RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-208	ENST00000579743	UGP2	Q16851	508 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	BBS5	Q8N3I7	341 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	LZTR1	Q8N653	840 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	ZWILCH	Q9H900	591 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	THSD1	Q9NS62	852 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	GGT7	Q9UJ14	662 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	CFAP69	A5D8W1	941 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	LMO7DN	F2Z398	122 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	TCEA3	O75764	348 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	RASGRP1	O95267	797 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	GIMD1	P0DJR0	217 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	MYBL1	P10243	752 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	ATP1A3	P13637	1013 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	KEL	P23276	732 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	IGFALS	P35858	605 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	ARL4A	P40617	200 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	LSS	P48449	732 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	UCN	P55089	124 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	GABRE	P78334	506 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	BCL2L1	Q07817	233 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	NCAPH	Q15003	741 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	CYTH1	Q15438	398 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	EXOC2	Q96KP1	924 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	LHX3	Q9UBR4	397 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	MYLK	Q15746	1914 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743		A0A1W2PQ67	120 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743		A0A1W2PQC6	194 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	LRRC53	A6NM62	1247 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	DFFA	O00273	331 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	MUSK	O15146	869 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	SPINT1	O43278	529 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	PIGN	O95427	931 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	SERPINC1	P01008	464 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	MPO	P05164	745 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	HCAR3	P49019	387 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	IRF4	Q15306	451 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	RFX8	Q6ZV50	586 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	SRL	Q86TD4	932 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	GKN2	Q86XP6	184 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	HID1	Q8IV36	788 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF653	Q96CK0	615 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	KLC2	Q9H0B6	622 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	LRRC19	Q9H756	370 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	TSPAN11	A1L157	253 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743		H3BRJ5	948 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743		J3KR12	359 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	TK2	O00142	265 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	INSIG1	O15503	277 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	TNF	P01375	233 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	C6	P13671	934 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
GGA3-208	ENST00000579743	ERCC2	P18074	760 aa		13.82	□□□□□ -0.2

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