RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567828.1

PPP4C-212, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-212ENST00000567828 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 NXPE2Q96DL1 559 aa22.94■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 SP110Q9HB58 689 aa22.94■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 U3KQA8 63 aa22.94■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 TSPAN11A1L157 253 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 PALMO75781 387 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 CKMT1AP12532 417 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 IL1R2P27930 398 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 THOP1P52888 689 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 TPM4P67936 248 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 ELP6Q0PNE2 266 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 DPYSQ14117 519 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 GRM3Q14832 879 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 SMTNL2Q2TAL5 461 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 TMEM52BQ4KMG9 183 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 ZSWIM9Q86XI8 627 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 CAMK1DQ8IU85 385 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 TP53INP2Q8IXH6 220 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 RBFAQ8N0V3 343 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 RFFLQ8WZ73 363 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 PCDH12Q9NPG4 1184 aa22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 A0A1W2PQJ5 194 aa22.92■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 AQP9O43315 295 aa22.92■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 PRKCGP05129 697 aa22.92■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 UBASH3AP57075 661 aa22.92■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 SEMG2Q02383 582 aa22.92■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 IRF4Q15306 451 aa22.92■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 UGP2Q16851 508 aa22.92■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 CFAP58Q5T655 872 aa22.92■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 SRLQ86TD4 932 aa22.92■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 LMX1AQ8TE12 382 aa22.92■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 DUSP23Q9BVJ7 150 aa22.92■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 CLCA2Q9UQC9 943 aa22.92■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 C6P13671 934 aa22.91■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 PCK1P35558 622 aa22.91■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 SUOXP51687 545 aa22.91■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 E2F1Q01094 437 aa22.91■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 PTK2BQ14289 1009 aa22.91■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 COL28A1Q2UY09 1125 aa22.91■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 DEFB133Q30KQ1 61 aa22.91■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 FAM181AQ8N9Y4 354 aa22.91■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 HCAR2Q8TDS4 363 aa22.91■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 CPLX3Q8WVH0 158 aa22.91■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 HSPH1Q92598 858 aa22.91■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa22.91■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa22.91■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 ZWILCHQ9H900 591 aa22.91■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 KIF26BQ2KJY2 2108 aa22.91■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 MUSKO15146 869 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 MMP12P39900 470 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 CSNK1DP48730 415 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 HCAR3P49019 387 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 YPEL5P62699 121 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 IL10RBQ08334 325 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 DPYSL2Q16555 572 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 BRAT1Q6PJG6 821 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 MACC1Q6ZN28 852 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 PHACTR4Q8IZ21 702 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 BTBD6Q96KE9 485 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 THAP2Q9H0W7 228 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 ETNK2Q9NVF9 386 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 AK5Q9Y6K8 562 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa22.9■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 H3BRJ5 948 aa22.89■■□□□ 1.25
PPP4C-212ENST00000567828 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PPP4C-212ENST00000567828 OPA1O60313 960 aa22.89■■□□□ 1.25
PPP4C-212ENST00000567828 MT-CO3P00414 261 aa22.89■■□□□ 1.25
PPP4C-212ENST00000567828 SERPING1P05155 500 aa22.89■■□□□ 1.25
PPP4C-212ENST00000567828 AMPD1P23109 780 aa22.89■■□□□ 1.25
PPP4C-212ENST00000567828 SERPINA4P29622 427 aa22.89■■□□□ 1.25
PPP4C-212ENST00000567828 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PPP4C-212ENST00000567828 LIG3P49916 1009 aa22.89■■□□□ 1.25
PPP4C-212ENST00000567828 C1orf61Q13536 156 aa22.89■■□□□ 1.25
PPP4C-212ENST00000567828 ACAP1Q15027 740 aa22.89■■□□□ 1.25
PPP4C-212ENST00000567828 LRRC14Q15048 493 aa22.89■■□□□ 1.25
PPP4C-212ENST00000567828 WSCD2Q2TBF2 565 aa22.89■■□□□ 1.25
PPP4C-212ENST00000567828 PRRT3Q5FWE3 981 aa22.89■■□□□ 1.25
PPP4C-212ENST00000567828 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa22.89■■□□□ 1.25
PPP4C-212ENST00000567828 ERAP2Q6P179 960 aa22.89■■□□□ 1.25
PPP4C-212ENST00000567828 BTN2A2Q8WVV5 523 aa22.89■■□□□ 1.25
PPP4C-212ENST00000567828 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PPP4C-212ENST00000567828 DCBLD2Q96PD2 775 aa22.89■■□□□ 1.25
PPP4C-212ENST00000567828 LRRC61Q9BV99 259 aa22.89■■□□□ 1.25
PPP4C-212ENST00000567828 NRSN2Q9GZP1 204 aa22.89■■□□□ 1.25
PPP4C-212ENST00000567828 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
PPP4C-212ENST00000567828 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms