RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 SIRPGQ9P1W8 387 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGSF10Q6WRI0 2623 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANKRD36A6QL64 1941 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A087WV48 116 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 PMS2P1A4D2B8 440 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARHGAP42A6NI28 874 aa7.24□□□□□ -1.25
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ANXA6P08133 673 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC172P0C7W6 258 aa7.24□□□□□ -1.25
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CCNDBP1-212ENST00000567690 TCF4P15884 667 aa7.24□□□□□ -1.25
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CCNDBP1-212ENST00000567690 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ELP6Q0PNE2 266 aa7.24□□□□□ -1.25
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CCNDBP1-212ENST00000567690 SMTNL2Q2TAL5 461 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 WSCD2Q2TBF2 565 aa7.24□□□□□ -1.25
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CCNDBP1-212ENST00000567690 PERM1Q5SV97 790 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 KCTD16Q68DU8 428 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa7.24□□□□□ -1.25
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CCNDBP1-212ENST00000567690 RFX8Q6ZV50 586 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZSWIM9Q86XI8 627 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CAMK1DQ8IU85 385 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 HID1Q8IV36 788 aa7.24□□□□□ -1.25
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CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC35F3Q8IY50 421 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 NPWQ8N729 165 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCDH19Q8TAB3 1148 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM174AQ8TBP5 190 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 RFFLQ8WZ73 363 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CENPTQ96BT3 561 aa7.24□□□□□ -1.25
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CCNDBP1-212ENST00000567690 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
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CCNDBP1-212ENST00000567690 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC13A1Q9BZW2 595 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC39A8Q9C0K1 460 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 NRSN2Q9GZP1 204 aa7.24□□□□□ -1.25
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CCNDBP1-212ENST00000567690 RETREG1Q9H6L5 497 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZWILCHQ9H900 591 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 PDFQ9HBH1 243 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 PARVAQ9NVD7 372 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 EVA1BQ9NVM1 165 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 WDR70Q9NW82 654 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPASTQ9UBP0 616 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 GULP1Q9UBP9 304 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 DOLKQ9UPQ8 538 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR1A2Q9Y585 309 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAI2Q9Y5P3 530 aa7.24□□□□□ -1.25
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CCNDBP1-212ENST00000567690 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ASPMQ8IZT6 3477 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 KNTC1P50748 2209 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM191CA6NGB0 347 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRRC10BA6NIK2 292 aa7.23□□□□□ -1.25
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CCNDBP1-212ENST00000567690 WASH4PA8MWX3 477 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 RRP8O43159 456 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRCH4O75427 683 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 PALMO75781 387 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 RNF8O76064 485 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 FTLP02792 175 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRB1P04280 392 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ERCC2P18074 760 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 MIPP30301 263 aa7.23□□□□□ -1.25
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