RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572010.5

SLC12A4-208, Transcript of solute carrier family 12 member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC12A4, Length 1,016 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4-208ENST00000572010 HCAR2Q8TDS4 363 aa21.47■■□□□ 1.03
SLC12A4-208ENST00000572010 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SLC12A4-208ENST00000572010 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SLC12A4-208ENST00000572010 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SLC12A4-208ENST00000572010 VPS16Q9H269 839 aa21.47■■□□□ 1.03
SLC12A4-208ENST00000572010 NLRC4Q9NPP4 1024 aa21.47■■□□□ 1.03
SLC12A4-208ENST00000572010 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SLC12A4-208ENST00000572010 ANKRD62A6NC57 917 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4-208ENST00000572010 CDRT15L2A8MXV6 281 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4-208ENST00000572010 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4-208ENST00000572010 J3QKU1 62 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4-208ENST00000572010 STAT1P42224 750 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4-208ENST00000572010 HK3P52790 923 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4-208ENST00000572010 GRM3Q14832 879 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4-208ENST00000572010 SYCP1Q15431 976 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4-208ENST00000572010 FKBP15Q5T1M5 1219 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4-208ENST00000572010 RD3Q7Z3Z2 195 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4-208ENST00000572010 GKN2Q86XP6 184 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4-208ENST00000572010 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4-208ENST00000572010 ARL10Q8N8L6 244 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4-208ENST00000572010 NETO2Q8NC67 525 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4-208ENST00000572010 ATL2Q8NHH9 583 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4-208ENST00000572010 VOPP1Q96AW1 172 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4-208ENST00000572010 GANQ9H2C0 597 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4-208ENST00000572010 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4-208ENST00000572010 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4-208ENST00000572010 WDR70Q9NW82 654 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4-208ENST00000572010 SIRPGQ9P1W8 387 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4-208ENST00000572010 NEU3Q9UQ49 428 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4-208ENST00000572010 SSUH2Q9Y2M2 353 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC12A4-208ENST00000572010 RASA4BC9J798 803 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 RASA4O43374 803 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 CREB3O43889 395 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 RASGRP1O95267 797 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 CALB1P05937 261 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 UNGP13051 313 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 SKOR1P84550 965 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 LY6DQ14210 128 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 IRF4Q15306 451 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 PARP15Q460N3 678 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 CFAP58Q5T655 872 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 WDR59Q6PJI9 974 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 ENPP7Q6UWV6 458 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 PYROXD2Q8N2H3 581 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 HMCESQ96FZ2 354 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 EDEM3Q9BZQ6 932 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 STRADBQ9C0K7 418 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 SIGLEC16A6NMB1 481 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 K7ENP7 123 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 ITGA2BP08514 1039 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 KLK7P49862 253 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 SERINC3Q13530 473 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 ERAP2Q6P179 960 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 CLEC14AQ86T13 490 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 DNAAF5Q86Y56 855 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 OR6C4Q8NGE1 309 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 PCDHB18PQ96TA0 734 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 APOOQ9BUR5 198 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 KLC2Q9H0B6 622 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 SUV39H2Q9H5I1 410 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 DONSONQ9NYP3 566 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 GPR34Q9UPC5 381 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 COQ6Q9Y2Z9 468 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 INSIG1O15503 277 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 C6P13671 934 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 DESP17661 470 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 GSCP56915 257 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 JAM2P57087 298 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 SRP54P61011 504 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 PTP4A2Q12974 167 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 INPP5AQ14642 412 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 CYTH1Q15438 398 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 TCEA2Q15560 299 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 UGP2Q16851 508 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 WSCD2Q2TBF2 565 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 FBXO39Q8N4B4 442 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 C3orf20Q8ND61 904 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 PCDH19Q8TAB3 1148 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 TTC9Q92623 222 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 CCDC74AQ96AQ1 378 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 EXOC2Q96KP1 924 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 EPB41L5Q9HCM4 733 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4-208ENST00000572010 MGAQ8IWI9 3026 aa21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms