8.4□□□□□ -1.06
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PTPRM-214ENST00000583153 MAP7D3Q8IWC1 876 aa8.4□□□□□ -1.06
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PTPRM-214ENST00000583153 HCAR2Q8TDS4 363 aa8.4□□□□□ -1.06
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PTPRM-214ENST00000583153 BMFQ96LC9 184 aa8.4□□□□□ -1.06
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PTPRM-214ENST00000583153 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa8.4□□□□□ -1.06
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PTPRM-214ENST00000583153 TRPM6Q9BX84 2022 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-214ENST00000583153 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 NEMP2A6NFY4 417 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 A8MX80 341 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 H3BM21 787 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 AREL1O15033 823 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 FFAR2O15552 330 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
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