RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	RMDN1	Q96DB5	314 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	PGAM5	Q96HS1	289 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	GBP5	Q96PP8	586 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	MAP7D2	Q96T17	732 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SPX	Q9BT56	116 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	APOL6	Q9BWW8	343 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	FUT8	Q9BYC5	575 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM5	Q9C035	493 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	TNMD	Q9H2S6	317 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	MPP6	Q9NZW5	540 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CDH22	Q9UJ99	828 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	KCND3	Q9UK17	655 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	AMFR	Q9UKV5	643 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SARDH	Q9UL12	918 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	BAG5	Q9UL15	447 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0U1RQK1	487 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF320	A2RRD8	509 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957		A8MZ25	164 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	TEX22	C9J3V5	150 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	BTBD19	C9JJ37	291 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957		J3KTA2	159 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	RGS10	O43665	173 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	PRPSAP2	O60256	369 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	KERA	O60938	352 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	PMPCB	O75439	489 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	TAF5L	O75529	589 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	OR2C1	O95371	312 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	GGPS1	O95749	300 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	GUCA1C	O95843	209 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	OLFM2	O95897	454 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CPA1	P15085	419 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	GAP43	P17677	238 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	TNFRSF1B	P20333	461 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	GCH1	P30793	250 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	GGT5	P36269	586 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	PNPLA4	P41247	253 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	MTHFS	P49914	203 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	GPC3	P51654	580 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	HILS1	P60008	231 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	LMAN2	Q12907	356 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	GPS1	Q13098	491 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CCNI	Q14094	377 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CSHL1	Q14406	222 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	IRF3	Q14653	427 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	PCLAF	Q15004	111 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SMU1	Q2TAY7	513 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR73	Q6P4I2	378 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SPART	Q8N0X7	666 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	POC5	Q8NA72	575 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SPATA20	Q8TB22	786 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		2.93	□□□□□ -1.94

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